Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XXW7

Protein Details
Accession A0A1Y1XXW7    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-51SQKSEKKTSNTAKKSEKKVEPRARSDYPHydrophilic
212-236YYSISTNKKSKSKKEKKDKIFVGIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-57TAKKSEKKVEPRARSDYPQRGGKK
219-230KKSKSKKEKKDK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSVVSRNFYDLLNEDGEEVARIISQKSEKKTSNTAKKSEKKVEPRARSDYPQRGGKKVVPVARTEARREYSDRDFTASKHGRGGRSEGSHQGGRSGFPSRGREFDRKSATGKVDSEKKIHQSWGDAATDIQEGEKIVRESRGEGGRPENQVERVTVAEPEDTSKTLDEYYAEKTGKLTAKGITLPEARKPNEGADDAQWKSGVQLQKQEEEYYSISTNKKSKSKKEKKDKIFVGIEQRFTDGRKQGYEGRGGRGGRNSGVNVDDKSAFPSLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.13
5 0.12
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.13
11 0.2
12 0.27
13 0.33
14 0.41
15 0.45
16 0.5
17 0.6
18 0.65
19 0.69
20 0.7
21 0.72
22 0.75
23 0.79
24 0.83
25 0.83
26 0.81
27 0.81
28 0.84
29 0.86
30 0.84
31 0.83
32 0.81
33 0.76
34 0.74
35 0.73
36 0.71
37 0.68
38 0.68
39 0.63
40 0.59
41 0.58
42 0.56
43 0.54
44 0.51
45 0.5
46 0.43
47 0.42
48 0.45
49 0.47
50 0.47
51 0.42
52 0.42
53 0.39
54 0.4
55 0.41
56 0.4
57 0.4
58 0.42
59 0.39
60 0.37
61 0.35
62 0.33
63 0.41
64 0.39
65 0.33
66 0.34
67 0.37
68 0.35
69 0.36
70 0.41
71 0.35
72 0.34
73 0.36
74 0.33
75 0.34
76 0.33
77 0.31
78 0.29
79 0.24
80 0.21
81 0.2
82 0.19
83 0.18
84 0.21
85 0.27
86 0.25
87 0.29
88 0.34
89 0.4
90 0.41
91 0.47
92 0.47
93 0.44
94 0.45
95 0.45
96 0.42
97 0.38
98 0.35
99 0.32
100 0.34
101 0.34
102 0.34
103 0.32
104 0.33
105 0.32
106 0.32
107 0.28
108 0.22
109 0.23
110 0.23
111 0.2
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.08
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.15
128 0.17
129 0.16
130 0.17
131 0.2
132 0.23
133 0.24
134 0.24
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.16
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.21
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.17
166 0.19
167 0.2
168 0.2
169 0.2
170 0.21
171 0.22
172 0.26
173 0.31
174 0.31
175 0.32
176 0.32
177 0.3
178 0.3
179 0.3
180 0.26
181 0.23
182 0.29
183 0.27
184 0.26
185 0.24
186 0.2
187 0.19
188 0.22
189 0.23
190 0.18
191 0.25
192 0.27
193 0.32
194 0.34
195 0.35
196 0.3
197 0.29
198 0.28
199 0.23
200 0.22
201 0.22
202 0.22
203 0.26
204 0.32
205 0.35
206 0.42
207 0.48
208 0.57
209 0.64
210 0.73
211 0.79
212 0.85
213 0.89
214 0.9
215 0.93
216 0.87
217 0.84
218 0.78
219 0.72
220 0.72
221 0.65
222 0.59
223 0.49
224 0.46
225 0.39
226 0.35
227 0.37
228 0.32
229 0.31
230 0.3
231 0.33
232 0.38
233 0.41
234 0.49
235 0.44
236 0.44
237 0.46
238 0.45
239 0.45
240 0.44
241 0.43
242 0.36
243 0.38
244 0.34
245 0.3
246 0.31
247 0.31
248 0.26
249 0.27
250 0.26
251 0.22
252 0.25