Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XUW5

Protein Details
Accession A0A1Y1XUW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
699-720MYGGKGPRQPPTKRHRDGPDMIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
661-688RGGRGGNFSKRGRGAGPASGGMKRKPLR
Subcellular Location(s) cyto 8.5cyto_nucl 8.5, nucl 7.5, pero 6, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045243  Rna14-like  
IPR008847  Suf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05843  Suf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MNSGENGSAAGPDVRAVVGKAYEFVLQHIGIDKEAGPIWSDYIFFLRTGETHNTWEEQQKMDLMRKTYQKAIAIPLVNVEHIWKEYDSFENGLNKLTAKKFLAERSPSYMTARTALREMRTITDTFAKNVLPQPPQWTDREIQQLEAWKHYLTWERSNPLQLEDKGALSARVIYAYKQALIALRFYPEIWYDLAIYCAENGKTEEAITHLKASIEVIPTSLLLHFAYCELEESRKNNARARELYEALLKNIEKHMEEIRASGAQEINALVQTLASQGNEIEEDTERERDGEDRERLRVKERNTEKQKAKVEARVEKALLSVKKAYTLVWIMFMKYARRAEGIKAARQIFSRARKAADTTYHLFISSALMEYYCSKDQNIAGKIFELGLKTYAVEPGYVLQYLEYLIQMNDDNNIRALFERALTSLSSEQAVDIWKKFTDYENKYGDLTSVQKIERRMTETYTSETALGRFVDRYSYLDINYITESELGIMPGDDKKSKSRSLLLKNIEPMMVERSKDLNARQHGRRALLDPIHPERYPRPDFNQWTSYKPPVDSLRRGQSGARGQSPLPTAPSGASAPAGNSARAVIPPGVPDAVGYFMAQLPPAQTYNGPIINVDDLMNLILNTVIPGQLNPPTAPAHMRGATPPTGPAGPPTGPMYAGRGGRGGNFSKRGRGAGPASGGMKRKPLREPESNYDGPDMYGGKGPRQPPTKRHRDGPDMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.16
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.16
14 0.17
15 0.2
16 0.19
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.18
36 0.23
37 0.23
38 0.25
39 0.27
40 0.29
41 0.31
42 0.37
43 0.34
44 0.3
45 0.29
46 0.31
47 0.32
48 0.37
49 0.39
50 0.37
51 0.41
52 0.46
53 0.48
54 0.5
55 0.51
56 0.48
57 0.46
58 0.48
59 0.48
60 0.42
61 0.38
62 0.35
63 0.31
64 0.27
65 0.24
66 0.2
67 0.15
68 0.14
69 0.16
70 0.13
71 0.13
72 0.16
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.23
77 0.26
78 0.26
79 0.26
80 0.25
81 0.23
82 0.26
83 0.27
84 0.29
85 0.25
86 0.29
87 0.32
88 0.38
89 0.45
90 0.45
91 0.46
92 0.48
93 0.5
94 0.47
95 0.46
96 0.43
97 0.35
98 0.34
99 0.32
100 0.27
101 0.27
102 0.29
103 0.27
104 0.28
105 0.28
106 0.28
107 0.29
108 0.28
109 0.26
110 0.3
111 0.29
112 0.27
113 0.27
114 0.24
115 0.24
116 0.28
117 0.32
118 0.27
119 0.28
120 0.33
121 0.37
122 0.4
123 0.39
124 0.38
125 0.33
126 0.37
127 0.45
128 0.38
129 0.34
130 0.34
131 0.4
132 0.37
133 0.38
134 0.33
135 0.24
136 0.23
137 0.25
138 0.31
139 0.27
140 0.34
141 0.36
142 0.39
143 0.41
144 0.46
145 0.44
146 0.39
147 0.41
148 0.33
149 0.33
150 0.3
151 0.28
152 0.24
153 0.23
154 0.2
155 0.13
156 0.14
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.18
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.1
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.14
219 0.16
220 0.24
221 0.31
222 0.34
223 0.37
224 0.41
225 0.45
226 0.45
227 0.48
228 0.45
229 0.4
230 0.38
231 0.39
232 0.35
233 0.28
234 0.29
235 0.23
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.14
240 0.16
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.13
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.14
277 0.19
278 0.24
279 0.25
280 0.29
281 0.33
282 0.34
283 0.38
284 0.4
285 0.36
286 0.4
287 0.45
288 0.52
289 0.56
290 0.64
291 0.62
292 0.66
293 0.68
294 0.65
295 0.61
296 0.56
297 0.55
298 0.53
299 0.52
