FuNGI

A0A1Y1Y9M4

Protein Details

Accession

A0A1Y1Y9M4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-110	DTLDWVKKSRQREKELAKKRMQEL	Hydrophilic
267-293	EEVEVTFKKPKKKKKKSSRRKADLGFL	Basic
498-531	SSSRRERSPSRSRDRYSRDRSRSRDRRRDVDDEW	Basic
569-590	KSSGKLKVEKRMKKMEEAKKTL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
274-287	KKPKKKKKKSSRRK
501-524	RRERSPSRSRDRYSRDRSRSRDRR
567-584	HGKSSGKLKVEKRMKKME

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MDEDRSGGESSLSFEETNKLRISLGLKPLEPGKGSTKDRAAEENYTKYQEEQAAKSATQEVKARIEKRKLNEKLSGQGLGDEADVDDTLDWVKKSRQREKELAKKRMQELNNLDAELEQSAKVKYSGDSLSGMKVAHNLGDFESGEVILTLKDSNILEENGDELSNIQLEEQEKLRQNIENKKKRPIYTGYDDEEFQGDIGQKRSILSHYDEEIDGPKKDFFVLNSKGEASLDREREREEVAAKLKSQAVTLSFEKMNEIQDYYTAEEVEVTFKKPKKKKKKSSRRKADLGFLDDSNEKNKQEADMELDSNTPATSTTNRYTNQDEANFVDDEDLQQALARARRLAVKKQKRSIEEVAKAVLETNEAVADDSQGGLIIDDTSEFVKNLGSIPTLPINPTGVQHRERAASPQPISAPQADSMEIDAAVDSTAETPAVKEQSVAIVEEEPLVSSGLAATLALLQQKGIYEGMTEEQKEREKIQRERQRWISEQRTQSSGSSSRRERSPSRSRDRYSRDRSRSRDRRRDVDDEWKRFENYKPDVHLEYSDEFGNPANQKEAFRAQSHKFHGKSSGKLKVEKRMKKMEEAKKTLAML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.22
3	0.23
4	0.27
5	0.25
6	0.23
7	0.21
8	0.25
9	0.28
10	0.29
11	0.35
12	0.36
13	0.35
14	0.37
15	0.4
16	0.4
17	0.37
18	0.33
19	0.33
20	0.36
21	0.4
22	0.45
23	0.47
24	0.47
25	0.49
26	0.52
27	0.49
28	0.49
29	0.5
30	0.51
31	0.48
32	0.48
33	0.46
34	0.41
35	0.41
36	0.39
37	0.39
38	0.34
39	0.37
40	0.37
41	0.36
42	0.36
43	0.39
44	0.33
45	0.33
46	0.35
47	0.33
48	0.38
49	0.46
50	0.51
51	0.53
52	0.6
53	0.63
54	0.66
55	0.73
56	0.72
57	0.7
58	0.72
59	0.67
60	0.65
61	0.62
62	0.56
63	0.45
64	0.38
65	0.32
66	0.24
67	0.2
68	0.13
69	0.1
70	0.08
71	0.07
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.09
77	0.09
78	0.11
79	0.18
80	0.23
81	0.34
82	0.43
83	0.52
84	0.58
85	0.68
86	0.76
87	0.8
88	0.86
89	0.86
90	0.83
91	0.81
92	0.79
93	0.78
94	0.69
95	0.67
96	0.63
97	0.6
98	0.55
99	0.47
100	0.41
101	0.32
102	0.31
103	0.22
104	0.16
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.14
113	0.15
114	0.15
115	0.17
116	0.17
117	0.18
118	0.18
119	0.18
120	0.14
121	0.15
122	0.14
123	0.13
124	0.12
125	0.12
126	0.11
127	0.14
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.04
139	0.07
140	0.07
141	0.09
142	0.11
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.1
148	0.09
149	0.08
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.07
156	0.08
157	0.1
158	0.12
159	0.17
160	0.2
161	0.22
162	0.24
163	0.26
164	0.32
165	0.41
166	0.5
167	0.55
168	0.55
169	0.63
170	0.68
171	0.66
172	0.66
173	0.62
174	0.59
175	0.57
176	0.59
177	0.53
178	0.47
179	0.45
180	0.39
181	0.33
182	0.25
183	0.17
184	0.12
185	0.11
186	0.12
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.13
191	0.14
192	0.14
193	0.15
194	0.17
195	0.18
196	0.18
197	0.19
198	0.19
199	0.19
200	0.21
201	0.2
202	0.17
203	0.16
204	0.15
