FuNGI

A0A1Y1YNH0

Protein Details

Accession

A0A1Y1YNH0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
201-228	NTICNYGNVRKVKKRKKRISAEKETEFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
210-219	RKVKKRKKRI

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MRVDQVDPGSTTLAQAEPEIWGLNGVKPWNPLILEKSVNTSVSLDVRKQKDILERHKDSPPSFVLHIFPTHFKFEKQDGVFLFSSSMKNFLDYLNKQRIPPDLVDVFDEAQCQYYEGCIIAEIHDYRESYTTNVNGTNSNTNRVLLTPNAETLWSDLCLLNESYGAFWSEDFALEVESKILLATEEPLCLDPSFQVTRISNTICNYGNVRKVKKRKKRISAEKETEFAEKIEKEKTMMMMDERYQKEFQPTFGRLSFVQDWRKRKSMVDADPSVGLVTKKLKNRQVVEPLPPTGDNKQIVRTLRFAKEAGGHTTYTLINIYMDNITSEFDGVLRMGAAPNTSIKGNTIKFHIGSKSTLQMYIENAKRIFEIDHKLISDDSLISFESPAPSPILQVPDQKSETSTNPPLISRVQNPLLMLAQTLPIARTLPQATPASQQQSSQPVPQPQVTTPLPPSLPQPQIQPQVTPTLLPQSTMQLSSPSDSSTQPQSSPLQAQLLQTQQVSASPVGVNVQVPAALPGNAALANTNGAPSTSNTAAPQDALSLSLQQFAQSKGMKNLTPQQLNQLKQQLIRKKQLMMQRALQQQRQQQQLQQQQQQQQTQRPSPLQSSPSPQIHQQQFSPSQQQRQLSLQQQSPHQQHTQLSSPVQFSQNISPMLQRQELSQSPSLPNQQMSISPQHQQSPPQPSLSVAQSSLQFQASALQVSPQQMLQPTGSVQHQITSPNGQTINLPNGMTPQMFALNQRNQLLWQQQLLQQQMAAHNMGMNRGNANGASIPMQIRNANLALAQGRGMLPLMRGNGRGTPQNQLQNQGPSQFGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.12
4	0.11
5	0.12
6	0.12
7	0.1
8	0.11
9	0.12
10	0.14
11	0.17
12	0.18
13	0.2
14	0.22
15	0.23
16	0.24
17	0.25
18	0.25
19	0.26
20	0.3
21	0.31
22	0.3
23	0.34
24	0.33
25	0.32
26	0.3
27	0.27
28	0.24
29	0.27
30	0.29
31	0.29
32	0.35
33	0.38
34	0.41
35	0.4
36	0.43
37	0.45
38	0.52
39	0.57
40	0.59
41	0.61
42	0.62
43	0.68
44	0.69
45	0.61
46	0.58
47	0.51
48	0.45
49	0.41
50	0.38
51	0.34
52	0.3
53	0.32
54	0.29
55	0.3
56	0.29
57	0.34
58	0.33
59	0.32
60	0.35
61	0.36
62	0.43
63	0.4
64	0.42
65	0.36
66	0.41
67	0.39
68	0.34
69	0.32
70	0.24
71	0.25
72	0.2
73	0.23
74	0.17
75	0.18
76	0.18
77	0.19
78	0.26
79	0.28
80	0.36
81	0.43
82	0.45
83	0.45
84	0.47
85	0.5
86	0.45
87	0.42
88	0.41
89	0.32
90	0.31
91	0.32
92	0.31
93	0.27
94	0.22
95	0.22
96	0.14
97	0.14
98	0.13
99	0.12
100	0.1
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.13
109	0.13
110	0.15
111	0.17
112	0.17
113	0.18
114	0.2
115	0.19
116	0.17
117	0.2
118	0.19
119	0.19
120	0.21
121	0.21
122	0.21
123	0.24
124	0.31
125	0.29
126	0.32
127	0.31
128	0.29
129	0.29
130	0.27
131	0.27
132	0.19
133	0.22
134	0.18
135	0.18
136	0.18
137	0.18
138	0.17
139	0.16
140	0.16
141	0.12
142	0.12
143	0.11
144	0.11
145	0.14
146	0.14
147	0.12
148	0.11
149	0.11
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.1
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.09
179	0.13
180	0.15
181	0.15
182	0.19
183	0.18
184	0.22
185	0.25
186	0.26
187	0.24
188	0.24
189	0.28
190	0.24
191	0.25
