FuNGI

A0A1Y1ZDQ2

Protein Details

Accession

A0A1Y1ZDQ2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1021-1044	VPIVQPYRKHQKKVIKTNLQNLTI	Hydrophilic
1176-1201	QDQPEEPKDSKKSKKVHKWVDLTFPP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MFSFSHKAFVSQRKRLLGSVLTTRTSAGVQTKSTSFLEATLRKPVQSRYLNSSVTKNNLASADLAAAPGLSAVETLPEAMNPLMESLTTAGSKDLLILPRPRSQDFNDGKFNIKERLVVMHACLKTGDVDRARRMLTSLYKSNPQKMNELADIHVHNSLLRGYIEKSPRPHVVQAMNWFDTIKKYGLSPDCTTYAILIKGFLRINSVNAAKVIAQEMLKAGYTMEQLYGNPHLDDADLKKLIGIAEELAPVSVAKGKPQAPAAPEATPEAFADIKSSNPLGVRMLRKSLETASANYMDLYERQLKLEQQAIEAEVARLAELDKGRGEGAVNFRSSHLKRMIRDWHGELVKRIQDEAARVADDSKDITTSYGALLRSVAPEKLAIITINEMLRSNANGDVSDGTKSTQLLLSIGKAVELEYHSDILKKRSNSHLLDRRVQVQSLYSSGKLFNMTVRRAEAKKEREAIESEWVPRWTKEMHMSIGSILASSLIESAKVHTKRVNDATGDVEVFKEDAFYVTHQYQRGRQIGVVKLHPKLIDILSEGPLQEGVHPRLLPMLVTPKPWLTYNSGGYLTSRSLCMRIKGSPEQLAYLQEASNKDCLAVALAGLDVLGATKWQVNRKVFDVVLKVWNSGEELGDIPPAEIHREVPPKPEDYDENPQARWQWMKEYREVQSLKRNNHSLRCDANYKVEIAKAFLGQSMYFPHNFDFRGRAYPIPPHFNHLGSDLCRGMLLFDDAKPLGKSGLKWLKIHLASLAGYDKHSFEDRVSYIESNLNKVFDSADRPLDGDRWWLQAEDPWQCLAACFELTEALRSPEPEEFCSRLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDKEGARQVNLIPSGAPADIYTGVANKVIELIEKEAALGIDKAQILKGKITRKVVKQTVMTNVYGVTVIGARAQISNRLREIEELKDVDVFGLSTYLTRLVFDSLGEMFTGARNLQDWLNESARRIARSIPAELLEEAKNKSKQAKTSESGEVELPTSVSSKLLSSEQMSSVIWTTPLGVPIVQPYRKHQKKVIKTNLQNLTIINPDAHVPVNAQKQRTAFPPNFIHSLDASHMLMSAVACKQHGLSFASVHDSYWTHACDVDTMNTILREQFIELHQRPIMEELRNEFIERYKGYKMPVSASDDEVKPANKGLNLALPDDGHDDDLDTEADEKQDQPEEPKDSKKSKKVHKWVDLTFPPLPPRGDFDVSQVKESPYFFH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.61
3	0.58
4	0.52
5	0.48
6	0.48
7	0.45
8	0.4
9	0.38
10	0.37
11	0.32
12	0.28
13	0.26
14	0.24
15	0.23
16	0.24
17	0.27
18	0.28
19	0.31
20	0.31
21	0.29
22	0.23
23	0.22
24	0.29
25	0.3
26	0.32
27	0.38
28	0.38
29	0.38
30	0.42
31	0.43
32	0.45
33	0.48
34	0.51
35	0.5
36	0.56
37	0.58
38	0.57
39	0.59
40	0.55
41	0.52
42	0.51
43	0.43
44	0.39
45	0.35
46	0.34
47	0.28
48	0.23
49	0.2
50	0.15
51	0.15
52	0.11
53	0.1
54	0.08
55	0.07
56	0.06
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.05
61	0.05
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.09
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.08
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.15
82	0.16
83	0.21
84	0.28
85	0.32
86	0.38
87	0.42
88	0.43
89	0.43
90	0.44
91	0.5
92	0.51
93	0.53
94	0.55
95	0.52
96	0.55
97	0.54
98	0.52
99	0.47
100	0.4
101	0.36
102	0.29
103	0.32
104	0.31
105	0.28
106	0.28
107	0.3
108	0.29
109	0.28
110	0.26
111	0.22
112	0.22
113	0.24
114	0.29
115	0.27
116	0.33
117	0.36
118	0.4
119	0.4
120	0.37
121	0.36
122	0.34
123	0.36
124	0.37
125	0.4
126	0.4
127	0.48
128	0.52
129	0.6
130	0.6
131	0.54
132	0.52
133	0.5
134	0.51
135	0.47
136	0.45
137	0.37
138	0.35
139	0.34
140	0.3
141	0.27
142	0.21
143	0.17
144	0.16
145	0.15
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.13
150	0.21
151	0.28
152	0.32
153	0.36
154	0.4
155	0.46
156	0.48
157	0.49
158	0.48
159	0.47
160	0.48
161	0.51
162	0.52
163	0.47
164	0.43
165	0.39
166	0.33
167	0.31
168	0.28
169	0.21
170	0.15
171	0.15
172	0.22
173	0.28
174	0.33
175	0.33
176	0.34
177	0.35
178	0.35
179	0.34
180	0.28
181	0.25
182	0.2
183	0.18
184	0.16
