Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1Y7W4

Protein Details
Accession A0A1Y1Y7W4    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-60LEEANTPRKKRERKAVDRYEPGKEKBasic
246-270SEAATTKKRKYTKRGGKKSAPGAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-51RKKRERKAV
252-282KKRKYTKRGGKKSAPGAAQSTPGKRGRKAKS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044198  DEK  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSSKANVKSEPAEDSPSMTQRKTKGSKFSDIPLMSLEEANTPRKKRERKAVDRYEPGKEKTATPEPQKPIVHKGTGTKLSSIPRVASNISSRKNKDYTLYVLHRFLFGRLEGKPNVKEDLEAFNGFAFQNLEEEDVYWNKLEKWTLDTCKNVCEIFDLPFPNNKNDLHSSIMEFLKNPQIQDTVDTQQEESTFQISPFSFFVREKRGELIQNNPDKSLEDIQKELVSLWDSLPNDEKAVYQSRIPSEAATTKKRKYTKRGGKKSAPGAAQSTPGKRGRKAKSAHESLTKSKELVADSDSEEVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.34
6 0.37
7 0.37
8 0.47
9 0.51
10 0.54
11 0.57
12 0.59
13 0.66
14 0.64
15 0.64
16 0.64
17 0.56
18 0.5
19 0.41
20 0.37
21 0.3
22 0.27
23 0.22
24 0.17
25 0.2
26 0.26
27 0.31
28 0.31
29 0.39
30 0.49
31 0.58
32 0.62
33 0.7
34 0.74
35 0.78
36 0.87
37 0.89
38 0.89
39 0.89
40 0.84
41 0.82
42 0.76
43 0.69
44 0.64
45 0.55
46 0.48
47 0.46
48 0.51
49 0.49
50 0.49
51 0.55
52 0.53
53 0.59
54 0.6
55 0.55
56 0.55
57 0.53
58 0.48
59 0.42
60 0.42
61 0.42
62 0.46
63 0.44
64 0.37
65 0.36
66 0.37
67 0.38
68 0.34
69 0.28
70 0.23
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.26
75 0.3
76 0.35
77 0.41
78 0.42
79 0.46
80 0.47
81 0.45
82 0.42
83 0.38
84 0.36
85 0.37
86 0.39
87 0.36
88 0.36
89 0.35
90 0.33
91 0.3
92 0.26
93 0.19
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.18
98 0.19
99 0.22
100 0.24
101 0.24
102 0.25
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.21
107 0.2
108 0.18
109 0.16
110 0.14
111 0.15
112 0.14
113 0.12
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.13
131 0.17
132 0.21
133 0.24
134 0.27
135 0.26
136 0.27
137 0.27
138 0.23
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.19
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.19
151 0.2
152 0.22
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.18
160 0.15
161 0.15
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.19
169 0.21
170 0.16
171 0.17
172 0.18
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.19
189 0.22
190 0.25
191 0.24
192 0.27
193 0.29
194 0.32
195 0.33
196 0.38
197 0.39
198 0.44
199 0.43
200 0.41
201 0.38
202 0.33
203 0.34
204 0.33
205 0.29
206 0.24
207 0.24
208 0.25
209 0.25
210 0.25
211 0.21
212 0.16
213 0.13
214 0.11
215 0.11
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.21
226 0.21
227 0.2
228 0.24
229 0.25
230 0.27
231 0.27
232 0.24
233 0.22
234 0.27
235 0.31
236 0.36
237 0.41
238 0.44
239 0.52
240 0.59
241 0.64
242 0.67
243 0.73
244 0.75
245 0.8
246 0.85
247 0.87
248 0.89
249 0.89
250 0.87
251 0.83
252 0.74
253 0.66
254 0.59
255 0.51
256 0.48
257 0.45
258 0.39
259 0.39
260 0.44
261 0.46
262 0.49
263 0.57
264 0.58
265 0.62
266 0.65
267 0.68
268 0.72
269 0.75
270 0.74
271 0.73
272 0.71
273 0.69
274 0.7
275 0.61
276 0.51
277 0.46
278 0.43
279 0.35
280 0.32
281 0.27
282 0.23
283 0.23