Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Y1X6

Protein Details
Accession A0A1Y1Y1X6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MDQATRPYKRPRIHQEPLENSSIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, plas 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDQATRPYKRPRIHQEPLENSSIFGSVWTGDEKEKFFRALQKYGKRDIRRIADDIKSKSYVEVGLYLDILERTAMEKENKGSDSEEDDEMNSVHPSAQDISTVSLRVEERQAKKLLEAEERKAIKRAEREYNTRLTEEESKKIEVLHIENALSLSSLSVLVPSTLPSLTITNMMLSTRLYMKEEPVILKGLFLEMYNCLLRFLVPLIRDVIIFAEEHVIDPVARPQNKMIHINDVRKALLSRNAEFNRDTFFFRLIERLSKEDRLVEDSDSDSDEPLIYASRRNTRQVVEVPPQYENDSTTDDDDDDDDNQEESECSSSSESICQDRFSDPEDTLIYLNDLQTDGESEQSTSSNGEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.83
3 0.82
4 0.8
5 0.75
6 0.64
7 0.54
8 0.45
9 0.36
10 0.25
11 0.17
12 0.13
13 0.08
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.14
18 0.18
19 0.2
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.28
24 0.35
25 0.39
26 0.44
27 0.52
28 0.57
29 0.61
30 0.68
31 0.75
32 0.72
33 0.73
34 0.72
35 0.71
36 0.67
37 0.66
38 0.63
39 0.61
40 0.62
41 0.59
42 0.55
43 0.48
44 0.43
45 0.39
46 0.34
47 0.28
48 0.21
49 0.2
50 0.16
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.12
62 0.14
63 0.17
64 0.2
65 0.25
66 0.25
67 0.25
68 0.25
69 0.23
70 0.26
71 0.26
72 0.24
73 0.19
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.11
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.19
95 0.25
96 0.28
97 0.33
98 0.37
99 0.34
100 0.35
101 0.37
102 0.35
103 0.37
104 0.37
105 0.34
106 0.39
107 0.41
108 0.41
109 0.41
110 0.38
111 0.34
112 0.38
113 0.41
114 0.42
115 0.46
116 0.51
117 0.51
118 0.56
119 0.53
120 0.46
121 0.4
122 0.34
123 0.38
124 0.34
125 0.35
126 0.3
127 0.29
128 0.29
129 0.28
130 0.26
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.1
140 0.07
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.15
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.05
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.12
209 0.17
210 0.18
211 0.19
212 0.22
213 0.28
214 0.32
215 0.37
216 0.32
217 0.35
218 0.4
219 0.44
220 0.44
221 0.4
222 0.36
223 0.32
224 0.32
225 0.24
226 0.26
227 0.26
228 0.24
229 0.32
230 0.33
231 0.34
232 0.34
233 0.32
234 0.3
235 0.27
236 0.28
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.21
242 0.18
243 0.22
244 0.22
245 0.25
246 0.27
247 0.29
248 0.29
249 0.29
250 0.29
251 0.27
252 0.27
253 0.23
254 0.21
255 0.19
256 0.19
257 0.18
258 0.17
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.08
266 0.12
267 0.17
268 0.26
269 0.29
270 0.34
271 0.37
272 0.37
273 0.43
274 0.45
275 0.47
276 0.46
277 0.47
278 0.45
279 0.42
280 0.42
281 0.38
282 0.33
283 0.27
284 0.22
285 0.21
286 0.2
287 0.2
288 0.2
289 0.17
290 0.17
291 0.17
292 0.16
293 0.13
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.17
308 0.19
309 0.23
310 0.24
311 0.24
312 0.25
313 0.25
314 0.26
315 0.26
316 0.27
317 0.21
318 0.24
319 0.23
320 0.23
321 0.21
322 0.2
323 0.18
324 0.16
325 0.16
326 0.13
327 0.13
328 0.11
329 0.11
330 0.14
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.13