Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Y4F5

Protein Details
Accession A0A1Y1Y4F5    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-236LFAIKIPKRYYKPKKTVTAPLPHydrophilic
408-433KSSHHEQKSAKKTKKTSKKAIIQVEAHydrophilic
511-535LTVSRVRSGKKKKSKKEFSETIRSSHydrophilic
1065-1084QLGHMKTNKKCPKYNSANNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-426SAKKTKKTSKK
517-526RSGKKKKSKK
1005-1009RMKKR
1024-1024R
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR009067  TAF_II_230-bd  
IPR036741  TAFII-230_TBP-bd_sf  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF09247  TBP-binding  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MSFAGYLFGNIDEKGHLDNTDLDKELRESLEKVAEDGDSRLLDQFFSVSSLGLDQEDGYDKSEVASEADVTDVEDSTDQVKHVEDAVDYSDFNEPADDYSDINEPADDQMFSNKYFQRGMKAVDSGDGNLRKLSRFSNVSSDLDDDYDADNSNVENKQTISLAEIQMTQEPAMSTIAPSELMKQSKPTEVEQPPIDVKVLYPAFEKDKILKFSELFAIKIPKRYYKPKKTVTAPLPQELSYTTDDQELFEAPLKNEITVNGLQQLRESFGDFSISATEKTSSITPLPESEEAAEEIQSKAEALKADFKVPEMYHSVVLDSWEDKIVWASDEDDESVELEPSTDTQTQKEAGLLNDVFSFRNYDVEDGDWTESIIWDPEEPFVPCTKLILDLNDTNMLFDTTSNLDVHKSSHHEQKSAKKTKKTSKKAIIQVEAPRLDPKSKAAVDKFNLSNDRYYEALKKRRVRQTFGQLNVQHSLPALKLQSPFFKSKLTKGDLRSFHRPSAQFPHNVLLTVSRVRSGKKKKSKKEFSETIRSSKDLSLKDRSNYILLEFSEEYPSIIQNIGMGSLLINYYRKRDNDDEEVPQLDIGDPFILDVADASPFMNFGNVEPGQTVQTLYNNLMRAPLFKQPARESDFLLIRHTYRGVAKYYIREIPYLFVVGQTYPVQEVPGPHSRKITTTIKNRLQVAAYRLIKKDAQHVLRVSKLAKAFPEYSEGQIRQRLKEFAEFQRKGDVNGCWKLKPHVPLPSEEDIRKMVTPEMVCLYESMLVGQRHLQDAGYGKSADDEEENNEDSESKLDIEEQLAPWITTRNFIYATQGKAMLKLYGPGDPTGRGEGFSFIRVSMKDIFLRAGESAEEKLAEIEARPKSAHRYNVAEQQQIYREEITRIWNAQFKALSSTEEPSLSEDDSEDNLDDDLQSSSHLRSRSPSVCSVDDDLSVSGVGSQNKLLVIKRLVRDKNGETSWQSEVVKDPVVMNAYLRQRQLIEEQTTSVEMLEPTDDEEKNRRMKKRIQDHLATLKRNQERRLARAKAREATLSSLKSNSILSSSTPTKSGKNLPRRCGNCGQLGHMKTNKKCPKYNSANNSGVSTPIPIGDQNDLIQDDEPSIRVEGTRISIPKHVIQKVSDNMRSGIFNSKRKRSDESDVEDSLDSPQPPKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.14
5 0.21
6 0.25
7 0.28
8 0.29
9 0.27
10 0.27
11 0.29
12 0.3
13 0.26
14 0.24
15 0.22
16 0.24
17 0.3
18 0.28
19 0.27
20 0.25
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.15
26 0.16
27 0.18
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.14
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.08
42 0.09
43 0.13
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.17
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.1
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.14
70 0.15
71 0.12
72 0.13
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.12
82 0.13
83 0.16
84 0.15
85 0.12
86 0.14
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.13
95 0.11
96 0.17
97 0.19
98 0.21
99 0.27
100 0.27
101 0.29
102 0.33
103 0.34
104 0.35
105 0.37
106 0.4
107 0.38
108 0.37
109 0.35
110 0.32
111 0.32
112 0.26
113 0.3
114 0.28
115 0.25
116 0.25
117 0.26
118 0.25
119 0.26
120 0.27
121 0.26
122 0.28
123 0.3
124 0.35
125 0.39
