Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YN51

Protein Details
Accession A0A1Y1YN51    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-197THNNRRGRGNRRHNGRDRNNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-318RGRGRGGHRGRGSGGGSRGG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, extr 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR025761  FFD_box  
IPR025609  Lsm14-like_N  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR025768  TFG_box  
Pfam View protein in Pfam  
PF12701  LSM14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS51513  FFD  
PS52002  SM  
PS51536  TFG  
CDD cd01736  LSm14_N  
Amino Acid Sequences MSAEGFIGSTISLISRSDIRYVGILHSINAQESTIALEKVRSFGTEGRKGNPAEEIAASDHVFEYIVFRGSDVKDLNVCEAPPAPQPPAVPNDPAILQTTAPPQPPGFQNYGNNDVNRPKETGGSFGQPQPAYPNRAQQYWQQPGHDASAEPQSKESAGGIEQNGASDRLPGMGGHLTHNNRRGRGNRRHNGRDRNNIPIPSSDFDFESSNAKFDKTELLKEIEDDEVPEQPVEPSTQPFYNKSTSFFDNISCEAKERMDNNDGRPRLSFNERRERQHHERQLNLETFGQTSVDSSRYRGRGRGGHRGRGSGGGSRGGRGGYNHNNYRNVGARVENGTFWNNNNNSSSNSNNVANNRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.13
3 0.15
4 0.17
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.21
12 0.19
13 0.22
14 0.22
15 0.21
16 0.2
17 0.18
18 0.12
19 0.12
20 0.16
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.15
25 0.15
26 0.18
27 0.18
28 0.15
29 0.16
30 0.21
31 0.3
32 0.36
33 0.38
34 0.39
35 0.44
36 0.44
37 0.42
38 0.39
39 0.31
40 0.24
41 0.22
42 0.21
43 0.17
44 0.19
45 0.18
46 0.15
47 0.14
48 0.11
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.14
57 0.15
58 0.2
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.23
64 0.2
65 0.19
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.18
72 0.19
73 0.2
74 0.22
75 0.27
76 0.27
77 0.24
78 0.23
79 0.23
80 0.21
81 0.21
82 0.2
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.17
91 0.2
92 0.22
93 0.25
94 0.24
95 0.24
96 0.29
97 0.32
98 0.39
99 0.38
100 0.36
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.33
105 0.3
106 0.23
107 0.24
108 0.24
109 0.25
110 0.23
111 0.23
112 0.23
113 0.23
114 0.28
115 0.24
116 0.23
117 0.25
118 0.27
119 0.29
120 0.28
121 0.34
122 0.31
123 0.32
124 0.34
125 0.35
126 0.41
127 0.44
128 0.45
129 0.37
130 0.37
131 0.37
132 0.37
133 0.31
134 0.21
135 0.14
136 0.21
137 0.21
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.14
164 0.16
165 0.19
166 0.26
167 0.27
168 0.27
169 0.31
170 0.37
171 0.42
172 0.5
173 0.58
174 0.59
175 0.65
176 0.73
177 0.77
178 0.81
179 0.78
180 0.78
181 0.69
182 0.7
183 0.66
184 0.57
185 0.5
186 0.41
187 0.37
188 0.28
189 0.27
190 0.19
191 0.15
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.19
203 0.17
204 0.19
205 0.2
206 0.23
207 0.22
208 0.23
209 0.24
210 0.17
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.16
225 0.18
226 0.2
227 0.23
228 0.26
229 0.26
230 0.28
231 0.29
232 0.29
233 0.29
234 0.28
235 0.26
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.18
243 0.2
244 0.19
245 0.23
246 0.27
247 0.31
248 0.35
249 0.43
250 0.42
251 0.39
252 0.39
253 0.36
254 0.34
255 0.4
256 0.42
257 0.41
258 0.52
259 0.56
260 0.62
261 0.64
262 0.69
263 0.68
264 0.71
265 0.73
266 0.68
267 0.69
268 0.66
269 0.69
270 0.62
271 0.55
272 0.46
273 0.37
274 0.31
275 0.25
276 0.21
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.14
281 0.13
282 0.16
283 0.23
284 0.28
285 0.31
286 0.33
287 0.37
288 0.42
289 0.48
290 0.56
291 0.56
292 0.6
293 0.6
294 0.59
295 0.54
296 0.51
297 0.47
298 0.41
299 0.36
300 0.33
301 0.31
302 0.29
303 0.29
304 0.25
305 0.24
306 0.21
307 0.27
308 0.3
309 0.39
310 0.46
311 0.5
312 0.53
313 0.53
314 0.56
315 0.54
316 0.47
317 0.4
318 0.35
319 0.34
320 0.34
321 0.35
322 0.31
323 0.27
324 0.29
325 0.27
326 0.26
327 0.32
328 0.29
329 0.31
330 0.33
331 0.32
332 0.33
333 0.36
334 0.37
335 0.33
336 0.36
337 0.36
338 0.38