Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Z7V3

Protein Details
Accession A0A1Y1Z7V3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
478-509TSFSSKSGKTAKSRKKKEKRLRGKKGSVFEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
483-503KSGKTAKSRKKKEKRLRGKKG
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 10.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006849  Elp1  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF04762  IKI3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLVLQMPRGNLETIYPRAMVLSAVRESLDRLDYRSAFIDCRKHRLDLNILYDHSPDAFMENVGSVVTQIKDVDYLNLFLSSLSNEDVTVTMYPLIFDKTSHKKDQSKYTNKVNTICDAIRTQLNTLDTKKYMQPIITTYVKKSPPELEEALSLLREIKKQDPSAAEEALKYTIFLVDVNLLHDVALGMYDFELVLMVAQQSQKDPREYLPFLTELQQLEQYYQRYRIDDHLGRHQKALMNLNLAGNQYFEDCLEYVKKYNLYEYALELFTADADKHQAVLDIYGDFLHTKSQYEEAGIAYMMCGKLEKALEAYQRALCWQEVFALVHQLKYSESEIAALGRSLASQLKDKRLCKDAAVILLDYVKDPEEAVDTLTNGNLWSEALRIANLYDRSDLIETHIKPGLVESFNHLNEDISEMNDQLTKQTTRLAEIRAKKALEASEIEAVSDMLDNIDVMSDTTSMASEFSRYTKASTRVTSFSSKSGKTAKSRKKKEKRLRGKKGSVFEEEYLMDSLKRLILRFNIHQTESKSLVKHLALFGHLEKAREIQRRMSELHQSIHSSMDTIFVATIQPSQAEILVLQQTGMEPPTPVEKPVLLFEDWNMKFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.25
4 0.23
5 0.22
6 0.22
7 0.2
8 0.16
9 0.18
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.2
16 0.23
17 0.18
18 0.21
19 0.27
20 0.27
21 0.3
22 0.31
23 0.3
24 0.29
25 0.34
26 0.41
27 0.38
28 0.46
29 0.47
30 0.46
31 0.49
32 0.52
33 0.55
34 0.53
35 0.56
36 0.52
37 0.5
38 0.49
39 0.45
40 0.39
41 0.3
42 0.22
43 0.15
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.06
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.12
60 0.15
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.12
67 0.13
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.19
86 0.28
87 0.35
88 0.42
89 0.49
90 0.54
91 0.61
92 0.71
93 0.74
94 0.74
95 0.75
96 0.78
97 0.78
98 0.74
99 0.73
100 0.65
101 0.56
102 0.51
103 0.45
104 0.37
105 0.3
106 0.28
107 0.26
108 0.24
109 0.22
110 0.21
111 0.23
112 0.24
113 0.26
114 0.29
115 0.27
116 0.28
117 0.31
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.27
122 0.25
123 0.3
124 0.34
125 0.33
126 0.31
127 0.37
128 0.39
129 0.37
130 0.37
131 0.37
132 0.32
133 0.37
134 0.36
135 0.3
136 0.27
137 0.27
138 0.24
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.21
146 0.27
147 0.29
148 0.33
149 0.33
150 0.36
151 0.38
152 0.37
153 0.31
154 0.25
155 0.25
156 0.22
157 0.19
158 0.13
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.14
190 0.17
191 0.19
192 0.2
193 0.22
194 0.29
195 0.3
196 0.3
197 0.27
198 0.25
199 0.24
200 0.26
201 0.25
202 0.18
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.23
214 0.25
215 0.3
216 0.32
217 0.33
218 0.39
219 0.45
220 0.45
221 0.44
222 0.42
223 0.36
224 0.36
225 0.38
226 0.29
227 0.24
228 0.24
229 0.24
230 0.22
231 0.2
232 0.16
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.06
260 0.04
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.07
332 0.07
333 0.13
334 0.17
335 0.25
336 0.32
337 0.34
338 0.37
339 0.4
340 0.4
341 0.35
342 0.37
343 0.3
344 0.27
345 0.26
346 0.22
347 0.18
348 0.17
349 0.16
350 0.11
351 0.1
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.19
385 0.18
386 0.21
387 0.22
388 0.21
389 0.2
390 0.21
391 0.22
392 0.16
393 0.16
394 0.18
395 0.22
396 0.22
397 0.23
398 0.22
399 0.17
400 0.16
401 0.19
402 0.14
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.17
414 0.17
415 0.2
416 0.23
417 0.26
418 0.3
419 0.36
420 0.4
421 0.4
422 0.4
423 0.37
424 0.37
425 0.33
426 0.28
427 0.24
428 0.21
429 0.21
430 0.2
431 0.2
432 0.17
433 0.16
434 0.13
435 0.11
436 0.08
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.1
455 0.13
456 0.13
457 0.17
458 0.23
459 0.29
460 0.33
461 0.36
462 0.39
463 0.38
464 0.42
465 0.44
466 0.39
467 0.4
468 0.41
469 0.37
470 0.37
471 0.42
472 0.44
473 0.48
474 0.57
475 0.61
476 0.66
477 0.77
478 0.83
479 0.87
480 0.92
481 0.94
482 0.95
483 0.95
484 0.96
485 0.96
486 0.96
487 0.95
488 0.91
489 0.88
490 0.82
491 0.77
492 0.7
493 0.6
494 0.51
495 0.41
496 0.36
497 0.28
498 0.23
499 0.17
500 0.12
501 0.13
502 0.13
503 0.14
504 0.13
505 0.16
506 0.21
507 0.27
508 0.33
509 0.41
510 0.42
511 0.43
512 0.48
513 0.47
514 0.48
515 0.46
516 0.44
517 0.37
518 0.33
519 0.36
520 0.33
521 0.33
522 0.29
523 0.26
524 0.23
525 0.25
526 0.24
527 0.28
528 0.28
529 0.26
530 0.24
531 0.27
532 0.34
533 0.39
534 0.41
535 0.4
536 0.46
537 0.49
538 0.52
539 0.52
540 0.53
541 0.49
542 0.51
543 0.46
544 0.43
545 0.39
546 0.38
547 0.33
548 0.24
549 0.2
550 0.19
551 0.15
552 0.13
553 0.12
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.11
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.12
566 0.14
567 0.14
568 0.13
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.15
573 0.11
574 0.09
575 0.11
576 0.18
577 0.19
578 0.2
579 0.21
580 0.22
581 0.23
582 0.27
583 0.29
584 0.24
585 0.23
586 0.24
587 0.32