FuNGI

A0A1Y1Y046

Protein Details

Accession

A0A1Y1Y046

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
184-203	QPVHRSQFKRTVKKNVEVSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MQHIRSKCVEEGEEDLLQLQEDFLFGAHPPAATVKRVSKPPSIGSSKVKQEAIEPVEEEELSDSDLPPPLIEKESKAPLPRERPSDLVVEPESQQAAIKPDRIALDSSNLPPPVKNPAEQTKKKSLFASRLNRSSPSSSASLQPPSVKNNFSFGVGLLGEVKEKESTTFEKVNATPAFPTGFPQPVHRSQFKRTVKKNVEVSRNPIEPEISNVLFRQIHEENVDTLSKMTEDEILEAQAELMRQLDPELIKKLRNRQPLSQREVDPINESAVKEKADPLAAEKEHQTSLPDEMDIVQMKEKYFPNVQAEPEKLKWMLDEATLSSTTAPSTTKVDHPANKVRFDFRGNQLEENENIPTYMGLHHHGDEPDRPGYTLGELLHLMRSAVSSQRIISLNILGKIIGNLKDGQFGSDIQKLVLDYLMKESAAVYIRAAIDDVNETAMIAALNTMSVWIGNVTEETIWDDVILLPKGTIFVPRTDSPSIATPRKNRLGFDVDEDGEDNDAENENTIQGHAKLASKDIIKGLLAMNLLPRLRYLLDYSRLPQPSISQIFRILIQISQHSVESSRAVFDCPDMVDCIRGYISRQWPPSPTNTNERYNQLPNALAVKLMRIWAQSNRSIAKELIDKELVNSLLRFMAVDPDILPKEDQVLGYQLQLETLKLWNILSTYGFYCHILGDFHQEFVKYVSSISQLQPWSQTDIISRLRSKKVVLFFRLLENLTYAAVDTHSTEPEHAVCWPHISLFSSYAVLIFTQVSQALDDQSSFKGDRTLCELTISSIGQYLSGWLRYVDNNNATDLPQALELRNQLKLDSWITSKTLETSITRITSLIGEISKVDKTKESHGIPGLYLTSRMKTAELMFELSAACNYVSAYLDLVAKMKKFVSDFYELGQALLTSPSLLSLVDYLCINFQPETEWMSQIARGHYLAIYSWVNLFNKICDTCKPKEEVPNGLDPAFVSYYAATIVLATRPLAGEEAIAESMIFTALRPRNIHKLLRDIDDPALSLPDDLREILEPFLNSHLGKEEDIGQSRAVSYHLLKQTRSLFFKRAPQLNRASFSQWALSPIDDVVKITKETEEVEEICGFSVFDIITNTLKYAKLVNHVAARSGFNNRVNCLTGVRKIMKVFGINYRVNGEDLFLMDSVEAALNSLYNYYVEEFVKLGDKTAFDLEEANDSNVPFYQFYQDFINLYVSVSFGNQVFARMVLPPLAMTYPSEYRLALWSEYFEMLSTFRNSIEDTPAPNGLSVYFYPIERNFTLLQLYAKALLMRKVTRKHTPFLYWIAVHHLNRNMLARIRNMANDESSEPLLAMMHNLIKSKLDHETCTDLTHYHNSEETFRSPDTYEPSPDSQSIQLWLSKGQHP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.2
4	0.19
5	0.16
6	0.11
7	0.06
8	0.06
9	0.06
10	0.05
11	0.06
12	0.06
13	0.09
14	0.09
15	0.09
16	0.1
17	0.16
18	0.18
19	0.2
20	0.26
21	0.31
22	0.37
23	0.45
24	0.5
25	0.52
26	0.55
27	0.59
28	0.62
29	0.6
30	0.6
31	0.6
32	0.63
33	0.63
34	0.64
35	0.59
36	0.5
37	0.47
38	0.5
39	0.46
40	0.41
41	0.33
42	0.29
43	0.29
44	0.28
45	0.25
46	0.18
47	0.15
48	0.14
49	0.14
50	0.12
51	0.12
52	0.15
53	0.15
54	0.13
55	0.15
56	0.16
57	0.19
58	0.2
59	0.23
60	0.27
61	0.34
62	0.38
63	0.42
64	0.47
65	0.52
66	0.59
67	0.62
68	0.62
69	0.6
70	0.58
71	0.54
72	0.53
73	0.44
74	0.4
75	0.35
76	0.31
77	0.28
78	0.27
79	0.25
80	0.2
81	0.2
82	0.17
83	0.21
84	0.22
85	0.24
86	0.22
87	0.25
88	0.27
89	0.28
90	0.28
91	0.24
92	0.26
93	0.26
94	0.28
95	0.31
96	0.31
97	0.3
98	0.28
99	0.28
100	0.33
101	0.32
102	0.32
103	0.34
104	0.42
105	0.53
106	0.6
107	0.66
108	0.67
109	0.69
110	0.69
111	0.68
112	0.66
113	0.64
114	0.67
115	0.7
116	0.68
117	0.7
118	0.69
119	0.66
120	0.62
121	0.57
122	0.49
123	0.43
124	0.37
125	0.32
126	0.34
127	0.35
128	0.35
129	0.33
130	0.37
131	0.36
132	0.39
133	0.43
134	0.4
135	0.37
136	0.38
137	0.36
138	0.31
139	0.29
140	0.22
141	0.21
142	0.17
143	0.16
