Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YKF1

Protein Details
Accession A0A1Y1YKF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-53LSPTKPKSIKTSPRRPPTNEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-123KSEGRKRGA
131-136HAPAKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, cyto 10, nucl 9, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR002999  Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
Amino Acid Sequences MNAEELASYQCQLDQVKLALQSDPKTFLQQQNLSPTKPKSIKTSPRRPPTNEVFTTASSEHTWKVGDSCLVRWPVDGKFYEGVIVAISPSGDFTVTYKGYGNTESVTIDDLKPPKSEGRKRGAESVFGTKHAPAKKANPLPKNVALKQKQQNWLNFVNKKTKTPAVNKKSIFASPVSVEGKVGVTRSGKPMTQFAAQHRHVFKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.19
4 0.21
5 0.21
6 0.21
7 0.24
8 0.26
9 0.25
10 0.29
11 0.26
12 0.3
13 0.35
14 0.37
15 0.43
16 0.44
17 0.46
18 0.51
19 0.54
20 0.5
21 0.51
22 0.47
23 0.48
24 0.48
25 0.47
26 0.45
27 0.52
28 0.61
29 0.65
30 0.74
31 0.74
32 0.8
33 0.84
34 0.81
35 0.79
36 0.77
37 0.76
38 0.66
39 0.61
40 0.53
41 0.46
42 0.44
43 0.36
44 0.29
45 0.21
46 0.21
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.17
57 0.19
58 0.19
59 0.18
60 0.19
61 0.17
62 0.2
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.09
71 0.08
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.15
101 0.19
102 0.27
103 0.34
104 0.38
105 0.45
106 0.5
107 0.52
108 0.58
109 0.54
110 0.48
111 0.44
112 0.44
113 0.36
114 0.31
115 0.3
116 0.23
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.23
121 0.28
122 0.36
123 0.44
124 0.51
125 0.5
126 0.52
127 0.55
128 0.59
129 0.61
130 0.56
131 0.58
132 0.54
133 0.59
134 0.63
135 0.64
136 0.66
137 0.64
138 0.65
139 0.6
140 0.63
141 0.63
142 0.6
143 0.56
144 0.57
145 0.53
146 0.52
147 0.52
148 0.51
149 0.5
150 0.56
151 0.62
152 0.61
153 0.68
154 0.65
155 0.64
156 0.61
157 0.54
158 0.46
159 0.36
160 0.31
161 0.23
162 0.28
163 0.26
164 0.22
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.24
174 0.27
175 0.27
176 0.28
177 0.32
178 0.32
179 0.35
180 0.37
181 0.39
182 0.45
183 0.46
184 0.52