126 0.39
127 0.38
128 0.38
129 0.31
130 0.28
131 0.25
132 0.18
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.15
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.19
154 0.2
155 0.16
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.13
167 0.18
168 0.2
169 0.21
170 0.25
171 0.27
172 0.32
173 0.35
174 0.33
175 0.37
176 0.38
177 0.43
178 0.39
179 0.41
180 0.36
181 0.35
182 0.32
183 0.22
184 0.19
185 0.22
186 0.21
187 0.18
188 0.18
189 0.2
190 0.24
191 0.26
192 0.28
193 0.26
194 0.33
195 0.36
196 0.38
197 0.38
198 0.34
199 0.34
200 0.39
201 0.34
202 0.27
203 0.27
204 0.33
205 0.32
206 0.38
207 0.39
208 0.41
209 0.46
210 0.57
211 0.64
212 0.67
213 0.75
214 0.77
215 0.82
216 0.8
217 0.84
218 0.79
219 0.78
220 0.71
221 0.65
222 0.58
223 0.49
224 0.44
225 0.34
226 0.31
227 0.24
228 0.21
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.15
235 0.13
236 0.16
237 0.18
238 0.15
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.2
243 0.19
244 0.19
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.2
251 0.2
252 0.18
253 0.17
254 0.18
255 0.13
256 0.12
257 0.15
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.19
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.18
291 0.19
292 0.22
293 0.22
294 0.23
295 0.25
296 0.24
297 0.26
298 0.21
299 0.22
300 0.2
301 0.2
302 0.19
303 0.15
304 0.16
305 0.14
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.1
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.16
333 0.17
334 0.17
335 0.18
336 0.16
337 0.13
338 0.17
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.16
343 0.15
344 0.13
345 0.15
346 0.1
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.17
377 0.16
378 0.18
379 0.21
380 0.2
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.17
396 0.19
397 0.28
398 0.29
399 0.33
400 0.38
401 0.47
402 0.55
403 0.59
404 0.63
405 0.62
406 0.69
407 0.75
408 0.81
409 0.81
410 0.8
411 0.8
412 0.82
413 0.82
414 0.81
415 0.73
416 0.68
417 0.63
418 0.59
419 0.5
420 0.42
421 0.36
422 0.3
423 0.28
424 0.23
425 0.2
426 0.21
427 0.22
428 0.27
429 0.28
430 0.33
431 0.34
432 0.39
433 0.37
434 0.35
435 0.36
436 0.32
437 0.31
438 0.25
439 0.25
440 0.2
441 0.21
442 0.24
443 0.29
444 0.37
445 0.43
446 0.49
447 0.56
448 0.65
449 0.68
450 0.66
451 0.66
452 0.68
453 0.68
454 0.64
455 0.63
456 0.55
457 0.53
458 0.48
459 0.4
460 0.29
461 0.21
462 0.19
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.11
467 0.13
468 0.15
469 0.2
470 0.23
471 0.26
472 0.25
473 0.3
474 0.29
475 0.32
476 0.38
477 0.37
478 0.38
479 0.4
480 0.48
481 0.48
482 0.52
483 0.55
484 0.51
485 0.49
486 0.49
487 0.45
488 0.41
489 0.42
490 0.4
491 0.35
492 0.33
493 0.34
494 0.28
495 0.28
496 0.24
497 0.17
498 0.15
499 0.14
500 0.13
501 0.12
502 0.13
503 0.15
504 0.24
505 0.33
506 0.41
507 0.5
508 0.6
509 0.67
510 0.78
511 0.87
512 0.86
513 0.86