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.12
148	0.13
149	0.11
150	0.11
151	0.13
152	0.15
153	0.19
154	0.24
155	0.28
156	0.28
157	0.33
158	0.33
159	0.39
160	0.36
161	0.33
162	0.28
163	0.25
164	0.27
165	0.21
166	0.23
167	0.19
168	0.23
169	0.22
170	0.28
171	0.33
172	0.4
173	0.47
174	0.52
175	0.53
176	0.55
177	0.65
178	0.68
179	0.72
180	0.71
181	0.75
182	0.75
183	0.78
184	0.81
185	0.79
186	0.8
187	0.74
188	0.73
189	0.69
190	0.64
191	0.57
192	0.48
193	0.42
194	0.32
195	0.32
196	0.31
197	0.25
198	0.23
199	0.22
200	0.26
201	0.25
202	0.24
203	0.26
204	0.21
205	0.22
206	0.23
207	0.25
208	0.21
209	0.23
210	0.23
211	0.17
212	0.16
213	0.14
214	0.12
215	0.11
216	0.1
217	0.11
218	0.11
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.09
226	0.09
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.11
233	0.11
234	0.14
235	0.21
236	0.22
237	0.27
238	0.33
239	0.43
240	0.48
241	0.57
242	0.59
243	0.62
244	0.7
245	0.75
246	0.77
247	0.74
248	0.67
249	0.62
250	0.59
251	0.51
252	0.44
253	0.35
254	0.3
255	0.25
256	0.23
257	0.22
258	0.21
259	0.2
260	0.18
261	0.19
262	0.18
263	0.18
264	0.18
265	0.19
266	0.25
267	0.24
268	0.25
269	0.25
270	0.26
271	0.24
272	0.24
273	0.22
274	0.16
275	0.19
276	0.17
277	0.15
278	0.13
279	0.13
280	0.16
281	0.15
282	0.15
283	0.15
284	0.16
285	0.16
286	0.21
287	0.21
288	0.23
289	0.25
290	0.29
291	0.33
292	0.34
293	0.37
294	0.37
295	0.4
296	0.4
297	0.38
298	0.37
299	0.3
300	0.27
301	0.24
302	0.21
303	0.19
304	0.15
305	0.15
306	0.12
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.12
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.09
316	0.12
317	0.14
318	0.17
319	0.24
320	0.3
321	0.35
322	0.41
323	0.5
324	0.51
325	0.54
326	0.52
327	0.49
328	0.46
329	0.45
330	0.44
331	0.41
332	0.46
333	0.43
334	0.44
335	0.43
336	0.42
337	0.39
338	0.34
339	0.27
340	0.18
341	0.16
342	0.13
343	0.11
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.13
349	0.14
350	0.17
351	0.17
352	0.19
353	0.2
354	0.22
355	0.22
356	0.2
357	0.2
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.16
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.12
367	0.11
368	0.1
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.1
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.17
377	0.18
378	0.18
379	0.18
380	0.2
381	0.2
382	0.2
383	0.2
384	0.15
385	0.14
386	0.15
387	0.17
388	0.14
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.18
393	0.18
394	0.18
395	0.15
396	0.15
397	0.18
398	0.2
399	0.2
400	0.15
401	0.16
402	0.15
403	0.14
404	0.14
405	0.11
406	0.08
407	0.11
408	0.11
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.09
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.06
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.1
453	0.1
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.12
460	0.1
461	0.12
462	0.17
463	0.19
464	0.23