300 0.46
301 0.41
302 0.34
303 0.32
304 0.31
305 0.25
306 0.2
307 0.19
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.17
312 0.14
313 0.15
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.14
319 0.15
320 0.14
321 0.17
322 0.17
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.24
328 0.26
329 0.25
330 0.29
331 0.29
332 0.29
333 0.28
334 0.31
335 0.29
336 0.33
337 0.35
338 0.31
339 0.31
340 0.3
341 0.32
342 0.31
343 0.28
344 0.26
345 0.24
346 0.24
347 0.23
348 0.22
349 0.2
350 0.17
351 0.15
352 0.1
353 0.07
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.12
363 0.14
364 0.2
365 0.22
366 0.2
367 0.19
368 0.19
369 0.19
370 0.17
371 0.16
372 0.1
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.16
425 0.24
426 0.27
427 0.34
428 0.35
429 0.36
430 0.36
431 0.35
432 0.31
433 0.23
434 0.21
435 0.16
436 0.16
437 0.16
438 0.18
439 0.2
440 0.23
441 0.24
442 0.26
443 0.25
444 0.25
445 0.29
446 0.28
447 0.29
448 0.27
449 0.25
450 0.21
451 0.2
452 0.17
453 0.14
454 0.13
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.12
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.16
468 0.14
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.06
478 0.08
479 0.1
480 0.11
481 0.13
482 0.19
483 0.24
484 0.27
485 0.29
486 0.35
487 0.42
488 0.49
489 0.56
490 0.55
491 0.54
492 0.53
493 0.51
494 0.44
495 0.35
496 0.28
497 0.25
498 0.22
499 0.18
500 0.17
501 0.18
502 0.2
503 0.23
504 0.25
505 0.28
506 0.33
507 0.41
508 0.43
509 0.48
510 0.49
511 0.49
512 0.48
513 0.42
514 0.41
515 0.37
516 0.36
517 0.35
518 0.38
519 0.39
520 0.37
521 0.37
522 0.35
523 0.41
524 0.44
525 0.42
526 0.43
527 0.48
528 0.54
529 0.57
530 0.61
531 0.54
532 0.54
533 0.55
534 0.53
535 0.46
536 0.41
537 0.41
538 0.41
539 0.46
540 0.47
541 0.49
542 0.52
543 0.52
544 0.52
545 0.48
546 0.47
547 0.48
548 0.46
549 0.42
550 0.35
551 0.33
552 0.37
553 0.38
554 0.32
555 0.26
556 0.22
557 0.19
558 0.17
559 0.2
560 0.16
561 0.14
562 0.13
563 0.11
564 0.1
565 0.16
566 0.16
567 0.14
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.16
573 0.11
574 0.11
575 0.12
576 0.14
577 0.13
578 0.12
579 0.12
580 0.1
581 0.11
582 0.1
583 0.09
584 0.08
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.09
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.11
594 0.14
595 0.19
596 0.2
597 0.19
598 0.17
599 0.18
600 0.18
601 0.18
602 0.16
603 0.11
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.07
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.09
617 0.13
618 0.16
619 0.16
620 0.18
621 0.19
622 0.2
623 0.22
624 0.23
625 0.25
626 0.24
627 0.25
628 0.26
629 0.29
630 0.3
631 0.28
632 0.26
633 0.23
634 0.22
635 0.21
636 0.21
637 0.21
638 0.19
639 0.21
640 0.23
641 0.2
642 0.2
643 0.21
644 0.22
645 0.23
646 0.23
647 0.22
648 0.21
649 0.21
650 0.22
651 0.27
652 0.28
653 0.3
654 0.37
655 0.38
656 0.44
657 0.46
658 0.46
659 0.41
660 0.43
661 0.4
662 0.37
663 0.38
664 0.35
665 0.35
666 0.37
667 0.4
668 0.35
669 0.4
670 0.4
671 0.42
672 0.47
673 0.54
674 0.57
675 0.63
676 0.7
677 0.69
678 0.73
679 0.69
680 0.63
681 0.56
682 0.48
683 0.38
684 0.32
685 0.25
686 0.18
687 0.21
688 0.21
689 0.23
690 0.29
691 0.32
692 0.38
693 0.46
694 0.52
695 0.57
696 0.67
697 0.73
698 0.74
699 0.8
700 0.8