Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XRR3

Protein Details
Accession A0A1Y1XRR3    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
531-608VPGVKKSYVKKLPKSDSKKAANSEEKKLKKRKRKPLLPKNYDPSATPDPERWLPKRERAAYRPKGKKRNLKGASQGSAHydrophilic
638-661APAPAPQTAKPKSKPKKKKKGTKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
539-570VKKLPKSDSKKAANSEEKKLKKRKRKPLLPKN
578-601DPERWLPKRERAAYRPKGKKRNLK
646-661AKPKSKPKKKKKGTKF
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011716  TPR-3  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
PF07720  TPR_3  
Amino Acid Sequences MPDHASITLLFSELQRLLNLVEYEKATKVCNKILKLNPEDRDALHVKIVTLIRLEHYKEALQIFETTKNAEIKALVFERAYCLYRDHQLEEALKLVRQALKESQTQELSLKHLEAQITYRMEEYTTCIEIYHDLLQQVDEQQEEYLDILTNYNAVKGAILMSGMKLDTKYAITDPCQTYELAFNSACVWVAKGDLKKAEALLETARSMCRISLAKEDYTEEEIEQELSSIVIQLAYVYQMQGKIQQATEMYSSVLKTKNADATVIGISANNLVALKKKDDLFESVKKLRTATADNIQPKLFKSQRRIIAINNALLMLYMNKYGACRETVKKLIATYPESDIPHLINASNYLAQKNISKSLEELQAQAEQSSTLAVQFAIIQLHVLQANFSEALSSLESYTGSVKDDALKYRPGLVGLKVWLLEQSGQGEKAAEVLNDACEFWQSVSDEHHPPAAIIKQTANFKLKSNRAEDAALDFEKLVKADPSDYQAIAGLIMSYAECKPSLAEKYESSLPPMGGLTGNIDSDQLETVVPGVKKSYVKKLPKSDSKKAANSEEKKLKKRKRKPLLPKNYDPSATPDPERWLPKRERAAYRPKGKKRNLKGASQGSAVAGGGLGGTGSANIHGAPKTSSTTATPVAAPAPAPQTAKPKSKPKKKKKGTKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.19
6 0.2
7 0.17
8 0.18
9 0.2
10 0.22
11 0.24
12 0.24
13 0.22
14 0.28
15 0.31
16 0.36
17 0.41
18 0.43
19 0.5
20 0.57
21 0.64
22 0.65
23 0.69
24 0.65
25 0.62
26 0.6
27 0.51
28 0.5
29 0.43
30 0.37
31 0.32
32 0.29
33 0.25
34 0.29
35 0.29
36 0.23
37 0.21
38 0.21
39 0.2
40 0.24
41 0.27
42 0.23
43 0.25
44 0.25
45 0.27
46 0.28
47 0.25
48 0.22
49 0.23
50 0.22
51 0.24
52 0.24
53 0.22
54 0.25
55 0.27
56 0.25
57 0.23
58 0.22
59 0.18
60 0.24
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.19
65 0.21
66 0.24
67 0.24
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.28
72 0.31
73 0.3
74 0.29
75 0.33
76 0.34
77 0.31
78 0.32
79 0.27
80 0.24
81 0.22
82 0.23
83 0.21
84 0.2
85 0.23
86 0.25
87 0.29
88 0.33
89 0.35
90 0.37
91 0.35
92 0.35
93 0.34
94 0.29
95 0.29
96 0.25
97 0.24
98 0.2
99 0.21
100 0.2
101 0.18
102 0.2
103 0.22
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.18
118 0.18
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.23
161 0.24
162 0.25
163 0.25
164 0.23
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.19
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.11
175 0.1
176 0.07
177 0.09
178 0.13
179 0.14
180 0.17
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.21
200 0.24
201 0.24
202 0.25
203 0.27
204 0.25
205 0.26
206 0.24
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.11
212 0.09
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.16
235 0.16
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.19
246 0.19
247 0.19
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.08
261 0.1
262 0.11
263 0.14
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.23
268 0.25
269 0.29
270 0.34
271 0.36
272 0.38
273 0.37
274 0.36
275 0.33
276 0.3
277 0.28
278 0.25
279 0.27
280 0.3
281 0.31
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.26
286 0.3
287 0.3
288 0.29
289 0.34
290 0.39
291 0.45
292 0.49
293 0.5
294 0.43
295 0.47
296 0.44
297 0.38
298 0.3
299 0.24
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.07
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.12
313 0.13
314 0.18
315 0.22
316 0.23
317 0.23
318 0.23
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.2
323 0.18
324 0.2
325 0.2
326 0.19
327 0.17
328 0.14
329 0.13
330 0.11
331 0.09
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.14
341 0.14
342 0.18
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.2
347 0.23
348 0.21
349 0.2
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.13
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.12
392 0.14
393 0.16
394 0.17
395 0.19
396 0.18
397 0.22
398 0.22
399 0.2
400 0.19
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.17
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.08
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.13
433 0.18
434 0.2
435 0.2
436 0.21
437 0.18
438 0.17
439 0.2
440 0.19
441 0.16
442 0.15
443 0.16
444 0.19
445 0.23
446 0.28
447 0.29
448 0.26
449 0.3
450 0.37
451 0.41
452 0.43
453 0.43
454 0.41
455 0.39
456 0.39
457 0.35
458 0.29
459 0.27
460 0.21
461 0.18
462 0.15
463 0.14
464 0.13
465 0.13
466 0.1
467 0.08
468 0.08
469 0.1
470 0.11
471 0.15
472 0.17
473 0.17
474 0.16
475 0.16
476 0.15
477 0.13
478 0.11
479 0.07
480 0.04
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.08
489 0.13
490 0.17
491 0.19
492 0.22
493 0.22
494 0.26
495 0.32
496 0.32
497 0.31
498 0.29
499 0.25
500 0.23
501 0.22
502 0.18
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.1
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.07
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.16
522 0.22
523 0.26
524 0.36
525 0.41
526 0.5
527 0.59
528 0.67
529 0.73
530 0.79
531 0.84
532 0.83
533 0.83
534 0.82
535 0.8
536 0.76
537 0.75
538 0.75
539 0.71
540 0.72
541 0.72
542 0.72
543 0.75
544 0.8
545 0.81
546 0.82
547 0.87
548 0.88
549 0.9
550 0.92
551 0.94
552 0.94
553 0.96
554 0.94
555 0.93
556 0.89
557 0.83
558 0.74
559 0.63
560 0.6
561 0.56
562 0.5
563 0.42
564 0.38
565 0.38
566 0.44
567 0.5
568 0.46
569 0.47
570 0.5
571 0.58
572 0.65
573 0.68
574 0.71
575 0.72
576 0.79
577 0.8
578 0.84
579 0.86
580 0.86
581 0.88
582 0.88
583 0.9
584 0.89
585 0.9
586 0.85
587 0.82
588 0.82
589 0.8
590 0.74
591 0.65
592 0.55
593 0.44
594 0.39
595 0.3
596 0.2
597 0.11
598 0.07
599 0.05
600 0.04
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.08
610 0.09
611 0.11
612 0.12
613 0.14
614 0.18
615 0.19
616 0.21
617 0.21
618 0.25
619 0.26
620 0.26
621 0.24
622 0.21
623 0.21
624 0.2
625 0.18
626 0.17
627 0.18
628 0.2
629 0.22
630 0.24
631 0.33
632 0.4
633 0.49
634 0.54
635 0.62
636 0.69
637 0.78
638 0.86
639 0.87
640 0.91
641 0.93