185	0.14
186	0.18
187	0.19
188	0.18
189	0.19
190	0.18
191	0.2
192	0.24
193	0.24
194	0.21
195	0.2
196	0.21
197	0.16
198	0.17
199	0.16
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.14
215	0.17
216	0.16
217	0.15
218	0.14
219	0.13
220	0.13
221	0.16
222	0.16
223	0.19
224	0.18
225	0.18
226	0.18
227	0.19
228	0.18
229	0.16
230	0.14
231	0.09
232	0.09
233	0.1
234	0.1
235	0.08
236	0.09
237	0.08
238	0.07
239	0.11
240	0.1
241	0.12
242	0.18
243	0.2
244	0.23
245	0.27
246	0.3
247	0.27
248	0.32
249	0.33
250	0.28
251	0.27
252	0.26
253	0.23
254	0.21
255	0.18
256	0.15
257	0.13
258	0.11
259	0.13
260	0.11
261	0.11
262	0.12
263	0.13
264	0.12
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.2
269	0.25
270	0.25
271	0.29
272	0.28
273	0.29
274	0.3
275	0.28
276	0.29
277	0.25
278	0.25
279	0.25
280	0.25
281	0.25
282	0.22
283	0.21
284	0.15
285	0.14
286	0.16
287	0.18
288	0.17
289	0.19
290	0.21
291	0.22
292	0.24
293	0.29
294	0.25
295	0.21
296	0.21
297	0.2
298	0.19
299	0.18
300	0.15
301	0.1
302	0.09
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.09
307	0.09
308	0.11
309	0.1
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.18
316	0.2
317	0.2
318	0.2
319	0.21
320	0.29
321	0.29
322	0.32
323	0.35
324	0.37
325	0.37
326	0.45
327	0.52
328	0.49
329	0.53
330	0.49
331	0.48
332	0.47
333	0.47
334	0.41
335	0.39
336	0.36
337	0.32
338	0.3
339	0.23
340	0.21
341	0.22
342	0.23
343	0.18
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.14
348	0.13
349	0.12
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.13
363	0.14
364	0.13
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.11
369	0.11
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.1
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.11
388	0.1
389	0.09
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.11
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.14
410	0.16
411	0.19
412	0.24
413	0.23
414	0.26
415	0.33
416	0.4
417	0.41
418	0.5
419	0.54
420	0.54
421	0.58
422	0.56
423	0.54
424	0.48
425	0.44
426	0.34
427	0.27
428	0.23
429	0.2
430	0.2
431	0.15
432	0.14
433	0.14
434	0.15
435	0.14
436	0.13
437	0.14
438	0.18
439	0.19
440	0.19
441	0.21
442	0.25
443	0.25
444	0.31
445	0.35
446	0.35
447	0.39
448	0.43
449	0.43
450	0.41
451	0.42
452	0.38
453	0.36
454	0.32
455	0.28
456	0.26
457	0.26
458	0.24
459	0.22
460	0.22
461	0.17
462	0.18
463	0.22
464	0.22
465	0.22
466	0.22
467	0.22
468	0.2
469	0.2
470	0.17
471	0.11
472	0.08
473	0.06
474	0.05
475	0.04
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.06
481	0.14
482	0.15
483	0.17
484	0.19
485	0.21
486	0.27
487	0.31
488	0.32
489	0.25
490	0.25
491	0.25
492	0.23
493	0.21
494	0.16
495	0.12
496	0.09
497	0.08
498	0.07
499	0.05
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.1
505	0.11
506	0.14
507	0.16
508	0.18
509	0.22
510	0.28
511	0.29
512	0.27
513	0.27
514	0.29
515	0.32
516	0.34
517	0.34
518	0.31
519	0.29
520	0.3
521	0.28
522	0.23
523	0.2
524	0.17
525	0.13
526	0.12
527	0.12
528	0.12
529	0.13
530	0.12
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.1
535	0.12
536	0.12
537	0.14
538	0.14
539	0.14
540	0.14
541	0.14
542	0.12
543	0.09
544	0.14
545	0.13
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.16
