Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YNW3

Protein Details
Accession A0A1Y1YNW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-254QNYRTHAKKRPRVDTPKIDAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039847  Ubox5  
IPR045696  Ubox5_N  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF19318  DUF5918  
PF04564  U-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
Amino Acid Sequences MRLIDFACFPEFGVKLSSPSIARDGHELTTLLRTTKSESIGFLCERFVKPPVEITIEFKHPISLTGIVVNPKLGIHTLQVISFSASAGVSSEAGSQYTFCGKLEYQENKLKYIGCYNPDFQLDEVYEAMTKAGTKCISKQDLAPFSRGLHGLHNIKSLKITVLRVQKSGIPGLRYLEIWGQPSRRCALTLQQSVWDCWSERLQEIQQSSQDDEDLPEFTDPFLTSGGLRLLNSSQNYRTHAKKRPRVDTPKIDAIPNEFLDAITFELMSDPITLPSGNIFRGLPLVRHLETQANDPFTRLPMSLKDLTSNILLKNRIAKWSLDSVAKEQASPDEEPALAVCSNQASEGSLPSSLSSQSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.21
4 0.24
5 0.2
6 0.22
7 0.25
8 0.23
9 0.23
10 0.26
11 0.27
12 0.25
13 0.26
14 0.24
15 0.21
16 0.24
17 0.24
18 0.21
19 0.19
20 0.19
21 0.22
22 0.26
23 0.29
24 0.24
25 0.25
26 0.27
27 0.31
28 0.31
29 0.26
30 0.24
31 0.25
32 0.25
33 0.26
34 0.27
35 0.24
36 0.23
37 0.28
38 0.29
39 0.3
40 0.3
41 0.32
42 0.34
43 0.35
44 0.36
45 0.31
46 0.3
47 0.24
48 0.24
49 0.22
50 0.19
51 0.16
52 0.17
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.15
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.12
88 0.11
89 0.16
90 0.24
91 0.27
92 0.31
93 0.38
94 0.39
95 0.38
96 0.4
97 0.37
98 0.3
99 0.32
100 0.3
101 0.27
102 0.29
103 0.29
104 0.3
105 0.29
106 0.29
107 0.22
108 0.21
109 0.17
110 0.15
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.06
117 0.07
118 0.06
119 0.09
120 0.11
121 0.12
122 0.15
123 0.22
124 0.25
125 0.25
126 0.29
127 0.33
128 0.39
129 0.39
130 0.38
131 0.32
132 0.29
133 0.31
134 0.27
135 0.2
136 0.15
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.25
141 0.24
142 0.23
143 0.23
144 0.21
145 0.18
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.25
150 0.27
151 0.27
152 0.27
153 0.27
154 0.26
155 0.28
156 0.24
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.17
172 0.17
173 0.15
174 0.2
175 0.26
176 0.28
177 0.27
178 0.3
179 0.3
180 0.29
181 0.29
182 0.24
183 0.15
184 0.14
185 0.15
186 0.12
187 0.12
188 0.15
189 0.15
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.17
197 0.16
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.14
219 0.15
220 0.17
221 0.19
222 0.21
223 0.25
224 0.28
225 0.35
226 0.39
227 0.47
228 0.55
229 0.59
230 0.66
231 0.7
232 0.76
233 0.79
234 0.8
235 0.8
236 0.77
237 0.78
238 0.7
239 0.63
240 0.53
241 0.47
242 0.42
243 0.32
244 0.26
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.11
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.11
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.15
269 0.16
270 0.14
271 0.16
272 0.21
273 0.2
274 0.21
275 0.23
276 0.24
277 0.25
278 0.29
279 0.3
280 0.3
281 0.29
282 0.29
283 0.28
284 0.24
285 0.25
286 0.2
287 0.18
288 0.17
289 0.24
290 0.27
291 0.27
292 0.28
293 0.26
294 0.28
295 0.28
296 0.28
297 0.24
298 0.25
299 0.26
300 0.25
301 0.32
302 0.33
303 0.34
304 0.34
305 0.32
306 0.32
307 0.37
308 0.39
309 0.35
310 0.35
311 0.34
312 0.4
313 0.38
314 0.34
315 0.28
316 0.29
317 0.28
318 0.27
319 0.26
320 0.2
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.14
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.14
338 0.14
339 0.15