Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y1XTI0

Protein Details
Accession A0A1Y1XTI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-420EPESLKPTRTRAKQTPPKRPSSGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-249KKRKIKKL
Subcellular Location(s) mito 8, nucl 7.5, cyto_nucl 6, golg 4, cyto 3.5, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MYHINVLLMAKRLFTKRLSGVMAGFIHGYLVYIAILSSLNSFHDLEAMSSKPFLLTLTVGEENYYLSSVWEKHVGKATALTVTLTNCKVFWKKSVSVEELLTVKPSYMDVEDYLSLTEQTFSGLPNEHNEEVCCTIEDSYGGGVRDSSKILKWSLALEKGNKFALGHLDLVPLKEQATVAEWSNWLKLWRDEQEENMRIRKDLNVLQNTNHLLHQQLDALVKEKDDMELLMVHKFKDLLNSKKRKIKKLMKVRVVSTETSDSSIASKPPDEVVKIQARTKSKRVGQHSPAISSIDSKCHINRTLTGCSQDQRGVVSLSAGKSRHPNPNDILQDTTHDEKIAEHPSSRTKKSSPPLHSDKPHTDSSPILDSHSFRASKARIQTSIQRLLNFDDSPTKEPESLKPTRTRAKQTPPKRPSSGPADTSPDLFAASRPDTSPDLFPKRKDPAMSTNPAPKRKHSAISADLSPELFPKRTKTPISFRSYARTILHSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.34
4 0.39
5 0.41
6 0.38
7 0.35
8 0.37
9 0.35
10 0.29
11 0.24
12 0.18
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.06
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.07
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.1
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.16
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.15
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.08
53 0.07
54 0.11
55 0.12
56 0.14
57 0.22
58 0.22
59 0.25
60 0.33
61 0.34
62 0.31
63 0.32
64 0.31
65 0.25
66 0.25
67 0.22
68 0.15
69 0.16
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.2
75 0.25
76 0.26
77 0.3
78 0.34
79 0.37
80 0.45
81 0.51
82 0.5
83 0.48
84 0.46
85 0.43
86 0.37
87 0.32
88 0.26
89 0.19
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.11
111 0.12
112 0.15
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.2
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.17
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.08
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.19
141 0.22
142 0.26
143 0.27
144 0.29
145 0.31
146 0.32
147 0.32
148 0.28
149 0.23
150 0.19
151 0.2
152 0.17
153 0.16
154 0.14
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.07
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.14
175 0.17
176 0.21
177 0.26
178 0.26
179 0.31
180 0.38
181 0.41
182 0.41
183 0.41
184 0.37
185 0.31
186 0.31
187 0.28
188 0.23
189 0.24
190 0.3
191 0.32
192 0.33
193 0.33
194 0.36
195 0.35
196 0.32
197 0.27
198 0.19
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.17
224 0.23
225 0.29
226 0.38
227 0.46
228 0.51
229 0.59
230 0.64
231 0.65
232 0.69
233 0.7
234 0.7
235 0.74
236 0.78
237 0.79
238 0.77
239 0.7
240 0.66
241 0.59
242 0.49
243 0.4
244 0.32
245 0.24
246 0.22
247 0.2
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.17
260 0.23
261 0.24
262 0.26
263 0.3
264 0.35
265 0.38
266 0.42
267 0.43
268 0.42
269 0.48
270 0.52
271 0.57
272 0.55
273 0.59
274 0.55
275 0.49
276 0.45
277 0.38
278 0.31
279 0.25
280 0.21
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.2
286 0.22
287 0.21
288 0.25
289 0.28
290 0.32
291 0.32
292 0.34
293 0.31
294 0.29
295 0.3
296 0.27
297 0.21
298 0.17
299 0.17
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.15
306 0.14
307 0.15
308 0.2
309 0.25
310 0.33
311 0.33
312 0.37
313 0.36
314 0.45
315 0.46
316 0.42
317 0.39
318 0.3
319 0.31
320 0.3
321 0.29
322 0.21
323 0.18
324 0.16
325 0.15
326 0.2
327 0.22
328 0.2
329 0.18
330 0.2
331 0.3
332 0.36
333 0.38
334 0.38
335 0.36
336 0.43
337 0.52
338 0.59
339 0.56
340 0.59
341 0.64
342 0.68
343 0.71
344 0.7
345 0.67
346 0.62
347 0.59
348 0.51
349 0.44
350 0.37
351 0.35
352 0.32
353 0.26
354 0.23
355 0.22
356 0.22
357 0.24
358 0.29
359 0.25
360 0.21
361 0.28
362 0.28
363 0.31
364 0.38
365 0.4
366 0.36
367 0.4
368 0.48
369 0.49
370 0.56
371 0.52
372 0.46
373 0.42
374 0.43
375 0.44
376 0.35
377 0.29
378 0.27
379 0.28
380 0.3
381 0.32
382 0.31
383 0.29
384 0.31
385 0.37
386 0.37
387 0.4
388 0.43
389 0.47
390 0.52
391 0.59
392 0.64
393 0.67
394 0.68
395 0.74
396 0.78
397 0.8
398 0.84
399 0.83
400 0.84
401 0.8
402 0.75
403 0.71
404 0.69
405 0.66
406 0.6
407 0.56
408 0.54
409 0.49
410 0.47
411 0.41
412 0.32
413 0.25
414 0.21
415 0.17
416 0.16
417 0.17
418 0.17
419 0.17
420 0.21
421 0.22
422 0.25
423 0.3
424 0.33
425 0.41
426 0.44
427 0.46
428 0.51
429 0.55
430 0.58
431 0.56
432 0.53
433 0.54
434 0.58
435 0.61
436 0.59
437 0.62
438 0.65
439 0.69
440 0.67
441 0.62
442 0.63
443 0.63
444 0.64
445 0.6
446 0.6
447 0.59
448 0.61
449 0.58
450 0.51
451 0.46
452 0.39
453 0.34
454 0.29
455 0.26
456 0.23
457 0.23
458 0.26
459 0.32
460 0.4
461 0.47
462 0.52
463 0.58
464 0.65
465 0.71
466 0.71
467 0.67
468 0.68
469 0.63
470 0.61
471 0.53