514 0.84
515 0.8
516 0.8
517 0.73
518 0.67
519 0.58
520 0.5
521 0.42
522 0.37
523 0.36
524 0.28
525 0.3
526 0.32
527 0.32
528 0.33
529 0.33
530 0.31
531 0.26
532 0.23
533 0.2
534 0.15
535 0.12
536 0.15
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.12
542 0.1
543 0.1
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.04
552 0.03
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.06
557 0.06
558 0.09
559 0.13
560 0.14
561 0.19
562 0.22
563 0.26
564 0.31
565 0.33
566 0.33
567 0.31
568 0.31
569 0.26
570 0.22
571 0.18
572 0.11
573 0.08
574 0.06
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.04
586 0.03
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.06
601 0.08
602 0.09
603 0.1
604 0.12
605 0.12
606 0.12
607 0.13
608 0.12
609 0.13
610 0.14
611 0.18
612 0.2
613 0.2
614 0.25
615 0.25
616 0.31
617 0.35
618 0.34
619 0.3
620 0.3
621 0.32
622 0.28
623 0.27
624 0.23
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.14
629 0.13
630 0.15
631 0.15
632 0.17
633 0.19
634 0.2
635 0.23
636 0.26
637 0.24
638 0.23
639 0.21
640 0.19
641 0.17
642 0.16
643 0.12
644 0.09
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.09
655 0.13
656 0.21
657 0.23
658 0.24
659 0.27
660 0.27
661 0.28
662 0.33
663 0.36
664 0.35
665 0.42
666 0.5
667 0.54
668 0.57
669 0.57
670 0.52
671 0.45
672 0.4
673 0.35
674 0.34
675 0.32
676 0.31
677 0.31
678 0.32
679 0.32
680 0.3
681 0.34
682 0.33
683 0.31
684 0.32
685 0.34
686 0.34
687 0.34
688 0.36
689 0.28
690 0.25
691 0.24
692 0.21
693 0.19
694 0.21
695 0.21
696 0.19
697 0.23
698 0.2
699 0.21
700 0.25
701 0.25
702 0.23
703 0.28
704 0.29
705 0.27
706 0.29
707 0.29
708 0.25
709 0.3
710 0.33
711 0.36
712 0.45
713 0.43
714 0.41
715 0.47
716 0.46
717 0.41
718 0.4
719 0.34
720 0.3
721 0.36
722 0.37
723 0.29
724 0.31
725 0.32
726 0.33
727 0.34
728 0.32
729 0.34
730 0.34
731 0.36
732 0.41
733 0.43
734 0.42
735 0.38
736 0.35
737 0.27
738 0.27
739 0.25
740 0.19
741 0.15
742 0.15
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.15
747 0.14
748 0.13
749 0.13
750 0.11
751 0.11
752 0.1
753 0.13
754 0.13
755 0.13
756 0.16
757 0.16
758 0.16
759 0.16
760 0.15
761 0.12
762 0.14
763 0.16
764 0.15
765 0.14
766 0.13
767 0.13
768 0.14
769 0.13
770 0.11
771 0.1
772 0.11
773 0.14
774 0.15
775 0.14
776 0.14
777 0.13
778 0.12
779 0.12
780 0.1
781 0.08
782 0.07
783 0.07
784 0.08
785 0.09
786 0.11
787 0.1
788 0.11
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.14
793 0.12
794 0.13
795 0.14
796 0.14
797 0.15
798 0.16
799 0.23
800 0.23
801 0.25
802 0.24
803 0.26
804 0.24
805 0.24
806 0.25
807 0.19
808 0.15
809 0.16
810 0.15
811 0.15
812 0.16
813 0.15
814 0.16
815 0.16
816 0.17
817 0.17
818 0.17
819 0.15
820 0.14
821 0.16
822 0.15
823 0.16
824 0.15
825 0.12
826 0.14
827 0.13
828 0.16
829 0.16
830 0.17
831 0.17
832 0.17
833 0.18
834 0.16
835 0.17
836 0.14
