Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Z113

Protein Details
Accession A0A1Y1Z113    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-272GVNKLIKLANKLKHHKKTRSSQNKAKIHLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-259KHHKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MCAAVAFSSLHFSNDLENNMDFQGFMEPGVFEHQPFQPSYFIPDQIGNRQLRRKNTTETTTDPLLNSSFPFVPIRRQKTEDDIASEIEDALSSHFSSSSSLALELQEKRVIVHRIKDTDTLAGIALLYGVNTDELKRINKIWSDNLHLKKSLYIPLELVNYQEVFLRLKALKATNPRIKPQNSEWTDVSLAIPTKQPVVEIVSVPEAELKFFSVSQNDPQDSRVAPPAEFIQEDLPSFKEIFGVNKLIKLANKLKHHKKTRSSQNKAKIHLELQENLKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.21
4 0.21
5 0.22
6 0.22
7 0.21
8 0.16
9 0.13
10 0.14
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.1
16 0.14
17 0.14
18 0.11
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.21
24 0.2
25 0.2
26 0.26
27 0.26
28 0.24
29 0.23
30 0.27
31 0.28
32 0.31
33 0.39
34 0.36
35 0.39
36 0.46
37 0.5
38 0.54
39 0.58
40 0.57
41 0.58
42 0.61
43 0.6
44 0.57
45 0.56
46 0.53
47 0.49
48 0.45
49 0.37
50 0.31
51 0.26
52 0.22
53 0.17
54 0.15
55 0.13
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.24
60 0.33
61 0.4
62 0.42
63 0.45
64 0.46
65 0.5
66 0.55
67 0.48
68 0.42
69 0.36
70 0.32
71 0.29
72 0.26
73 0.19
74 0.12
75 0.1
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.13
95 0.14
96 0.18
97 0.23
98 0.21
99 0.26
100 0.29
101 0.3
102 0.32
103 0.34
104 0.29
105 0.25
106 0.23
107 0.18
108 0.13
109 0.1
110 0.08
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.05
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.13
126 0.16
127 0.18
128 0.21
129 0.22
130 0.27
131 0.34
132 0.37
133 0.36
134 0.34
135 0.32
136 0.3
137 0.29
138 0.28
139 0.22
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.17
145 0.16
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.15
158 0.19
159 0.25
160 0.35
161 0.39
162 0.42
163 0.47
164 0.52
165 0.52
166 0.53
167 0.52
168 0.53
169 0.48
170 0.5
171 0.45
172 0.4
173 0.39
174 0.34
175 0.27
176 0.19
177 0.16
178 0.13
179 0.14
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.2
203 0.26
204 0.26
205 0.26
206 0.27
207 0.28
208 0.26
209 0.26
210 0.27
211 0.22
212 0.2
213 0.21
214 0.23
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.16
229 0.18
230 0.23
231 0.22
232 0.24
233 0.25
234 0.26
235 0.27
236 0.31
237 0.36
238 0.38
239 0.47
240 0.56
241 0.65
242 0.73
243 0.82
244 0.84
245 0.85
246 0.88
247 0.89
248 0.9
249 0.9
250 0.89
251 0.9
252 0.88
253 0.84
254 0.79
255 0.73
256 0.65
257 0.62
258 0.57
259 0.52