Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XEW3

Protein Details
Accession A0A1Y1XEW3    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-76HEDVPVAPPKKKKAKKEKKEKKEKKEKKEKKEKKDKSKKRKKNVEEEEEKEEEBasic
109-137EDDPDTQPPKKKKKKAEEKPAKDKERSKHBasic
376-404QKNDAGDDLKPRRRRRREQPQKSTSHLPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-65PPKKKKAKKEKKEKKEKKEKKEKKEKKDKSKKRKK
117-136PKKKKKKAEEKPAKDKERSK
385-407KPRRRRRREQPQKSTSHLPPPKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSIEGKTKTPEAVEDDTYDFAKWHEDVPVAPPKKKKAKKEKKEKKEKKEKKEKKEKKDKSKKRKKNVEEEEEKEEEKEESAEAEKADSESDSESESESESESESERELEDDPDTQPPKKKKKKAEEKPAKDKERSKHGVWIGNLSFKTTRGSLHKFFSTCGEITRVHLPMGNNGNRGFAYVDFTCAEEVEAAITLSEQELDGRQVLIKNSQDFAKTGRPSTFPTTESSLKASKQKQKHEPSPTLFLGNLSFNTTRDGIKSLFEDCGKIIKVRLATFEDSGKCKGFAYVDFEEAESATKAINDRSKQWLDGRKLRIEYGSAEATKRGAPWLHDKKPRRYGEGEDGEGEGEGESQEGGEGHYRGYRRNGEEGGFQRYQKNDAGDDLKPRRRRRREQPQKSTSHLPPPKKSEAPVPFEGKKIVFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.3
4 0.29
5 0.26
6 0.2
7 0.15
8 0.17
9 0.14
10 0.14
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.23
15 0.33
16 0.34
17 0.39
18 0.44
19 0.51
20 0.61
21 0.68
22 0.73
23 0.74
24 0.81
25 0.87
26 0.92
27 0.93
28 0.93
29 0.97
30 0.97
31 0.96
32 0.97
33 0.96
34 0.96
35 0.96
36 0.95
37 0.95
38 0.96
39 0.95
40 0.95
41 0.96
42 0.95
43 0.95
44 0.96
45 0.96
46 0.96
47 0.97
48 0.96
49 0.96
50 0.96
51 0.94
52 0.94
53 0.94
54 0.93
55 0.91
56 0.84
57 0.8
58 0.72
59 0.63
60 0.52
61 0.42
62 0.32
63 0.23
64 0.19
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.19
100 0.22
101 0.24
102 0.31
103 0.39
104 0.5
105 0.58
106 0.66
107 0.7
108 0.79
109 0.87
110 0.9
111 0.92
112 0.92
113 0.92
114 0.94
115 0.93
116 0.89
117 0.85
118 0.81
119 0.76
120 0.76
121 0.71
122 0.62
123 0.6
124 0.58
125 0.56
126 0.49
127 0.49
128 0.4
129 0.39
130 0.37
131 0.32
132 0.27
133 0.22
134 0.23
135 0.17
136 0.19
137 0.21
138 0.28
139 0.29
140 0.32
141 0.35
142 0.33
143 0.33
144 0.33
145 0.3
146 0.23
147 0.21
148 0.21
149 0.17
150 0.19
151 0.22
152 0.2
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.2
157 0.28
158 0.28
159 0.26
160 0.25
161 0.26
162 0.23
163 0.24
164 0.19
165 0.11
166 0.13
167 0.11
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.06
175 0.06
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.11
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.17
201 0.21
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.23
206 0.26
207 0.31
208 0.3
209 0.23
210 0.25
211 0.28
212 0.28
213 0.27
214 0.26
215 0.23
216 0.23
217 0.29
218 0.34
219 0.38
220 0.43
221 0.51
222 0.58
223 0.65
224 0.72
225 0.73
226 0.73
227 0.68
228 0.67
229 0.59
230 0.5
231 0.41
232 0.33
233 0.25
234 0.19
235 0.15
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.15
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.12
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.2
260 0.2
261 0.21
262 0.22
263 0.26
264 0.25
265 0.25
266 0.26
267 0.24
268 0.2
269 0.19
270 0.19
271 0.16
272 0.15
273 0.2
274 0.19
275 0.2
276 0.2
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.12
287 0.18
288 0.19
289 0.22
290 0.3
291 0.32
292 0.34
293 0.4
294 0.45
295 0.46
296 0.53
297 0.56
298 0.54
299 0.54
300 0.52
301 0.46
302 0.39
303 0.33
304 0.29
305 0.27
306 0.22
307 0.21
308 0.21
309 0.21
310 0.2
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.17
315 0.27
316 0.37
317 0.45
318 0.54
319 0.61
320 0.68
321 0.77
322 0.78
323 0.74
324 0.68
325 0.66
326 0.67
327 0.65
328 0.57
329 0.48
330 0.43
331 0.37
332 0.32
333 0.25
334 0.14
335 0.08
336 0.06
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.14
347 0.15
348 0.18
349 0.26
350 0.32
351 0.33
352 0.39
353 0.41
354 0.39
355 0.46
356 0.46
357 0.47
358 0.42
359 0.4
360 0.39
361 0.38
362 0.4
363 0.36
364 0.35
365 0.29
366 0.31
367 0.35
368 0.33
369 0.41
370 0.47
371 0.52
372 0.58
373 0.67
374 0.73
375 0.79
376 0.86
377 0.88
378 0.89
379 0.92
380 0.95
381 0.95
382 0.94
383 0.91
384 0.87
385 0.84
386 0.79
387 0.79
388 0.76
389 0.74
390 0.73
391 0.74
392 0.76
393 0.71
394 0.68
395 0.67
396 0.67
397 0.65
398 0.64
399 0.63
400 0.57
401 0.55
402 0.57