465	0.24
466	0.24
467	0.21
468	0.26
469	0.3
470	0.3
471	0.35
472	0.36
473	0.43
474	0.5
475	0.5
476	0.44
477	0.44
478	0.44
479	0.39
480	0.38
481	0.34
482	0.26
483	0.25
484	0.25
485	0.2
486	0.15
487	0.13
488	0.09
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.08
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.15
508	0.15
509	0.12
510	0.13
511	0.12
512	0.11
513	0.1
514	0.09
515	0.09
516	0.11
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.13
524	0.15
525	0.19
526	0.21
527	0.23
528	0.28
529	0.28
530	0.28
531	0.25
532	0.21
533	0.25
534	0.28
535	0.27
536	0.21
537	0.21
538	0.22
539	0.22
540	0.21
541	0.15
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.08
568	0.09
569	0.15
570	0.21
571	0.25
572	0.27
573	0.28
574	0.31
575	0.33
576	0.37
577	0.37
578	0.34
579	0.37
580	0.4
581	0.42
582	0.42
583	0.43
584	0.41
585	0.37
586	0.35
587	0.28
588	0.23
589	0.2
590	0.19
591	0.16
592	0.13
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.08
599	0.1
600	0.13
601	0.17
602	0.19
603	0.22
604	0.22
605	0.23
606	0.23
607	0.22
608	0.2
609	0.2
610	0.19
611	0.19
612	0.19
613	0.18
614	0.16
615	0.19
616	0.17
617	0.13
618	0.11
619	0.09
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.05
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.08
633	0.09
634	0.1
635	0.1
636	0.08
637	0.09
638	0.09
639	0.1
640	0.1
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.06
649	0.07
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.06
654	0.07
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.07
663	0.07
664	0.12
665	0.12
666	0.12
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.13
671	0.14
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.09
676	0.11
677	0.11
678	0.14
679	0.14
680	0.14
681	0.17
682	0.16
683	0.17
684	0.16
685	0.16
686	0.12
687	0.16
688	0.19
689	0.2
690	0.22
691	0.24
692	0.26
693	0.27
694	0.27
695	0.27
696	0.31
697	0.33
698	0.33
699	0.32
700	0.3
701	0.31
702	0.32
703	0.27
704	0.2
705	0.15
706	0.12
707	0.1
708	0.09
709	0.07
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.07
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.09
719	0.09
720	0.09
721	0.08
722	0.09
723	0.08
724	0.09
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.1
733	0.1
734	0.1
735	0.09
736	0.07
737	0.07
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.07
749	0.07
750	0.09
751	0.09
752	0.09
753	0.13
754	0.13
755	0.14
756	0.19
757	0.2
758	0.18
759	0.19
760	0.19
761	0.15
762	0.17
763	0.16
764	0.1
765	0.09
766	0.09
767	0.08
768	0.08
769	0.08
770	0.07
771	0.08
772	0.08
773	0.07
774	0.08
775	0.1
776	0.12
777	0.15
778	0.17
779	0.17
780	0.18
781	0.18
782	0.17
783	0.16
784	0.14
785	0.11
786	0.09
787	0.1
788	0.09
789	0.1
790	0.13
791	0.14
792	0.16
793	0.15
794	0.13
795	0.14
796	0.16
797	0.16
798	0.15
799	0.15
800	0.14
801	0.15