837 0.12
838 0.1
839 0.1
840 0.1
841 0.1
842 0.1
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.07
848 0.13
849 0.14
850 0.16
851 0.16
852 0.18
853 0.25
854 0.3
855 0.36
856 0.34
857 0.39
858 0.42
859 0.51
860 0.53
861 0.49
862 0.44
863 0.42
864 0.42
865 0.36
866 0.34
867 0.27
868 0.24
869 0.22
870 0.23
871 0.24
872 0.23
873 0.23
874 0.24
875 0.27
876 0.26
877 0.28
878 0.27
879 0.23
880 0.25
881 0.24
882 0.24
883 0.21
884 0.23
885 0.2
886 0.2
887 0.2
888 0.17
889 0.18
890 0.15
891 0.14
892 0.12
893 0.12
894 0.12
895 0.13
896 0.11
897 0.1
898 0.09
899 0.09
900 0.09
901 0.08
902 0.07
903 0.06
904 0.07
905 0.08
906 0.1
907 0.14
908 0.15
909 0.15
910 0.18
911 0.26
912 0.3
913 0.32
914 0.37
915 0.38
916 0.39
917 0.41
918 0.41
919 0.34
920 0.3
921 0.27
922 0.21
923 0.16
924 0.14
925 0.11
926 0.09
927 0.11
928 0.11
929 0.11
930 0.11
931 0.12
932 0.13
933 0.15
934 0.15
935 0.17
936 0.22
937 0.28
938 0.32
939 0.41
940 0.43
941 0.46
942 0.51
943 0.5
944 0.53
945 0.48
946 0.48
947 0.4
948 0.41
949 0.39
950 0.37
951 0.33
952 0.25
953 0.26
954 0.24
955 0.24
956 0.21
957 0.19
958 0.17
959 0.19
960 0.18
961 0.16
962 0.2
963 0.25
964 0.28
965 0.28
966 0.27
967 0.26
968 0.28
969 0.33
970 0.34
971 0.32
972 0.29
973 0.3
974 0.29
975 0.29
976 0.27
977 0.21
978 0.14
979 0.1
980 0.1
981 0.09
982 0.08
983 0.1
984 0.15
985 0.15
986 0.17
987 0.24
988 0.3
989 0.39
990 0.47
991 0.51
992 0.55
993 0.64
994 0.71
995 0.75
996 0.79
997 0.78
998 0.76
999 0.77
1000 0.8
1001 0.79
1002 0.72
1003 0.65
1004 0.63
1005 0.63
1006 0.63
1007 0.59
1008 0.57
1009 0.57
1010 0.62
1011 0.68
1012 0.67
1013 0.67
1014 0.7
1015 0.74
1016 0.7
1017 0.66
1018 0.61
1019 0.53
1020 0.51
1021 0.5
1022 0.44
1023 0.38
1024 0.33
1025 0.31
1026 0.28
1027 0.27
1028 0.21
1029 0.16
1030 0.14
1031 0.14
1032 0.2
1033 0.23
1034 0.23
1035 0.26
1036 0.27
1037 0.28
1038 0.33
1039 0.42
1040 0.45
1041 0.52
1042 0.6
1043 0.65
1044 0.73
1045 0.75
1046 0.76
1047 0.75
1048 0.7
1049 0.67
1050 0.61
1051 0.58
1052 0.57
1053 0.56
1054 0.56
1055 0.54
1056 0.57
1057 0.54
1058 0.63
1059 0.66
1060 0.65
1061 0.69
1062 0.69
1063 0.73
1064 0.76
1065 0.81
1066 0.79
1067 0.79
1068 0.77
1069 0.71
1070 0.67
1071 0.56
1072 0.47
1073 0.37
1074 0.29
1075 0.21
1076 0.15
1077 0.15
1078 0.13
1079 0.15
1080 0.16
1081 0.17
1082 0.16
1083 0.19
1084 0.19
1085 0.19
1086 0.18
1087 0.16
1088 0.15
1089 0.15
1090 0.15
1091 0.13
1092 0.13
1093 0.13
1094 0.12
1095 0.13
1096 0.14
1097 0.16
1098 0.22
1099 0.23
1100 0.25
1101 0.29
1102 0.33
1103 0.39
1104 0.45
1105 0.46
1106 0.44
1107 0.45
1108 0.5
1109 0.54
1110 0.59
1111 0.57
1112 0.5
1113 0.47
1114 0.45
1115 0.43
1116 0.37
1117 0.39
1118 0.38
1119 0.43
1120 0.49
1121 0.58
1122 0.63
1123 0.66
1124 0.71
1125 0.68
1126 0.7
1127 0.7
1128 0.7
1129 0.66
1130 0.6
1131 0.58
1132 0.51
1133 0.44
1134 0.38
1135 0.33
1136 0.25