Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XRU2

Protein Details
Accession A0A1Y1XRU2    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-73VNDIRNANTKHKNNKLNKTLQNFMHydrophilic
162-200QQVKTFTKKTRAKNRALDKAIATVKRKERNKTKAENFNFHydrophilic
511-533DESSILGPRKKKKQDYEERIESIHydrophilic
567-602MMVVHKRSVKQKSKMSLREKQKQLRTHINHQKKKGHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-192KTRAKNRALDKAIATVKRKERNK
519-523RKKKK
539-602GRQKFGSSKGKADRGSTTNREKARNKAFMMVVHKRSVKQKSKMSLREKQKQLRTHINHQKKKGH
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 9.833, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences DPALRKNMVSALILLRNRDIISSTSLLSLFFTLFRCHDKNLREMLYSHIVNDIRNANTKHKNNKLNKTLQNFMYTMITSAEGAADNSSENAIAAKKSLDVCIELYKKNVWHDAKTVNVVVGACFSPVTKIMVTALQFFLGADDEEESSDEDEDAIPDIRRMQQVKTFTKKTRAKNRALDKAIATVKRKERNKTKAENFNFSAIHLVNDPQGFVEKLFSRLNKASERFEVRLMIMKLIARLIGIHKLIFLNFYTYLIRYLQPHQRDVTQVLALTAQASHELVPPDTLEPVLMAIANNFVTENMSSEVMSAGMNGIREICSRCPLAMTETLLQDLTEYKGHRDKGIMMASRSLIGLFREINPELLKKKDRGKGATMSLKDFKPIQYGEARAAETIDGLELLANDKPAEDDDEAAWEGWEVESDDSDGEGDWVDVQHSDDDTGGIEVAMDSDDEEEKPVEEEENKEPKENIALTKILTPQDFARLNELKMMNKAEQLTGKRKQDTTEASEEIVDESSILGPRKKKKQDYEERIESIMAGREGRQKFGSSKGKADRGSTTNREKARNKAFMMVVHKRSVKQKSKMSLREKQKQLRTHINHQKKKGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.28
4 0.27
5 0.25
6 0.22
7 0.17
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.15
20 0.17
21 0.24
22 0.26
23 0.3
24 0.36
25 0.38
26 0.44
27 0.49
28 0.5
29 0.45
30 0.43
31 0.45
32 0.45
33 0.41
34 0.34
35 0.32
36 0.3
37 0.28
38 0.31
39 0.3
40 0.25
41 0.32
42 0.35
43 0.38
44 0.47
45 0.55
46 0.61
47 0.66
48 0.74
49 0.76
50 0.84
51 0.85
52 0.85
53 0.85
54 0.81
55 0.79
56 0.72
57 0.67
58 0.56
59 0.48
60 0.41
61 0.32
62 0.26
63 0.2
64 0.17
65 0.12
66 0.12
67 0.11
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.17
88 0.24
89 0.28
90 0.26
91 0.27
92 0.29
93 0.3
94 0.32
95 0.39
96 0.35
97 0.34
98 0.38
99 0.4
100 0.4
101 0.4
102 0.37
103 0.28
104 0.27
105 0.23
106 0.18
107 0.16
108 0.13
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.11
145 0.14
146 0.19
147 0.2
148 0.22
149 0.26
150 0.34
151 0.42
152 0.49
153 0.53
154 0.53
155 0.62
156 0.67
157 0.71
158 0.74
159 0.75
160 0.75
161 0.77
162 0.81
163 0.81
164 0.76
165 0.69
166 0.59
167 0.57
168 0.53
169 0.49
170 0.43
171 0.41
172 0.45
173 0.51
174 0.56
175 0.59
176 0.63
177 0.68
178 0.74
179 0.77
180 0.78
181 0.8
182 0.79
183 0.77
184 0.68
185 0.62
186 0.53
187 0.43
188 0.37
189 0.26
190 0.22
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.12
201 0.1
202 0.14
203 0.17
204 0.18
205 0.22
206 0.24
207 0.28
208 0.31
209 0.33
210 0.32
211 0.35
212 0.39
213 0.36
214 0.34
215 0.31
216 0.25
217 0.29
218 0.27
219 0.21
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.17
246 0.23
247 0.25
248 0.27
249 0.27
250 0.27
251 0.28
252 0.27
253 0.24
254 0.18
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.14
311 0.13
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.12
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.21
330 0.27
331 0.26
332 0.22
333 0.23
334 0.22
335 0.22
336 0.2
337 0.14
338 0.09
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.17
349 0.21
350 0.24
351 0.25
352 0.33
353 0.37
354 0.42
355 0.43
356 0.45
357 0.46
358 0.49
359 0.52
360 0.45
361 0.44
362 0.42
363 0.38
364 0.35
365 0.31
366 0.24
367 0.22
368 0.21
369 0.2
370 0.2
371 0.21
372 0.22
373 0.23
374 0.23
375 0.18
376 0.18
377 0.15
378 0.11
379 0.1
380 0.07
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.1
393 0.09
394 0.1
395 0.09
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.08
401 0.08
402 0.06
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.15
446 0.22
447 0.31
448 0.31
449 0.32
450 0.32
451 0.31
452 0.35
453 0.33
454 0.28
455 0.22
456 0.23
457 0.22
458 0.25
459 0.28
460 0.25
461 0.23
462 0.22
463 0.19
464 0.26
465 0.28
466 0.25
467 0.3
468 0.3
469 0.3
470 0.35
471 0.36
472 0.3
473 0.31
474 0.34
475 0.28
476 0.29
477 0.3
478 0.26
479 0.3
480 0.34
481 0.38
482 0.43
483 0.48
484 0.5
485 0.5
486 0.49
487 0.51
488 0.52
489 0.5
490 0.49
491 0.43
492 0.39
493 0.37
494 0.35
495 0.28
496 0.22
497 0.15
498 0.08
499 0.07
500 0.08
501 0.12
502 0.14
503 0.17
504 0.24
505 0.33
506 0.44
507 0.53
508 0.61
509 0.68
510 0.78
511 0.85
512 0.88
513 0.89
514 0.87
515 0.79
516 0.71
517 0.6
518 0.49
519 0.4
520 0.34
521 0.25
522 0.17
523 0.18
524 0.25
525 0.26
526 0.3
527 0.3
528 0.29
529 0.3
530 0.4
531 0.47
532 0.41
533 0.49
534 0.54
535 0.6
536 0.59
537 0.6
538 0.57
539 0.52
540 0.58
541 0.57
542 0.58
543 0.58
544 0.61
545 0.67
546 0.65
547 0.69
548 0.71
549 0.71
550 0.64
551 0.63
552 0.6
553 0.57
554 0.61
555 0.61
556 0.55
557 0.54
558 0.55
559 0.53
560 0.59
561 0.64
562 0.64
563 0.64
564 0.69
565 0.72
566 0.79
567 0.85
568 0.85
569 0.84
570 0.85
571 0.86
572 0.87
573 0.87
574 0.85
575 0.83
576 0.83
577 0.84
578 0.82
579 0.82
580 0.83
581 0.84
582 0.85