802	0.15
803	0.14
804	0.13
805	0.13
806	0.13
807	0.12
808	0.13
809	0.15
810	0.15
811	0.15
812	0.13
813	0.13
814	0.11
815	0.11
816	0.1
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.09
821	0.1
822	0.1
823	0.11
824	0.13
825	0.15
826	0.2
827	0.27
828	0.27
829	0.29
830	0.31
831	0.31
832	0.27
833	0.26
834	0.22
835	0.14
836	0.15
837	0.12
838	0.1
839	0.1
840	0.11
841	0.1
842	0.11
843	0.12
844	0.13
845	0.13
846	0.14
847	0.13
848	0.13
849	0.12
850	0.11
851	0.1
852	0.07
853	0.06
854	0.05
855	0.05
856	0.05
857	0.06
858	0.06
859	0.06
860	0.07
861	0.07
862	0.07
863	0.09
864	0.1
865	0.1
866	0.11
867	0.11
868	0.12
869	0.12
870	0.14
871	0.17
872	0.2
873	0.21
874	0.21
875	0.25
876	0.23
877	0.22
878	0.2
879	0.15
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.05
890	0.05
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.07
896	0.08
897	0.07
898	0.07
899	0.08
900	0.09
901	0.13
902	0.13
903	0.14
904	0.13
905	0.14
906	0.16
907	0.16
908	0.16
909	0.14
910	0.13
911	0.13
912	0.12
913	0.12
914	0.1
915	0.11
916	0.1
917	0.09
918	0.11
919	0.13
920	0.13
921	0.15
922	0.15
923	0.13
924	0.17
925	0.18
926	0.18
927	0.21
928	0.27
929	0.28
930	0.33
931	0.36
932	0.36
933	0.44
934	0.46
935	0.47
936	0.43
937	0.46
938	0.43
939	0.39
940	0.35
941	0.26
942	0.25
943	0.18
944	0.15
945	0.09
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.08
950	0.05
951	0.05
952	0.05
953	0.05
954	0.06
955	0.06
956	0.06
957	0.06
958	0.07
959	0.07
960	0.06
961	0.06
962	0.06
963	0.07
964	0.07
965	0.06
966	0.06
967	0.05
968	0.05
969	0.05
970	0.05
971	0.03
972	0.12
973	0.15
974	0.19
975	0.22
976	0.25
977	0.34
978	0.4
979	0.45
980	0.4
981	0.46
982	0.46
983	0.47
984	0.45
985	0.38
986	0.35
987	0.3
988	0.27
989	0.19
990	0.16
991	0.12
992	0.11
993	0.08
994	0.08
995	0.08
996	0.08
997	0.08
998	0.09
999	0.1
1000	0.1
1001	0.12
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.13
1005	0.15
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.15
1009	0.14
1010	0.14
1011	0.15
1012	0.18
1013	0.19
1014	0.22
1015	0.23
1016	0.2
1017	0.19
1018	0.19
1019	0.18
1020	0.14
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.18
1024	0.25
1025	0.27
1026	0.27
1027	0.32
1028	0.39
1029	0.43
1030	0.47
1031	0.43
1032	0.42
1033	0.44
1034	0.53
1035	0.55
1036	0.56
1037	0.53
1038	0.54
1039	0.6
1040	0.6
1041	0.59
1042	0.52
1043	0.47
1044	0.41
1045	0.38
1046	0.34
1047	0.25
1048	0.22
1049	0.2
1050	0.18
1051	0.15
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.12
1055	0.12
1056	0.11
1057	0.12
1058	0.12
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.12
1062	0.14
1063	0.16
1064	0.17
1065	0.16
1066	0.18
1067	0.18
1068	0.17
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.12
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.06
1075	0.06
1076	0.07
1077	0.09
