Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XH42

Protein Details
Accession A0A1Y1XH42    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-153DIYLPFKPKRKGTKSKLASEAGHydrophilic
235-256KSETNKKPKPSGKKSSKAGEKQBasic
486-505FDDRQSSKKRPEKPTKVVVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-145PKRKGTK
230-260KPGIVKSETNKKPKPSGKKSSKAGEKQAEAK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041692  HHH_9  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
IPR044146  S1_Tex  
IPR023323  Tex-like_dom_sf  
IPR023319  Tex-like_HTH_dom_sf  
IPR018974  Tex-like_N  
IPR032639  Tex_YqgF  
IPR006641  YqgF/RNaseH-like_dom  
IPR037027  YqgF/RNaseH-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF12836  HHH_3  
PF17674  HHH_9  
PF00575  S1  
PF09371  Tex_N  
PF16921  Tex_YqgF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05685  S1_Tex  
Amino Acid Sequences MASKNKRKKEEYPDSDSESSTESNSPKVTKLPAATLEVLAGEFRATTGQIKTVLRLLKQEEMTVPFIARYRKELTGNLTDVQLRTLEERLEYMLELESRKLAIVKTLKKEGNLSAEMKKRIENTFKKIDLEDIYLPFKPKRKGTKSKLASEAGLEPLARKLLSIHPKTRALALTIAKDFLRENRLDSKVTQEASEYRKDHQLALEGSIALIIDIIAEDPGLTRRDPREFKPGIVKSETNKKPKPSGKKSSKAGEKQAEAKRGADLYRDYFYREESIRRIASHQLMAILRGQNEGFLTCQLATRTRGPTKTSAKRKFEELGRQKHSDDMVAIKNAEEYPKRIMRHLQIHYDRHFMKDIVNQTWSTKMAKRIETEIMKELKAQAEEKAIQVFASNLRDILLSPPAGRKPTIGLDPGFRTGVKVAVIDDTGALLHHSVIYPHPPQAKWDEAREALRRLCVEYDVGLIAIGNGTASRETSLLVQELLDSFDDRQSSKKRPEKPTKVVVSEAGASVYSASPLAVKEFPDLDVTIRGAISIGRRLQDPLAELVKIDPKSLGVGQYQHDINPGKLGKSLTCTVEDCVNLVGVILNTASAELLTYVSGLGEKVATEIVKYRDTHGPFSNRKELLEVPRLGKKTFQQCAGFLRIPPNPQSPNEAQREPLDSTGIHPEAYHIARKILKKLKVKDIESIKPSMLRSLDPNEFVDPDSDSGVITVQDIIAELEKPGRDPRSAFVVAEMNPDVRDIHDLKGGMTLEGTVSNVTQFGAFVDIGIHENGLIHTSHMNNHSLRTGQVCEVRVENIDPARKRIDGCVTQMPIAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.71
3 0.62
4 0.52
5 0.43
6 0.36
7 0.29
8 0.28
9 0.21
10 0.23
11 0.26
12 0.27
13 0.27
14 0.3
15 0.32
16 0.33
17 0.35
18 0.37
19 0.37
20 0.4
21 0.39
22 0.35
23 0.31
24 0.25
25 0.22
26 0.17
27 0.13
28 0.08
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.1
34 0.12
35 0.15
36 0.2
37 0.21
38 0.23
39 0.28
40 0.31
41 0.3
42 0.34
43 0.35
44 0.37
45 0.37
46 0.38
47 0.36
48 0.36
49 0.37
50 0.32
51 0.28
52 0.22
53 0.25
54 0.28
55 0.26
56 0.27
57 0.29
58 0.34
59 0.37
60 0.39
61 0.42
62 0.44
63 0.46
64 0.41
65 0.38
66 0.36
67 0.32
68 0.29
69 0.23
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.12
89 0.18
90 0.26
91 0.33
92 0.39
93 0.47
94 0.49
95 0.49
96 0.52
97 0.49
98 0.47
99 0.43
100 0.41
101 0.4
102 0.45
103 0.47
104 0.45
105 0.44
106 0.41
107 0.44
108 0.51
109 0.51
110 0.51
111 0.57
112 0.58
113 0.57
114 0.53
115 0.5
116 0.43
117 0.4
118 0.35
119 0.29
120 0.3
121 0.29
122 0.31
123 0.31
124 0.35
125 0.37
126 0.42
127 0.5
128 0.58
129 0.67
130 0.73
131 0.8
132 0.81
133 0.83
134 0.82
135 0.73
136 0.63
137 0.55
138 0.48
139 0.39
140 0.32
141 0.24
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.19
149 0.29
150 0.35
151 0.4
152 0.44
153 0.48
154 0.49
155 0.51
156 0.43
157 0.36
158 0.35
159 0.32
160 0.31
161 0.28
162 0.29
163 0.25
164 0.24
165 0.23
166 0.21
167 0.24
168 0.19
169 0.22
170 0.29
171 0.32
172 0.33
173 0.33
174 0.35
175 0.34
176 0.34
177 0.3
178 0.24
179 0.27
180 0.29
181 0.36
182 0.31
183 0.29
184 0.35
185 0.36
186 0.35
187 0.31
188 0.33
189 0.27
190 0.28
191 0.26
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.08
197 0.07
198 0.04
199 0.02
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.13
210 0.17
211 0.26
212 0.3
213 0.33
214 0.41
215 0.41
216 0.44
217 0.5
218 0.5
219 0.46
220 0.47
221 0.46
222 0.39
223 0.49
224 0.54
225 0.53
226 0.54
227 0.54
228 0.59
229 0.65
230 0.72
231 0.71
232 0.74
233 0.76
234 0.79
235 0.81
236 0.81
237 0.82
238 0.77
239 0.76
240 0.71
241 0.64
242 0.64
243 0.64
244 0.6
245 0.52
246 0.46
247 0.39
248 0.34
249 0.31
250 0.25
251 0.22
252 0.19
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.26
263 0.25
264 0.25
265 0.26
266 0.27
267 0.28
268 0.26
269 0.23
270 0.21
271 0.2
272 0.2
273 0.21