192	0.26
193	0.27
194	0.33
195	0.37
196	0.42
197	0.48
198	0.58
199	0.67
200	0.74
201	0.81
202	0.84
203	0.87
204	0.91
205	0.93
206	0.93
207	0.93
208	0.91
209	0.83
210	0.74
211	0.65
212	0.56
213	0.45
214	0.35
215	0.28
216	0.2
217	0.19
218	0.2
219	0.18
220	0.18
221	0.18
222	0.2
223	0.17
224	0.17
225	0.17
226	0.16
227	0.19
228	0.27
229	0.27
230	0.28
231	0.28
232	0.28
233	0.34
234	0.32
235	0.33
236	0.31
237	0.32
238	0.33
239	0.33
240	0.34
241	0.26
242	0.31
243	0.32
244	0.31
245	0.39
246	0.41
247	0.47
248	0.51
249	0.55
250	0.5
251	0.47
252	0.5
253	0.5
254	0.51
255	0.52
256	0.48
257	0.45
258	0.43
259	0.42
260	0.32
261	0.24
262	0.16
263	0.11
264	0.15
265	0.19
266	0.25
267	0.32
268	0.39
269	0.45
270	0.49
271	0.55
272	0.58
273	0.57
274	0.57
275	0.53
276	0.48
277	0.42
278	0.39
279	0.34
280	0.26
281	0.28
282	0.24
283	0.21
284	0.23
285	0.26
286	0.28
287	0.28
288	0.3
289	0.31
290	0.31
291	0.32
292	0.29
293	0.26
294	0.29
295	0.29
296	0.28
297	0.24
298	0.22
299	0.2
300	0.21
301	0.19
302	0.15
303	0.12
304	0.09
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.13
332	0.15
333	0.15
334	0.17
335	0.18
336	0.19
337	0.21
338	0.22
339	0.18
340	0.18
341	0.19
342	0.2
343	0.19
344	0.19
345	0.17
346	0.16
347	0.17
348	0.22
349	0.22
350	0.21
351	0.21
352	0.21
353	0.2
354	0.2
355	0.18
356	0.15
357	0.18
358	0.17
359	0.18
360	0.18
361	0.18
362	0.17
363	0.16
364	0.13
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.13
380	0.13
381	0.18
382	0.19
383	0.22
384	0.23
385	0.23
386	0.23
387	0.22
388	0.23
389	0.23
390	0.23
391	0.21
392	0.21
393	0.21
394	0.21
395	0.21
396	0.21
397	0.18
398	0.2
399	0.2
400	0.2
401	0.2
402	0.19
403	0.17
404	0.14
405	0.12
406	0.08
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.09
415	0.1
416	0.1
417	0.14
418	0.15
419	0.15
420	0.17
421	0.19
422	0.2
423	0.19
424	0.2
425	0.18
426	0.23
427	0.23
428	0.25
429	0.26
430	0.26
431	0.27
432	0.29
433	0.28
434	0.23
435	0.28
436	0.25
437	0.23
438	0.21
439	0.21
440	0.2
441	0.18
442	0.2
443	0.21
444	0.23
445	0.21
446	0.24
447	0.27
448	0.34
449	0.34
450	0.32
451	0.26
452	0.28
453	0.27
454	0.23
455	0.18
456	0.17
457	0.17
458	0.17
459	0.16
460	0.15
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.11
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.13
472	0.16
473	0.17
474	0.16
475	0.19
476	0.19
477	0.2
478	0.21
479	0.2
480	0.17
481	0.18
482	0.18
483	0.19
484	0.18
485	0.18
486	0.16
487	0.15
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.09
492	0.09
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.08
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.06