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.11
1081	0.12
1082	0.12
1083	0.12
1084	0.15
1085	0.16
1086	0.21
1087	0.24
1088	0.27
1089	0.31
1090	0.31
1091	0.32
1092	0.3
1093	0.3
1094	0.26
1095	0.29
1096	0.31
1097	0.31
1098	0.33
1099	0.33
1100	0.34
1101	0.34
1102	0.32
1103	0.31
1104	0.3
1105	0.28
1106	0.33
1107	0.34
1108	0.34
1109	0.33
1110	0.35
1111	0.34
1112	0.33
1113	0.31
1114	0.32
1115	0.36
1116	0.34
1117	0.35
1118	0.34
1119	0.32
1120	0.29
1121	0.26
1122	0.19
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.12
1126	0.1
1127	0.09
1128	0.08
1129	0.08
1130	0.07
1131	0.07
1132	0.06
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.05
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.05
1140	0.07
1141	0.08
1142	0.11
1143	0.11
1144	0.12
1145	0.12
1146	0.12
1147	0.17
1148	0.16
1149	0.16
1150	0.15
1151	0.15
1152	0.17
1153	0.19
1154	0.18
1155	0.14
1156	0.16
1157	0.15
1158	0.18
1159	0.19
1160	0.18
1161	0.17
1162	0.17
1163	0.17
1164	0.17
1165	0.18
1166	0.13
1167	0.13
1168	0.19
1169	0.18
1170	0.2
1171	0.23
1172	0.23
1173	0.22
1174	0.23
1175	0.24
1176	0.17
1177	0.17
1178	0.16
1179	0.12
1180	0.11
1181	0.1
1182	0.1
1183	0.08
1184	0.11
1185	0.1
1186	0.11
1187	0.12
1188	0.12
1189	0.12
1190	0.12
1191	0.13
1192	0.11
1193	0.11
1194	0.1
1195	0.11
1196	0.11
1197	0.11
1198	0.11
1199	0.15
1200	0.17
1201	0.18
1202	0.19
1203	0.18
1204	0.18
1205	0.22
1206	0.23
1207	0.19
1208	0.17
1209	0.17
1210	0.19
1211	0.19
1212	0.18
1213	0.14
1214	0.12
1215	0.12
1216	0.15
1217	0.16
1218	0.14
1219	0.14
1220	0.15
1221	0.17
1222	0.18
1223	0.24
1224	0.24
1225	0.24
1226	0.26
1227	0.28
1228	0.27
1229	0.26
1230	0.24
1231	0.17
1232	0.18
1233	0.15
1234	0.17
1235	0.17
1236	0.17
1237	0.21
1238	0.22
1239	0.28
1240	0.25
1241	0.28
1242	0.24
1243	0.24
1244	0.25
1245	0.22
1246	0.22
1247	0.18
1248	0.19
1249	0.17
1250	0.17
1251	0.19
1252	0.19
1253	0.22
1254	0.27
1255	0.31
1256	0.38
1257	0.45
1258	0.51
1259	0.59
1260	0.61
1261	0.63
1262	0.64
1263	0.63
1264	0.6
1265	0.58
1266	0.57
1267	0.47
1268	0.43
1269	0.45
1270	0.45
1271	0.41
1272	0.42
1273	0.41
1274	0.37
1275	0.39
1276	0.42
1277	0.38
1278	0.36
1279	0.38
1280	0.35
1281	0.36
1282	0.37
1283	0.37
1284	0.37
1285	0.35
1286	0.32
1287	0.31
1288	0.3
1289	0.28
1290	0.26
1291	0.23
1292	0.19
1293	0.16
1294	0.15
1295	0.12
1296	0.11
1297	0.1
1298	0.13
1299	0.15
1300	0.17
1301	0.17
1302	0.19
1303	0.21
1304	0.23
1305	0.29
1306	0.29
1307	0.3
1308	0.33
1309	0.39
1310	0.37
1311	0.39
1312	0.36
1313	0.28
1314	0.3
1315	0.35
1316	0.32
1317	0.28
1318	0.3
1319	0.3
1320	0.33
1321	0.37
1322	0.35
1323	0.32
1324	0.3
1325	0.31
1326	0.29
1327	0.31
1328	0.33
1329	0.32
1330	0.34
1331	0.35
1332	0.38
1333	0.39
1334	0.39
1335	0.38
1336	0.34
1337	0.32
1338	0.3
1339	0.27
1340	0.26
1341	0.23
1342	0.27

A0A1Y1Y046

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer