Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XSS1

Protein Details
Accession A0A1Y1XSS1    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25SDSPEKKLPNRSSGRIKAKTHydrophilic
34-55EEAYTPRKTRERKNVELHEPGQHydrophilic
234-298TQNPNETPTKKRKYTKRVDKKPTTVADQTSPAKRGRKPRNTYDSPVSNQKKRRPKTKEMVDSDEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-254KKRKYTKRVDKK
264-272PAKRGRKPR
283-288KKRRPK
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044198  DEK  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSSATSDSPEKKLPNRSSGRIKAKTGGISLMSLEEAYTPRKTRERKNVELHEPGQESPTKKAILYKGPGTPLKDIPRVASKIHSRKGKDYTLYALHRFLFGRTRRKPNVKEDLGRFRGITFQNLEEEDVYWNKLEKWTVETCKDVCDVLDLPFPNNKNDLHNFIMDFLKSPMPREVTDVQEECSIQISPFSYFVREKRGELIKNDPDKSLEDIQKELVALWDSLPNEEKTIYQTQNPNETPTKKRKYTKRVDKKPTTVADQTSPAKRGRKPRNTYDSPVSNQKKRRPKTKEMVDSDEEEQSKTIPAEPVKGGHDEVGKLEDSALEGDEGGASDHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.65
3 0.69
4 0.73
5 0.77
6 0.8
7 0.76
8 0.73
9 0.69
10 0.66
11 0.61
12 0.53
13 0.45
14 0.36
15 0.3
16 0.27
17 0.22
18 0.17
19 0.13
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.13
24 0.17
25 0.19
26 0.25
27 0.33
28 0.41
29 0.49
30 0.59
31 0.65
32 0.7
33 0.78
34 0.81
35 0.8
36 0.81
37 0.72
38 0.68
39 0.61
40 0.51
41 0.44
42 0.39
43 0.34
44 0.3
45 0.33
46 0.27
47 0.25
48 0.31
49 0.34
50 0.37
51 0.4
52 0.41
53 0.4
54 0.45
55 0.48
56 0.45
57 0.43
58 0.42
59 0.43
60 0.43
61 0.4
62 0.37
63 0.41
64 0.4
65 0.37
66 0.38
67 0.42
68 0.46
69 0.53
70 0.57
71 0.53
72 0.58
73 0.63
74 0.62
75 0.55
76 0.49
77 0.47
78 0.47
79 0.47
80 0.42
81 0.38
82 0.32
83 0.31
84 0.29
85 0.25
86 0.26
87 0.29
88 0.37
89 0.42
90 0.52
91 0.59
92 0.68
93 0.73
94 0.74
95 0.77
96 0.74
97 0.74
98 0.71
99 0.72
100 0.66
101 0.6
102 0.51
103 0.41
104 0.4
105 0.34
106 0.3
107 0.21
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.14
124 0.2
125 0.23
126 0.25
127 0.27
128 0.25
129 0.26
130 0.26
131 0.21
132 0.15
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.17
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.23
147 0.22
148 0.21
149 0.2
150 0.2
151 0.2
152 0.15
153 0.14
154 0.11
155 0.13
156 0.12
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.21
162 0.22
163 0.21
164 0.25
165 0.24
166 0.22
167 0.21
168 0.2
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.13
180 0.15
181 0.23
182 0.23
183 0.23
184 0.27
185 0.34
186 0.34
187 0.35
188 0.42
189 0.42
190 0.47
191 0.47
192 0.41
193 0.36
194 0.35
195 0.36
196 0.35
197 0.3
198 0.25
199 0.25
200 0.25
201 0.24
202 0.22
203 0.18
204 0.12
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.15
217 0.21
218 0.21
219 0.24
220 0.29
221 0.31
222 0.4
223 0.4
224 0.4
225 0.4
226 0.44
227 0.47
228 0.52
229 0.58
230 0.58
231 0.66
232 0.71
233 0.76
234 0.82
235 0.86
236 0.87
237 0.89
238 0.91
239 0.92
240 0.89
241 0.86
242 0.79
243 0.75
244 0.68
245 0.6
246 0.52
247 0.48
248 0.46
249 0.42
250 0.41
251 0.4
252 0.42
253 0.45
254 0.52
255 0.58
256 0.64
257 0.67
258 0.75
259 0.8
260 0.8
261 0.81
262 0.79
263 0.75
264 0.69
265 0.71
266 0.69
267 0.67
268 0.68
269 0.71
270 0.73
271 0.74
272 0.8
273 0.79
274 0.82
275 0.84
276 0.87
277 0.88
278 0.85
279 0.84
280 0.76
281 0.71
282 0.63
283 0.58
284 0.47
285 0.37
286 0.3
287 0.23
288 0.22
289 0.18
290 0.19
291 0.18
292 0.19
293 0.24
294 0.25
295 0.28
296 0.28
297 0.29
298 0.27
299 0.25
300 0.27
301 0.23
302 0.23
303 0.22
304 0.2
305 0.18
306 0.17
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08