Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X9Z3

Protein Details
Accession A0A1Y1X9Z3    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-52QHTREVDKEIERKKKRQQLEDEKKRREQEKRRQEERATTABasic
66-86ERERAERKREREREMERKKGLBasic
267-299SAKARRRSLSPPPKSRKRSVSPRKSSSRKPFDDHydrophilic
368-390QEQERLRARKKAKLEMEKKKRARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-47ERKKKRQQLEDEKKRREQEKRRQEE
59-106RKRDLALERERAERKREREREMERKKGLEEQAKGRDVRAGSIRKEKAK
251-295RKAKLSPGLKPSRSSESAKARRRSLSPPPKSRKRSVSPRKSSSRK
372-390RLRARKKAKLEMEKKKRAR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MGEFEELMRLATQHTREVDKEIERKKKRQQLEDEKKRREQEKRRQEERATTAIQLAELRKRDLALERERAERKREREREMERKKGLEEQAKGRDVRAGSIRKEKAKSQPYSEETTRRKPYTSMSFDDLINQASDIPTSTFKLVPTSRSGPSTNNSRNPAARRDATISSRAAKDTSSRNPSVRDRNGSGERSAIRTNSATKSGDDDPYKKRSSRAYESDRTRSVSSSRSIPTKSTALRDVRRSASDLDVPTRKAKLSPGLKPSRSSESAKARRRSLSPPPKSRKRSVSPRKSSSRKPFDDSEFNEDYVKKGNISSIIGQLFGYDRSRYVNERYSDDDMEASMTDLRKEESRSAKIARLEDEREEELERQEQERLRARKKAKLEMEKKKRAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.3
4 0.35
5 0.39
6 0.41
7 0.48
8 0.52
9 0.59
10 0.63
11 0.71
12 0.77
13 0.8
14 0.81
15 0.83
16 0.84
17 0.85
18 0.88
19 0.91
20 0.91
21 0.9
22 0.89
23 0.87
24 0.84
25 0.84
26 0.83
27 0.83
28 0.84
29 0.86
30 0.85
31 0.86
32 0.83
33 0.81
34 0.76
35 0.72
36 0.63
37 0.54
38 0.49
39 0.4
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.26
44 0.26
45 0.27
46 0.25
47 0.25
48 0.27
49 0.3
50 0.35
51 0.37
52 0.43
53 0.44
54 0.51
55 0.57
56 0.58
57 0.59
58 0.6
59 0.6
60 0.63
61 0.68
62 0.67
63 0.7
64 0.76
65 0.79
66 0.81
67 0.82
68 0.75
69 0.7
70 0.65
71 0.63
72 0.6
73 0.57
74 0.52
75 0.5
76 0.54
77 0.56
78 0.54
79 0.47
80 0.44
81 0.36
82 0.35
83 0.35
84 0.32
85 0.32
86 0.42
87 0.47
88 0.49
89 0.52
90 0.53
91 0.55
92 0.59
93 0.59
94 0.56
95 0.6
96 0.57
97 0.61
98 0.6
99 0.6
100 0.56
101 0.61
102 0.62
103 0.55
104 0.52
105 0.46
106 0.49
107 0.5
108 0.49
109 0.44
110 0.4
111 0.4
112 0.38
113 0.39
114 0.33
115 0.23
116 0.17
117 0.13
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.18
129 0.18
130 0.19
131 0.23
132 0.26
133 0.26
134 0.28
135 0.3
136 0.26
137 0.29
138 0.36
139 0.37
140 0.39
141 0.41
142 0.41
143 0.44
144 0.45
145 0.47
146 0.42
147 0.37
148 0.34
149 0.34
150 0.35
151 0.32
152 0.32
153 0.29
154 0.26
155 0.25
156 0.24
157 0.2
158 0.17
159 0.18
160 0.21
161 0.27
162 0.3
163 0.31
164 0.32
165 0.37
166 0.42
167 0.48
168 0.46
169 0.44
170 0.4
171 0.44
172 0.47
173 0.44
174 0.38
175 0.32
176 0.28
177 0.26
178 0.25
179 0.19
180 0.16
181 0.15
182 0.18
183 0.16
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.2
188 0.2
189 0.24
190 0.23
191 0.26
192 0.27
193 0.33
194 0.35
195 0.32
196 0.33
197 0.36
198 0.41
199 0.44
200 0.49
201 0.51
202 0.56
203 0.61
204 0.63
205 0.58
206 0.53
207 0.46
208 0.39
209 0.33
210 0.28
211 0.24
212 0.24
213 0.24
214 0.25
215 0.25
216 0.25
217 0.26
218 0.27
219 0.28
220 0.26
221 0.3
222 0.33
223 0.37
224 0.41
225 0.42
226 0.4
227 0.39
228 0.38
229 0.33
230 0.29
231 0.28
232 0.25
233 0.26
234 0.26
235 0.26
236 0.27
237 0.26
238 0.24
239 0.21
240 0.22
241 0.26
242 0.31
243 0.36
244 0.43
245 0.51
246 0.52
247 0.54
248 0.55
249 0.53
250 0.5
251 0.47
252 0.45
253 0.48
254 0.56
255 0.62
256 0.64
257 0.61
258 0.62
259 0.61
260 0.6
261 0.6
262 0.62
263 0.63
264 0.68
265 0.74
266 0.8
267 0.83
268 0.84
269 0.83
270 0.82
271 0.83
272 0.83
273 0.84
274 0.84
275 0.86
276 0.88
277 0.86
278 0.86
279 0.86
280 0.85
281 0.79
282 0.75
283 0.72
284 0.68
285 0.7
286 0.64
287 0.6
288 0.52
289 0.48
290 0.45
291 0.39
292 0.33
293 0.29
294 0.26
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.18
299 0.21
300 0.22
301 0.22
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.18
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.12
310 0.12
311 0.16
312 0.19
313 0.22
314 0.27
315 0.33
316 0.33
317 0.36
318 0.41
319 0.42
320 0.41
321 0.38
322 0.32
323 0.24
324 0.23
325 0.19
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.17
333 0.2
334 0.27
335 0.33
336 0.37
337 0.42
338 0.45
339 0.48
340 0.5
341 0.5
342 0.48
343 0.46
344 0.45
345 0.43
346 0.44
347 0.41
348 0.37
349 0.36
350 0.33
351 0.3
352 0.31
353 0.29
354 0.26
355 0.3
356 0.32
357 0.37
358 0.45
359 0.51
360 0.53
361 0.61
362 0.65
363 0.67
364 0.72
365 0.75
366 0.76
367 0.77
368 0.81
369 0.83
370 0.88