550	0.17
551	0.18
552	0.16
553	0.19
554	0.2
555	0.21
556	0.21
557	0.2
558	0.19
559	0.19
560	0.15
561	0.11
562	0.11
563	0.09
564	0.11
565	0.12
566	0.14
567	0.15
568	0.16
569	0.21
570	0.23
571	0.26
572	0.26
573	0.26
574	0.25
575	0.23
576	0.22
577	0.18
578	0.15
579	0.13
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.11
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.07
589	0.06
590	0.05
591	0.04
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.02
597	0.02
598	0.02
599	0.02
600	0.02
601	0.04
602	0.07
603	0.11
604	0.18
605	0.2
606	0.22
607	0.24
608	0.27
609	0.25
610	0.25
611	0.24
612	0.19
613	0.22
614	0.21
615	0.19
616	0.16
617	0.16
618	0.14
619	0.12
620	0.1
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.06
631	0.07
632	0.12
633	0.17
634	0.17
635	0.21
636	0.23
637	0.24
638	0.25
639	0.25
640	0.23
641	0.25
642	0.32
643	0.34
644	0.33
645	0.31
646	0.31
647	0.31
648	0.29
649	0.25
650	0.18
651	0.21
652	0.27
653	0.29
654	0.33
655	0.36
656	0.36
657	0.42
658	0.43
659	0.37
660	0.39
661	0.43
662	0.43
663	0.44
664	0.48
665	0.44
666	0.49
667	0.5
668	0.44
669	0.42
670	0.42
671	0.39
672	0.34
673	0.35
674	0.28
675	0.26
676	0.23
677	0.2
678	0.17
679	0.15
680	0.14
681	0.11
682	0.1
683	0.1
684	0.1
685	0.08
686	0.09
687	0.11
688	0.11
689	0.11
690	0.12
691	0.12
692	0.13
693	0.14
694	0.14
695	0.15
696	0.14
697	0.18
698	0.19
699	0.2
700	0.2
701	0.26
702	0.29
703	0.33
704	0.31
705	0.32
706	0.32
707	0.31
708	0.3
709	0.25
710	0.24
711	0.18
712	0.2
713	0.15
714	0.14
715	0.13
716	0.12
717	0.1
718	0.08
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.09
723	0.09
724	0.11
725	0.11
726	0.1
727	0.1
728	0.11
729	0.11
730	0.19
731	0.27
732	0.29
733	0.29
734	0.31
735	0.36
736	0.35
737	0.35
738	0.26
739	0.2
740	0.17
741	0.17
742	0.18
743	0.11
744	0.11
745	0.12
746	0.11
747	0.11
748	0.13
749	0.12
750	0.1
751	0.15
752	0.14
753	0.16
754	0.17
755	0.16
756	0.16
757	0.2
758	0.2
759	0.19
760	0.19
761	0.18
762	0.16
763	0.15
764	0.15
765	0.12
766	0.16
767	0.15
768	0.16
769	0.16
770	0.16
771	0.17
772	0.17
773	0.16
774	0.16
775	0.15
776	0.15
777	0.15
778	0.15
779	0.15
780	0.16
781	0.2
782	0.19
783	0.19
784	0.16
785	0.16
786	0.16
787	0.16
788	0.14
789	0.11
790	0.08
791	0.07
792	0.06
793	0.08
794	0.08
795	0.1
796	0.1
797	0.1
798	0.11
799	0.11
800	0.13
801	0.15
802	0.16
803	0.18
804	0.21
805	0.22
806	0.22
807	0.27
808	0.26
809	0.24
810	0.26
811	0.26
812	0.25
813	0.25
814	0.26
815	0.21
816	0.26
817	0.25
818	0.21
819	0.19
820	0.17
821	0.14
822	0.13
823	0.12
824	0.08
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.06
829	0.09
830	0.08
831	0.08
832	0.1
833	0.1
834	0.1
835	0.11
836	0.11
837	0.14
838	0.14
839	0.14
840	0.12
841	0.12
842	0.13
843	0.12
844	0.11
845	0.06
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.08
850	0.08
851	0.08
852	0.09
853	0.09
854	0.07
855	0.08
856	0.07
857	0.08
858	0.08
859	0.1
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.09
864	0.09
865	0.09
866	0.08
867	0.06
868	0.09
869	0.09
870	0.1
871	0.11
872	0.13
873	0.14
874	0.18
875	0.23
876	0.27
877	0.32
878	0.41
879	0.46
880	0.5
881	0.59
882	0.6
883	0.6
884	0.57
885	0.56
886	0.55
887	0.52
888	0.45