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.15
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.15
289 0.18
290 0.25
291 0.28
292 0.3
293 0.32
294 0.39
295 0.46
296 0.53
297 0.6
298 0.63
299 0.65
300 0.64
301 0.65
302 0.62
303 0.59
304 0.6
305 0.58
306 0.58
307 0.57
308 0.58
309 0.54
310 0.51
311 0.46
312 0.35
313 0.27
314 0.21
315 0.18
316 0.17
317 0.16
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.16
322 0.13
323 0.13
324 0.18
325 0.23
326 0.24
327 0.24
328 0.29
329 0.32
330 0.4
331 0.41
332 0.45
333 0.46
334 0.5
335 0.51
336 0.52
337 0.46
338 0.39
339 0.37
340 0.28
341 0.24
342 0.24
343 0.26
344 0.22
345 0.23
346 0.21
347 0.21
348 0.22
349 0.21
350 0.19
351 0.18
352 0.23
353 0.26
354 0.29
355 0.3
356 0.31
357 0.36
358 0.35
359 0.34
360 0.32
361 0.29
362 0.26
363 0.25
364 0.23
365 0.19
366 0.18
367 0.16
368 0.12
369 0.14
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.13
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.16
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.14
403 0.13
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.09
424 0.1
425 0.13
426 0.17
427 0.17
428 0.19
429 0.22
430 0.28
431 0.26
432 0.27
433 0.27
434 0.26
435 0.3
436 0.31
437 0.3
438 0.25
439 0.25
440 0.23
441 0.21
442 0.19
443 0.15
444 0.13
445 0.1
446 0.1
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.03
454 0.02
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.14
477 0.19
478 0.26
479 0.35
480 0.42
481 0.5
482 0.6
483 0.71
484 0.75
485 0.77
486 0.8
487 0.76
488 0.71
489 0.63
490 0.53
491 0.44
492 0.34
493 0.27
494 0.17
495 0.11
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.08
520 0.09
521 0.12
522 0.13
523 0.14
524 0.15
525 0.16
526 0.17
527 0.17
528 0.17
529 0.16
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.2
535 0.18
536 0.17
537 0.14
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.12
543 0.14
544 0.15
545 0.19
546 0.19
547 0.17
548 0.21
549 0.2
550 0.18
551 0.22
552 0.22
553 0.18
554 0.21
555 0.22
556 0.18
557 0.22
558 0.25
559 0.2
560 0.21
561 0.22
562 0.2
563 0.22
564 0.21
565 0.17
566 0.15
567 0.13
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.11
596 0.14
597 0.18
598 0.19
599 0.22
600 0.28
601 0.31
602 0.35
603 0.38
604 0.44
605 0.46
606 0.52
607 0.56
608 0.5
609 0.48
610 0.47
611 0.45
612 0.43
613 0.46
614 0.42
615 0.37
616 0.43
617 0.44
618 0.41
619 0.4
620 0.39
621 0.41
622 0.42
623 0.46
624 0.42
625 0.42
626 0.47
627 0.5
628 0.44
629 0.36
630 0.38
631 0.34
632 0.35
633 0.38
634 0.39
635 0.36
636 0.36
637 0.42
638 0.41
639 0.46
640 0.49
641 0.45
642 0.41
643 0.4
644 0.43
645 0.37
646 0.32
647 0.25
648 0.19
649 0.2
650 0.25
651 0.23
652 0.19
653 0.17
654 0.18
655 0.21
656 0.23
657 0.25
658 0.19
659 0.23
660 0.29
661 0.32
662 0.4
663 0.44
664 0.5
665 0.55
666 0.62
667 0.68
668 0.71
669 0.7
670 0.69
671 0.69
672 0.68
673 0.63
674 0.58
675 0.48
676 0.43
677 0.41
678 0.38
679 0.31
680 0.25
681 0.26
682 0.3
683 0.32
684 0.31
685 0.32
686 0.29
687 0.29
688 0.28
689 0.24
690 0.19
691 0.16
692 0.15
693 0.13
694 0.11
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.08
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.11
708 0.11
709 0.13
710 0.19
711 0.22
712 0.24
713 0.25
714 0.28
715 0.32
716 0.34
717 0.32
718 0.29
719 0.3
720 0.28
721 0.3
722 0.28
723 0.21
724 0.19
725 0.2
726 0.17
727 0.14
728 0.19
729 0.16
730 0.17
731 0.2
732 0.21
733 0.2
734 0.25
735 0.24
736 0.19
737 0.17
738 0.15
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.08
743 0.07
744 0.08
745 0.08
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.09
751 0.08
752 0.08
753 0.09
754 0.09
755 0.11
756 0.11
757 0.1
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.08
764 0.12
765 0.13
766 0.18
767 0.21
768 0.26
769 0.25
770 0.27
771 0.29
772 0.27
773 0.28
774 0.27
775 0.27
776 0.28
777 0.32
778 0.32
779 0.31
780 0.31
781 0.32
782 0.29
783 0.28
784 0.28
785 0.29
786 0.35
787 0.35
788 0.38
789 0.4
790 0.4
791 0.4
792 0.42
793 0.45
794 0.42
795 0.46
796 0.5
797 0.49