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.13
209	0.19
210	0.23
211	0.23
212	0.24
213	0.24
214	0.23
215	0.23
216	0.22
217	0.19
218	0.2
219	0.23
220	0.23
221	0.24
222	0.25
223	0.26
224	0.26
225	0.23
226	0.18
227	0.18
228	0.2
229	0.2
230	0.19
231	0.2
232	0.21
233	0.19
234	0.18
235	0.15
236	0.13
237	0.16
238	0.17
239	0.18
240	0.16
241	0.16
242	0.17
243	0.17
244	0.17
245	0.13
246	0.13
247	0.09
248	0.1
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.1
257	0.09
258	0.1
259	0.16
260	0.19
261	0.29
262	0.36
263	0.47
264	0.55
265	0.66
266	0.75
267	0.81
268	0.89
269	0.91
270	0.96
271	0.96
272	0.93
273	0.9
274	0.82
275	0.78
276	0.7
277	0.63
278	0.53
279	0.42
280	0.35
281	0.28
282	0.25
283	0.2
284	0.18
285	0.14
286	0.12
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.14
292	0.14
293	0.14
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.07
303	0.11
304	0.14
305	0.19
306	0.2
307	0.22
308	0.25
309	0.27
310	0.29
311	0.25
312	0.24
313	0.21
314	0.22
315	0.2
316	0.17
317	0.14
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.08
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.17
331	0.21
332	0.29
333	0.38
334	0.46
335	0.55
336	0.62
337	0.67
338	0.64
339	0.68
340	0.66
341	0.64
342	0.58
343	0.5
344	0.44
345	0.37
346	0.34
347	0.28
348	0.2
349	0.11
350	0.07
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.09
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.13
385	0.15
386	0.18
387	0.2
388	0.22
389	0.23
390	0.25
391	0.25
392	0.25
393	0.29
394	0.3
395	0.33
396	0.31
397	0.32
398	0.31
399	0.31
400	0.32
401	0.29
402	0.24
403	0.18
404	0.18
405	0.16
406	0.15
407	0.14
408	0.12
409	0.1
410	0.08
411	0.07
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.08
456	0.11
457	0.13
458	0.14
459	0.14
460	0.18
461	0.23
462	0.25
463	0.27
464	0.33
465	0.4
466	0.48
467	0.57
468	0.63
469	0.64
470	0.71
471	0.76
472	0.75
473	0.72
474	0.73
475	0.71
476	0.7
477	0.73
478	0.67
479	0.61
480	0.55
481	0.49
482	0.46
483	0.44
484	0.41
485	0.42
486	0.44
487	0.47
488	0.5
489	0.56
490	0.55
491	0.58
492	0.63
493	0.65
494	0.7
495	0.75
496	0.75
497	0.79
498	0.82
499	0.83
500	0.83
501	0.83
502	0.83
503	0.83
504	0.85
505	0.87
506	0.88
507	0.89
508	0.89
509	0.86
510	0.86
511	0.83
512	0.83
513	0.77
514	0.78
515	0.77
516	0.73
517	0.71
518	0.65
519	0.6
520	0.55
521	0.55
522	0.53
523	0.49
524	0.49
525	0.48
526	0.5
527	0.5
528	0.5
529	0.46
530	0.4
531	0.36
532	0.3
533	0.26
534	0.21
535	0.18
536	0.17
537	0.22
538	0.2
539	0.2
540	0.22
541	0.24
542	0.25
543	0.3
544	0.36
545	0.34
546	0.37
547	0.42
548	0.44
549	0.51
550	0.58
551	0.62
552	0.56
553	0.54
554	0.6
555	0.59
556	0.62
557	0.62
558	0.64
559	0.6
560	0.67
561	0.69
562	0.69
563	0.74
564	0.74
565	0.74
566	0.75
567	0.74
568	0.76
569	0.81
570	0.81
571	0.81
572	0.8
573	0.76

A0A1Y1Y9M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer