Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1Z0R4

Protein Details
Accession A0A1Y1Z0R4    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-157LKKSHRDEKPVIKKAPKKEKAABasic
560-579ADINTRKRQKEDKRNMYLMKHydrophilic
748-810NAERGERRTSRDRDHKNKSSDRKSGKRKMDSAESQEGPRKKSKDGEQKKPFFRNKKAEKKQKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-156ELALKKSHRDEKPVIKKAPKKEKA
752-810GERRTSRDRDHKNKSSDRKSGKRKMDSAESQEGPRKKSKDGEQKKPFFRNKKAEKKQKH
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12414  RRM2_RBM28_like  
cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12416  RRM4_RBM28_like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSDTETSPQTVDSIAKNPNPADETRGRSTLFVRGIPYDCKNEIPRISNDLVFFLYELESFFSDVGPIRSCFVVQKTPEENQGEGEGEDSGKSSAEKGNKGYGFVQFVVPEDAERAITELKKVKFRNERTLRIELALKKSHRDEKPVIKKAPKKEKAADAAPVDRSKFQKMPSSVQTIIVSGLNPEVNKKQIYKKVRKFGEVSEVIFPVYEEGDEKKPLEGVAHVVFAKLGEARNAIEHLNDHIFKGNKITAKSMAQIQGVFDKKARLIIRNLPFKLREEDLKSMFSKFGAVVNVNLPRKFGDHGPLRGFGFVQFLSISDAEKALNAVNATKVMDRTIAVDWALAKDQYEKSETQAQEEEVAEEEEAEAEVEEEEGEEEEEEEEDNDEEAEVDEEEEEEVFDPLDSDDDEEEGEEMEVDEEEDAESDAEEDDSEDEETEEKEKAPIPPGTTLFIRNISFDTEEEDLYEHFRQFGKVRYCRITMDHETGRSRGTGFVCFWNKEDAQKCVEENYKLHQTVSIVNKRSVLTPDAPSNLAAKFTVDDRILSIVMAVDKQEAGKLADINTRKRQKEDKRNMYLMKEGVILADSPAAKGLSQAEVTKRTNSYSARKQLLARNPLLFISKTRLSIRNLPLKVDEAELRKLAVQAIQKFKAEVQRNEREHLTEHERSEGWQYLPRVKQAKIIRSKDRIDPSTQKPRSKGYGFIEYSTHAHALAALRYLNNNPDLFGDKKRLIVEFSRGERTDRSNDNAERGERRTSRDRDHKNKSSDRKSGKRKMDSAESQEGPRKKSKDGEQKKPFFRNKKAEKKQKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.34
4 0.34
5 0.37
6 0.37
7 0.35
8 0.37
9 0.38
10 0.42
11 0.43
12 0.46
13 0.42
14 0.4
15 0.41
16 0.41
17 0.38
18 0.33
19 0.31
20 0.31
21 0.34
22 0.38
23 0.4
24 0.38
25 0.36
26 0.4
27 0.42
28 0.45
29 0.47
30 0.47
31 0.47
32 0.48
33 0.49
34 0.46
35 0.42
36 0.37
37 0.32
38 0.26
39 0.22
40 0.16
41 0.13
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.1
50 0.12
51 0.14
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.2
58 0.23
59 0.28
60 0.27
61 0.35
62 0.38
63 0.41
64 0.47
65 0.47
66 0.42
67 0.36
68 0.36
69 0.29
70 0.24
71 0.22
72 0.15
73 0.12
74 0.12
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.15
81 0.2
82 0.24
83 0.27
84 0.35
85 0.35
86 0.38
87 0.38
88 0.36
89 0.34
90 0.31
91 0.3
92 0.22
93 0.22
94 0.22
95 0.2
96 0.16
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.18
105 0.25
106 0.28
107 0.36
108 0.38
109 0.46
110 0.53
111 0.6
112 0.66
113 0.68
114 0.73
115 0.71
116 0.75
117 0.67
118 0.59
119 0.59
120 0.53
121 0.51
122 0.49
123 0.44
124 0.44
125 0.49
126 0.55
127 0.52
128 0.54
129 0.55
130 0.59
131 0.69
132 0.73
133 0.74
134 0.74
135 0.78
136 0.8
137 0.83
138 0.8
139 0.77
140 0.75
141 0.76
142 0.73
143 0.69
144 0.65
145 0.58
146 0.54
147 0.51
148 0.46
149 0.39
150 0.37
151 0.36
152 0.36
153 0.35
154 0.34
155 0.39
156 0.4
157 0.45
158 0.46
159 0.51
160 0.45
161 0.45
162 0.42
163 0.34
164 0.31
165 0.25
166 0.19
167 0.12
168 0.13
169 0.11
170 0.1
171 0.13
172 0.15
173 0.18
174 0.2
175 0.24
176 0.31
177 0.39
178 0.5
179 0.58
180 0.64
181 0.71
182 0.73
183 0.74
184 0.68
185 0.63
186 0.62
187 0.54
188 0.47
189 0.39
190 0.35
191 0.29
192 0.26
193 0.22
194 0.13
195 0.1
196 0.08
197 0.06
198 0.1
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.19
230 0.2
231 0.19
232 0.23
233 0.23
234 0.23
235 0.24
236 0.26
237 0.24
238 0.25
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.24
243 0.23
244 0.21
245 0.25
246 0.25
247 0.24
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.24
252 0.25
253 0.22
254 0.25
255 0.33
256 0.41
257 0.47
258 0.48
259 0.46
260 0.45
261 0.45
262 0.44
263 0.36
264 0.34
265 0.3
266 0.34
267 0.33
268 0.34
269 0.32
270 0.3
271 0.28
272 0.22
273 0.18
274 0.13
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.15
280 0.22
281 0.23
282 0.23
283 0.21
284 0.19
285 0.2
286 0.21
287 0.19
288 0.21
289 0.24
290 0.29
291 0.31
292 0.33
293 0.32
294 0.3
295 0.29
296 0.21
297 0.17
298 0.12
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.06
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.15
336 0.14
337 0.16
338 0.24
339 0.24
340 0.23
341 0.23
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.18
346 0.11
347 0.11
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.07
428 0.09
429 0.11
430 0.14
431 0.16
432 0.17
433 0.2
434 0.2
435 0.22
436 0.21
437 0.21
438 0.18
439 0.19
440 0.18
441 0.15
442 0.15
443 0.14
444 0.14
445 0.12
446 0.14
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.11
453 0.12
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.14
459 0.21
460 0.28
461 0.31
462 0.36
463 0.38
464 0.39
465 0.39
466 0.4
467 0.39
468 0.34
469 0.36
470 0.34
471 0.33
472 0.33
473 0.32
474 0.3
475 0.23
476 0.2
477 0.17
478 0.17
479 0.16
480 0.16
481 0.22
482 0.25
483 0.26
484 0.26
485 0.27
486 0.26
487 0.3
488 0.31
489 0.26
490 0.26
491 0.26
492 0.25
493 0.25
494 0.28
495 0.24
496 0.23
497 0.26
498 0.3
499 0.29
500 0.28
501 0.25
502 0.23
503 0.27
504 0.34
505 0.36
506 0.32
507 0.32
508 0.35
509 0.34
510 0.35
511 0.31
512 0.26
513 0.22
514 0.22
515 0.24
516 0.24
517 0.24
518 0.22
519 0.22
520 0.18
521 0.15
522 0.13
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.09
545 0.1
546 0.11
547 0.17
548 0.21
549 0.27
550 0.35
551 0.43
552 0.43
553 0.47
554 0.56
555 0.61
556 0.69
557 0.74
558 0.75
559 0.75
560 0.8
561 0.78
562 0.7
563 0.64
564 0.53
565 0.43
566 0.33
567 0.24
568 0.17
569 0.14
570 0.12
571 0.08
572 0.1
573 0.09
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.09
579 0.1
580 0.1
581 0.11
582 0.14
583 0.16
584 0.22
585 0.24
586 0.27
587 0.27
588 0.26
589 0.31
590 0.34
591 0.39
592 0.42
593 0.49
594 0.49
595 0.51
596 0.53
597 0.56
598 0.6
599 0.58
600 0.52
601 0.46
602 0.43
603 0.41
604 0.39
605 0.31
606 0.24
607 0.24
608 0.23
609 0.25
610 0.29
611 0.33
612 0.35
613 0.43
614 0.49
615 0.52
616 0.5
617 0.48
618 0.46
619 0.43
620 0.4
621 0.33
622 0.3
623 0.24
624 0.27
625 0.25
626 0.24
627 0.22
628 0.21
629 0.19
630 0.19
631 0.22
632 0.26
633 0.33
634 0.35
635 0.35
636 0.35
637 0.37
638 0.42
639 0.44
640 0.45
641 0.47
642 0.54
643 0.56
644 0.59
645 0.58
646 0.51
647 0.45
648 0.43
649 0.42
650 0.37
651 0.36
652 0.36
653 0.34
654 0.34
655 0.36
656 0.33
657 0.27
658 0.27
659 0.29
660 0.34
661 0.37
662 0.43
663 0.43
664 0.39
665 0.46
666 0.48
667 0.55
668 0.57
669 0.62
670 0.65
671 0.67
672 0.71
673 0.71
674 0.72
675 0.65
676 0.63
677 0.63
678 0.63
679 0.67
680 0.7
681 0.68
682 0.63
683 0.66
684 0.67
685 0.61
686 0.6
687 0.55
688 0.57
689 0.53
690 0.51
691 0.46
692 0.4
693 0.39
694 0.33
695 0.27
696 0.17
697 0.15
698 0.16
699 0.16
700 0.15
701 0.16
702 0.14
703 0.15
704 0.17
705 0.19
706 0.2
707 0.22
708 0.2
709 0.19
710 0.2
711 0.25
712 0.25
713 0.28
714 0.31
715 0.29
716 0.33
717 0.34
718 0.33
719 0.33
720 0.34
721 0.37
722 0.38
723 0.41
724 0.45
725 0.44
726 0.45
727 0.45
728 0.47
729 0.47
730 0.44
731 0.45
732 0.46
733 0.48
734 0.51
735 0.53
736 0.51
737 0.49
738 0.48
739 0.51
740 0.46
741 0.51
742 0.55
743 0.56
744 0.62
745 0.67
746 0.75
747 0.76
748 0.83
749 0.86
750 0.86
751 0.89
752 0.89
753 0.88
754 0.87
755 0.87
756 0.87
757 0.89
758 0.89
759 0.89
760 0.88
761 0.85
762 0.82
763 0.81
764 0.79
765 0.76
766 0.75
767 0.67
768 0.63
769 0.64
770 0.62
771 0.57
772 0.57
773 0.52
774 0.49
775 0.55
776 0.61
777 0.64
778 0.7
779 0.76
780 0.78
781 0.85
782 0.89
783 0.91
784 0.9
785 0.89
786 0.89
787 0.89
788 0.89
789 0.91
790 0.92