Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VTS7

Protein Details
Accession A0A1Y1VTS7    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-200LELKKAKKAKSKSNFRRKVPAGHydrophilic
378-401SEEGLPRKKDSRRRVKLDHLDEDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-198KKAKKAKSKSNFRRKVP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MNQNTLQDWASTRIADFLGFGPEDAVPMVQYLLTFQTSDELAGHLQEMLGVSQEATAFIQEFIENRFPSKGGINSTNQDTQPFKWAGSPEASASLKEEDSKNSKKKKGLTTAEWEEQYNKLMKETAATRAPCDCLATKHPLLTNCLNCGKIICAREGPGPCMFCNTPVFSQEQQIELLLELKKAKKAKSKSNFRRKVPAGQKSNMLYLDKVTGLSTHSRSDAEDAEALAKAQAHKDQLLEYDRTSARRSHVIDQAADFNMPVDPSDKWLSPQEKALALKLYQEQEKRKAFEEDRRKRGTHSITIDLLGRKVVTGPVIEAPDDGVKETLQELEKLKLEEARKSQSSKGSGYYAQNPLLKGVSAPKFISSKERSTSNQLSEEGLPRKKDSRRRVKLDHLDEDASKNASAAGAYSKET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.17
4 0.13
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.06
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.13
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.22
56 0.26
57 0.25
58 0.24
59 0.29
60 0.32
61 0.34
62 0.39
63 0.42
64 0.38
65 0.38
66 0.34
67 0.3
68 0.34
69 0.31
70 0.27
71 0.26
72 0.27
73 0.26
74 0.27
75 0.26
76 0.2
77 0.24
78 0.24
79 0.2
80 0.21
81 0.2
82 0.17
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.28
87 0.37
88 0.44
89 0.51
90 0.57
91 0.6
92 0.67
93 0.7
94 0.73
95 0.72
96 0.69
97 0.69
98 0.7
99 0.68
100 0.61
101 0.52
102 0.44
103 0.36
104 0.33
105 0.28
106 0.21
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.23
113 0.25
114 0.25
115 0.26
116 0.26
117 0.28
118 0.24
119 0.25
120 0.2
121 0.18
122 0.22
123 0.27
124 0.26
125 0.28
126 0.3
127 0.29
128 0.33
129 0.36
130 0.33
131 0.31
132 0.32
133 0.3
134 0.27
135 0.25
136 0.22
137 0.21
138 0.2
139 0.17
140 0.16
141 0.18
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.23
146 0.23
147 0.2
148 0.24
149 0.22
150 0.19
151 0.2
152 0.2
153 0.18
154 0.18
155 0.22
156 0.19
157 0.22
158 0.2
159 0.19
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.1
164 0.13
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.13
169 0.17
170 0.2
171 0.25
172 0.3
173 0.36
174 0.45
175 0.53
176 0.64
177 0.71
178 0.79
179 0.83
180 0.77
181 0.81
182 0.73
183 0.73
184 0.71
185 0.69
186 0.64
187 0.57
188 0.58
189 0.5
190 0.49
191 0.4
192 0.31
193 0.22
194 0.16
195 0.16
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.11
202 0.12
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.14
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.2
229 0.2
230 0.21
231 0.23
232 0.22
233 0.21
234 0.26
235 0.29
236 0.28
237 0.32
238 0.33
239 0.32
240 0.31
241 0.31
242 0.26
243 0.22
244 0.17
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.15
255 0.22
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.26
260 0.27
261 0.28
262 0.28
263 0.24
264 0.21
265 0.23
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.3
270 0.34
271 0.4
272 0.45
273 0.44
274 0.42
275 0.47
276 0.46
277 0.5
278 0.57
279 0.58
280 0.62
281 0.65
282 0.64
283 0.59
284 0.63
285 0.6
286 0.57
287 0.52
288 0.47
289 0.43
290 0.43
291 0.43
292 0.36
293 0.29
294 0.22
295 0.16
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.09
300 0.08
301 0.1
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.16
318 0.19
319 0.22
320 0.22
321 0.23
322 0.24
323 0.26
324 0.3
325 0.34
326 0.38
327 0.39
328 0.42
329 0.45
330 0.47
331 0.49
332 0.44
333 0.42
334 0.39
335 0.4
336 0.41
337 0.43
338 0.41
339 0.41
340 0.42
341 0.38
342 0.36
343 0.32
344 0.27
345 0.21
346 0.25
347 0.25
348 0.26
349 0.26
350 0.29
351 0.3
352 0.31
353 0.39
354 0.36
355 0.38
356 0.39
357 0.44
358 0.44
359 0.51
360 0.57
361 0.53
362 0.52
363 0.46
364 0.45
365 0.43
366 0.47
367 0.46
368 0.43
369 0.41
370 0.41
371 0.48
372 0.53
373 0.6
374 0.64
375 0.67
376 0.73
377 0.79
378 0.84
379 0.87
380 0.89
381 0.88
382 0.83
383 0.77
384 0.7
385 0.62
386 0.57
387 0.48
388 0.4
389 0.3
390 0.23
391 0.18
392 0.15
393 0.13
394 0.11
395 0.13