Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1Y6C1

Protein Details
Accession A0A1Y1Y6C1    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-315RMQFEKRKDKRGAGRGRGRGGRBasic
324-356GGNFKRKSDNQDQEQDKKRNKKSEAKQKGTLIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-93RRS
299-332KRKDKRGAGRGRGRGGRGRGGNRGRGGNFKRKSD
339-351DKKRNKKSEAKQK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 10.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
PS51939  XRRM  
CDD cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MAEPTETLPVELDEEVVNEIVAQFEQYLSDENLASDTELLEIIQRNGSGWIPIYKLCKRPELQQYSEDTVKSALKKGSEKFEINRAGRDIRRSKPLPKAPSQFSRSVYAKGFPEETPELESKLVEFFGQYGEVEQVRFRREKETDAFKGSVFVEFKTLEDANQVAEMKLKYEDTDLLIMTKAAYCAMKEEQLGIVSLYVGEDKKPFKYKRGCLLEFTNAGPEAQVESIKDTLDLEVNYVKLDKEQNRGIIELKEPISDEALESLKTNSDILFDGVHPEFNVLEGEKETQYYKERMQFEKRKDKRGAGRGRGRGGRGRGGNRGRGGNFKRKSDNQDQEQDKKRNKKSEAKQKGTLIEVGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.11
15 0.11
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.14
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.15
38 0.15
39 0.18
40 0.25
41 0.29
42 0.36
43 0.38
44 0.45
45 0.44
46 0.52
47 0.59
48 0.61
49 0.58
50 0.57
51 0.6
52 0.57
53 0.58
54 0.49
55 0.38
56 0.32
57 0.32
58 0.28
59 0.27
60 0.23
61 0.26
62 0.31
63 0.35
64 0.4
65 0.42
66 0.45
67 0.43
68 0.49
69 0.53
70 0.48
71 0.48
72 0.43
73 0.43
74 0.42
75 0.49
76 0.47
77 0.42
78 0.5
79 0.51
80 0.55
81 0.59
82 0.65
83 0.64
84 0.66
85 0.68
86 0.66
87 0.71
88 0.69
89 0.63
90 0.57
91 0.57
92 0.49
93 0.46
94 0.4
95 0.35
96 0.31
97 0.28
98 0.28
99 0.21
100 0.25
101 0.23
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.21
106 0.18
107 0.18
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.22
127 0.23
128 0.28
129 0.33
130 0.38
131 0.38
132 0.41
133 0.4
134 0.33
135 0.34
136 0.29
137 0.27
138 0.19
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.08
189 0.09
190 0.13
191 0.22
192 0.24
193 0.32
194 0.41
195 0.46
196 0.54
197 0.62
198 0.59
199 0.54
200 0.57
201 0.52
202 0.45
203 0.39
204 0.31
205 0.22
206 0.2
207 0.16
208 0.12
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.17
229 0.2
230 0.24
231 0.27
232 0.31
233 0.32
234 0.33
235 0.33
236 0.28
237 0.25
238 0.24
239 0.21
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.12
272 0.11
273 0.13
274 0.13
275 0.15
276 0.2
277 0.22
278 0.27
279 0.32
280 0.37
281 0.43
282 0.53
283 0.58
284 0.64
285 0.72
286 0.73
287 0.75
288 0.76
289 0.78
290 0.77
291 0.79
292 0.79
293 0.78
294 0.82
295 0.79
296 0.81
297 0.77
298 0.71
299 0.69
300 0.63
301 0.6
302 0.58
303 0.56
304 0.57
305 0.59
306 0.61
307 0.58
308 0.6
309 0.54
310 0.57
311 0.59
312 0.6
313 0.6
314 0.6
315 0.64
316 0.65
317 0.72
318 0.73
319 0.75
320 0.73
321 0.77
322 0.78
323 0.78
324 0.81
325 0.82
326 0.8
327 0.81
328 0.82
329 0.82
330 0.83
331 0.84
332 0.85
333 0.87
334 0.89
335 0.86
336 0.85
337 0.81
338 0.77
339 0.7