518	0.06
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.12
523	0.14
524	0.14
525	0.13
526	0.12
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.13
537	0.13
538	0.18
539	0.18
540	0.2
541	0.23
542	0.26
543	0.26
544	0.28
545	0.35
546	0.38
547	0.39
548	0.37
549	0.42
550	0.45
551	0.47
552	0.48
553	0.46
554	0.41
555	0.42
556	0.5
557	0.49
558	0.5
559	0.56
560	0.53
561	0.5
562	0.53
563	0.55
564	0.54
565	0.5
566	0.48
567	0.48
568	0.53
569	0.55
570	0.54
571	0.52
572	0.53
573	0.55
574	0.56
575	0.5
576	0.46
577	0.51
578	0.57
579	0.59
580	0.59
581	0.59
582	0.6
583	0.64
584	0.67
585	0.63
586	0.61
587	0.6
588	0.57
589	0.56
590	0.52
591	0.48
592	0.46
593	0.45
594	0.43
595	0.38
596	0.41
597	0.42
598	0.43
599	0.42
600	0.42
601	0.46
602	0.46
603	0.46
604	0.41
605	0.41
606	0.42
607	0.45
608	0.51
609	0.45
610	0.47
611	0.5
612	0.51
613	0.46
614	0.46
615	0.49
616	0.46
617	0.48
618	0.45
619	0.43
620	0.46
621	0.51
622	0.5
623	0.47
624	0.43
625	0.4
626	0.39
627	0.4
628	0.41
629	0.36
630	0.35
631	0.32
632	0.32
633	0.31
634	0.31
635	0.27
636	0.25
637	0.26
638	0.29
639	0.28
640	0.26
641	0.26
642	0.27
643	0.3
644	0.3
645	0.25
646	0.22
647	0.27
648	0.29
649	0.32
650	0.32
651	0.31
652	0.31
653	0.35
654	0.38
655	0.34
656	0.32
657	0.28
658	0.26
659	0.25
660	0.26
661	0.3
662	0.27
663	0.29
664	0.31
665	0.35
666	0.36
667	0.4
668	0.44
669	0.45
670	0.45
671	0.42
672	0.4
673	0.36
674	0.38
675	0.35
676	0.3
677	0.22
678	0.22
679	0.21
680	0.22
681	0.22
682	0.19
683	0.16
684	0.14
685	0.17
686	0.15
687	0.15
688	0.13
689	0.13
690	0.15
691	0.17
692	0.18
693	0.14
694	0.15
695	0.16
696	0.18
697	0.17
698	0.16
699	0.15
700	0.17
701	0.18
702	0.19
703	0.17
704	0.17
705	0.18
706	0.19
707	0.21
708	0.24
709	0.24
710	0.25
711	0.26
712	0.24
713	0.25
714	0.28
715	0.3
716	0.27
717	0.26
718	0.21
719	0.23
720	0.25
721	0.22
722	0.18
723	0.14
724	0.15
725	0.15
726	0.2
727	0.26
728	0.3
729	0.35
730	0.36
731	0.35
732	0.34
733	0.4
734	0.41
735	0.35
736	0.31
737	0.3
738	0.33
739	0.39
740	0.4
741	0.34
742	0.3
743	0.29
744	0.29
745	0.28
746	0.24
747	0.18
748	0.18
749	0.18
750	0.2
751	0.2
752	0.19
753	0.17
754	0.17
755	0.18
756	0.15
757	0.17
758	0.14
759	0.13
760	0.13
761	0.15
762	0.16
763	0.17
764	0.2
765	0.18
766	0.19
767	0.21
768	0.2
769	0.18
770	0.17
771	0.18
772	0.16
773	0.15
774	0.15
775	0.12
776	0.12
777	0.12
778	0.13
779	0.11
780	0.11
781	0.14
782	0.18
783	0.19
784	0.21
785	0.22
786	0.26
787	0.29
788	0.35
789	0.33
790	0.37
791	0.42
792	0.5
793	0.5
794	0.5
795	0.52
796	0.53
797	0.53
798	0.49

A0A1Y1YNH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer