Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YA67

Protein Details
Accession A0A1Y1YA67    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-153ISNTLCYGKSKPRTRRKKRRPRIHDEVTNEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-144KSKPRTRRKKRRPR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MGCFCLPALPSFLDHLNNFEIPPEFLDVFDEAHCPYYEGCIIAEIHDHRPIRAQAELTSDIRVEVYKIVLHPTSETIWADLCLMNEMRDAVWSEDFSLQVESKILLATEAPLCLDPSFQVTRISNTLCYGKSKPRTRRKKRRPRIHDEVTNEVAEREEYTRLLMMMDERYQRNFQPSYQIVRTLRFESETGGRKTYTLLNVYHDPTTSHYEGMLRSGRTLDTSLEGNTTKFYIGPKDVLEDYISNVKKIYGLDNKLISDHSIYTHNTAQRTQTRQGPSPDALTSVQTSTLTEPSPAQNHILARSHSAARMSSLSQPNTQPSLQTATHGNNPGQAQINPHSTSHVTSSTAPTTSLRTESRVQTNLETSAQSSIAQVLGAMSLQQIALNGNPATLQSLSELTPQQMNHLKLQLLRKKQLLMQRQMQQQQNGLNLSSTHQAQQQTRSVQQTFGRAPMSQYPALTTTSASLAAQTKSLSSETPASLQSAATRQFPLKTTNPALQGQSVALSNGVSPQMLATIAQQRTQLLLQQQLRQQLLASERNINPANLSATGIPNSLGWATYPEDGLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.25
4 0.25
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.18
9 0.2
10 0.21
11 0.17
12 0.16
13 0.19
14 0.17
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.12
19 0.15
20 0.15
21 0.14
22 0.13
23 0.15
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.2
31 0.19
32 0.21
33 0.27
34 0.28
35 0.26
36 0.32
37 0.34
38 0.32
39 0.32
40 0.3
41 0.26
42 0.32
43 0.36
44 0.3
45 0.29
46 0.26
47 0.23
48 0.21
49 0.19
50 0.14
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.16
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.08
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.19
107 0.19
108 0.22
109 0.26
110 0.27
111 0.23
112 0.24
113 0.27
114 0.23
115 0.27
116 0.28
117 0.34
118 0.42
119 0.51
120 0.59
121 0.66
122 0.76
123 0.83
124 0.9
125 0.92
126 0.94
127 0.96
128 0.96
129 0.96
130 0.95
131 0.93
132 0.92
133 0.88
134 0.82
135 0.78
136 0.69
137 0.59
138 0.49
139 0.38
140 0.29
141 0.21
142 0.17
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.14
154 0.18
155 0.19
156 0.22
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.28
161 0.25
162 0.29
163 0.31
164 0.35
165 0.35
166 0.4
167 0.35
168 0.37
169 0.4
170 0.33
171 0.31
172 0.25
173 0.24
174 0.2
175 0.25
176 0.29
177 0.28
178 0.27
179 0.26
180 0.25
181 0.26
182 0.27
183 0.24
184 0.21
185 0.2
186 0.22
187 0.25
188 0.27
189 0.26
190 0.22
191 0.19
192 0.19
193 0.24
194 0.21
195 0.18
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.21
200 0.21
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.12
228 0.12
229 0.18
230 0.18
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.16
236 0.2
237 0.19
238 0.22
239 0.25
240 0.27
241 0.27
242 0.26
243 0.25
244 0.19
245 0.14
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.14
251 0.17
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.23
256 0.26
257 0.31
258 0.31
259 0.34
260 0.36
261 0.39
262 0.41
263 0.39
264 0.34
265 0.31
266 0.28
267 0.24
268 0.2
269 0.17
270 0.14
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.16
287 0.18
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.17
299 0.21
300 0.22
301 0.24
302 0.25
303 0.26
304 0.27
305 0.26
306 0.19
307 0.16
308 0.2
309 0.17
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.21
314 0.23
315 0.22
316 0.2
317 0.2
318 0.21
319 0.21
320 0.19
321 0.18
322 0.2
323 0.24
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.2
328 0.21
329 0.2
330 0.17
331 0.14
332 0.14
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.16
337 0.14
338 0.16
339 0.15
340 0.18
341 0.16
342 0.18
343 0.22
344 0.26
345 0.3
346 0.31
347 0.31
348 0.29
349 0.3
350 0.28
351 0.25
352 0.21
353 0.16
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.12
385 0.13
386 0.12
387 0.15
388 0.15
389 0.19
390 0.24
391 0.26
392 0.26
393 0.27
394 0.28
395 0.3
396 0.39
397 0.42
398 0.43
399 0.45
400 0.45
401 0.45
402 0.48
403 0.52
404 0.52
405 0.51
406 0.52
407 0.55
408 0.6
409 0.65
410 0.65
411 0.59
412 0.53
413 0.49
414 0.45
415 0.39
416 0.31
417 0.25
418 0.21
419 0.2
420 0.19
421 0.17
422 0.15
423 0.17
424 0.22
425 0.25
426 0.3
427 0.35
428 0.36
429 0.4
430 0.44
431 0.41
432 0.41
433 0.41
434 0.42
435 0.37
436 0.36
437 0.33
438 0.28
439 0.3
440 0.31
441 0.34
442 0.29
443 0.27
444 0.25
445 0.25
446 0.26
447 0.24
448 0.18
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.14
458 0.13
459 0.15
460 0.16
461 0.14
462 0.13
463 0.17
464 0.17
465 0.19
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.18
470 0.18
471 0.19
472 0.2
473 0.2
474 0.22
475 0.23
476 0.25
477 0.27
478 0.31
479 0.3
480 0.36
481 0.38
482 0.41
483 0.43
484 0.43
485 0.43
486 0.38
487 0.35
488 0.27
489 0.24
490 0.19
491 0.15
492 0.12
493 0.1
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.1
504 0.19
505 0.2
506 0.22
507 0.23
508 0.23
509 0.26
510 0.26
511 0.26
512 0.22
513 0.3
514 0.33
515 0.38
516 0.41
517 0.46
518 0.46
519 0.42
520 0.38
521 0.33
522 0.35
523 0.35
524 0.34
525 0.35
526 0.35
527 0.42
528 0.43
529 0.39
530 0.34
531 0.3
532 0.31
533 0.23
534 0.24
535 0.19
536 0.2
537 0.21
538 0.2
539 0.18
540 0.15
541 0.16
542 0.14
543 0.12
544 0.1
545 0.12
546 0.14
547 0.15