889	0.36
890	0.3
891	0.25
892	0.21
893	0.17
894	0.09
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.08
901	0.09
902	0.16
903	0.19
904	0.22
905	0.23
906	0.25
907	0.25
908	0.27
909	0.29
910	0.25
911	0.27
912	0.24
913	0.23
914	0.22
915	0.21
916	0.18
917	0.15
918	0.11
919	0.06
920	0.06
921	0.05
922	0.05
923	0.06
924	0.07
925	0.07
926	0.08
927	0.08
928	0.1
929	0.1
930	0.1
931	0.11
932	0.09
933	0.1
934	0.09
935	0.08
936	0.07
937	0.07
938	0.09
939	0.07
940	0.07
941	0.07
942	0.09
943	0.1
944	0.11
945	0.14
946	0.18
947	0.22
948	0.23
949	0.24
950	0.3
951	0.32
952	0.31
953	0.29
954	0.27
955	0.29
956	0.32
957	0.33
958	0.28
959	0.26
960	0.27
961	0.26
962	0.26
963	0.22
964	0.21
965	0.21
966	0.26
967	0.27
968	0.28
969	0.36
970	0.37
971	0.42
972	0.47
973	0.54
974	0.5
975	0.54
976	0.58
977	0.51
978	0.48
979	0.42
980	0.34
981	0.26
982	0.23
983	0.17
984	0.11
985	0.11
986	0.09
987	0.09
988	0.08
989	0.08
990	0.1
991	0.11
992	0.13
993	0.14
994	0.16
995	0.17
996	0.18
997	0.17
998	0.16
999	0.16
1000	0.14
1001	0.12
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.11
1005	0.12
1006	0.12
1007	0.11
1008	0.11
1009	0.17
1010	0.25
1011	0.27
1012	0.27
1013	0.34
1014	0.45
1015	0.52
1016	0.57
1017	0.59
1018	0.61
1019	0.68
1020	0.78
1021	0.81
1022	0.81
1023	0.81
1024	0.85
1025	0.84
1026	0.76
1027	0.66
1028	0.55
1029	0.47
1030	0.39
1031	0.33
1032	0.23
1033	0.16
1034	0.14
1035	0.15
1036	0.15
1037	0.12
1038	0.12
1039	0.18
1040	0.27
1041	0.31
1042	0.32
1043	0.34
1044	0.35
1045	0.38
1046	0.41
1047	0.44
1048	0.36
1049	0.4
1050	0.45
1051	0.45
1052	0.46
1053	0.44
1054	0.41
1055	0.32
1056	0.32
1057	0.27
1058	0.23
1059	0.19
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.13
1063	0.13
1064	0.1
1065	0.12
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.12
1070	0.13
1071	0.14
1072	0.17
1073	0.17
1074	0.17
1075	0.18
1076	0.19
1077	0.25
1078	0.23
1079	0.22
1080	0.21
1081	0.18
1082	0.19
1083	0.21
1084	0.22
1085	0.16
1086	0.18
1087	0.18
1088	0.18
1089	0.2
1090	0.21
1091	0.19
1092	0.19
1093	0.2
1094	0.19
1095	0.19
1096	0.17
1097	0.16
1098	0.14
1099	0.12
1100	0.15
1101	0.16
1102	0.26
1103	0.26
1104	0.31
1105	0.31
1106	0.3
1107	0.3
1108	0.32
1109	0.34
1110	0.28
1111	0.29
1112	0.28
1113	0.33
1114	0.34
1115	0.34
1116	0.3
1117	0.29
1118	0.31
1119	0.3
1120	0.3
1121	0.29
1122	0.31
1123	0.33
1124	0.38
1125	0.36
1126	0.35
1127	0.38
1128	0.42
1129	0.39
1130	0.41
1131	0.42
1132	0.38
1133	0.37
1134	0.36
1135	0.31
1136	0.25
1137	0.25
1138	0.25
1139	0.21
1140	0.22
1141	0.22
1142	0.25
1143	0.25
1144	0.26
1145	0.25
1146	0.21
1147	0.22
1148	0.23
1149	0.21
1150	0.16
1151	0.14
1152	0.14
1153	0.13
1154	0.14
1155	0.12
1156	0.1
1157	0.1
1158	0.1
1159	0.12
1160	0.12
1161	0.12
1162	0.14
1163	0.19
1164	0.2
1165	0.24
1166	0.31
1167	0.37
1168	0.41
1169	0.48
1170	0.54
1171	0.6
1172	0.68
1173	0.71
1174	0.74
1175	0.78
1176	0.84
1177	0.86
1178	0.88
1179	0.89
1180	0.88
1181	0.84
1182	0.85
1183	0.78
1184	0.73
1185	0.66
1186	0.59
1187	0.53
1188	0.49
1189	0.45
1190	0.37
1191	0.39
1192	0.39
1193	0.4
1194	0.36
1195	0.39
1196	0.45
1197	0.44
1198	0.46
1199	0.42
1200	0.37
1201	0.36

A0A1Y1ZDQ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer