Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XSM1

Protein Details
Accession A0A1Y1XSM1    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-116GSRVTKKSPNRPKSASRTFKSHydrophilic
146-166PKVEKAKPRVKARKVTKPPTSBasic
232-255PVSRLPKRRVTKKATTQPKKAKDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-171EKAKPRVKARKVTKPPTSHVERK
238-244KRRVTKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028386  CENP-C/Mif2/cnp3  
IPR025974  Mif2/CENP-C_cupin  
IPR028929  Mif2_N  
IPR014710  RmlC-like_jellyroll  
IPR011051  RmlC_Cupin_sf  
Gene Ontology GO:0000776  C:kinetochore  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0019237  F:centromeric DNA binding  
GO:0051382  P:kinetochore assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF11699  CENP-C_C  
PF15624  Mif2_N  
CDD cd06993  cupin_CENP-C_C  
Amino Acid Sequences MEGGRVREKKAVRTNRYTNIGITGRKTGVTIKSHIHQDEDGFDNVDDFFQSSASENESEEEEFANGDSRVTPDSPIPQDNHATEYEDSFVFSNASGSRVTKKSPNRPKSASRTFKSPDLSPEFPGVTDELPEYEETEPAYPEYEEPKVEKAKPRVKARKVTKPPTSHVERKARYARESDDDSNVRRSHRTRVKPVEFWKNERVVYELEKEGTNVVPVIREVVKAQENPSFNPVSRLPKRRVTKKATTQPKKAKDVAQDEPVLPIKVLEWGSNSETEKLLAVTQKEINPTQAKNQTYGFQKFFSEGEFMSSGVIEIYEGGSKPNRNSGDNSMVFYVISGACRVTIHNTTFDISTGGQFLIPRGNQYQIENIAPVELRLFFAQAREVVITSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.77
3 0.8
4 0.72
5 0.62
6 0.59
7 0.56
8 0.49
9 0.44
10 0.4
11 0.35
12 0.33
13 0.33
14 0.31
15 0.33
16 0.33
17 0.34
18 0.33
19 0.38
20 0.45
21 0.45
22 0.42
23 0.37
24 0.34
25 0.35
26 0.33
27 0.29
28 0.23
29 0.22
30 0.19
31 0.18
32 0.16
33 0.12
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.21
61 0.24
62 0.28
63 0.28
64 0.29
65 0.33
66 0.32
67 0.33
68 0.27
69 0.27
70 0.23
71 0.22
72 0.21
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.13
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.28
88 0.37
89 0.47
90 0.57
91 0.64
92 0.66
93 0.71
94 0.77
95 0.8
96 0.81
97 0.8
98 0.72
99 0.71
100 0.66
101 0.65
102 0.59
103 0.51
104 0.48
105 0.46
106 0.45
107 0.38
108 0.37
109 0.32
110 0.28
111 0.27
112 0.2
113 0.13
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.08
128 0.09
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.18
134 0.22
135 0.25
136 0.32
137 0.38
138 0.44
139 0.51
140 0.61
141 0.67
142 0.69
143 0.76
144 0.77
145 0.78
146 0.81
147 0.82
148 0.79
149 0.74
150 0.71
151 0.68
152 0.67
153 0.63
154 0.62
155 0.63
156 0.56
157 0.59
158 0.63
159 0.58
160 0.53
161 0.49
162 0.43
163 0.38
164 0.42
165 0.36
166 0.33
167 0.32
168 0.31
169 0.33
170 0.32
171 0.28
172 0.27
173 0.27
174 0.32
175 0.39
176 0.45
177 0.49
178 0.58
179 0.62
180 0.64
181 0.68
182 0.69
183 0.62
184 0.6
185 0.56
186 0.5
187 0.45
188 0.39
189 0.35
190 0.26
191 0.25
192 0.23
193 0.18
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.09
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.14
210 0.15
211 0.17
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.24
216 0.22
217 0.19
218 0.22
219 0.24
220 0.28
221 0.35
222 0.41
223 0.42
224 0.5
225 0.58
226 0.64
227 0.7
228 0.69
229 0.71
230 0.74
231 0.79
232 0.82
233 0.82
234 0.83
235 0.83
236 0.83
237 0.79
238 0.73
239 0.68
240 0.65
241 0.64
242 0.58
243 0.53
244 0.47
245 0.4
246 0.39
247 0.35
248 0.27
249 0.2
250 0.16
251 0.11
252 0.14
253 0.14
254 0.12
255 0.12
256 0.14
257 0.16
258 0.19
259 0.2
260 0.17
261 0.17
262 0.16
263 0.15
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.15
269 0.18
270 0.2
271 0.23
272 0.23
273 0.27
274 0.29
275 0.29
276 0.34
277 0.38
278 0.37
279 0.36
280 0.37
281 0.37
282 0.39
283 0.44
284 0.38
285 0.32
286 0.32
287 0.31
288 0.29
289 0.26
290 0.2
291 0.14
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.08
299 0.08
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.09
306 0.13
307 0.16
308 0.18
309 0.26
310 0.28
311 0.29
312 0.34
313 0.38
314 0.44
315 0.42
316 0.43
317 0.36
318 0.33
319 0.3
320 0.25
321 0.21
322 0.12
323 0.12
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.15
330 0.2
331 0.21
332 0.24
333 0.25
334 0.26
335 0.26
336 0.25
337 0.22
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.18
346 0.18
347 0.21
348 0.22
349 0.26
350 0.27
351 0.29
352 0.34
353 0.3
354 0.32
355 0.29
356 0.26
357 0.24
358 0.21
359 0.19
360 0.15
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.14
365 0.13
366 0.14
367 0.17
368 0.16
369 0.18
370 0.17