Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1YP39

Protein Details
Accession A0A1Y1YP39    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-413EVISRQTFKKKLKDRKKIPNQPKAQETHydrophilic
566-590DAEYDRGKVKKVKAKKVQVFSEKNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-407KKKLKDRKKIPNQ
573-580KVKKVKAK
602-612KKMPPSKRSKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 12, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
CDD cd02661  Peptidase_C19E  
Amino Acid Sequences MATGDFVDTYGFRRPTQILFRKDKISTQWENILPVGPGFNNLGNTCYMNVALQALIYTPPLTNYLLKNEHSSSCKIMDFCALCELEQLTNRSFSSSKQTDENQAISPKKLVGHLRAIVKHFRIGRQEDAHEFIRHLIDVMQRNCLNGFDSKMDERIKETTLIHQVFGGYFRSQINCSTCDTEVNTFDPFLDLSLEVKSCKSLEKALEMFTKSQELSGDNSYFCDRCDKLSPAAKKMTVYEAPVVLTIQLKRFLFASSTASKLAKPMSYPETLDINPYVSNNSDPIPLYKLYAVIVHTGGSCTTGHYYIMVKTPSGSWYSIDDDKVRQVSQENVLKEKAYMLFYVQSSTKPQKSQVHPTAAKQKRSDITKPDVPIASTSTQINDEVGEVISRQTFKKKLKDRKKIPNQPKAQETVAKPKTQKAVDAKLPSLTEIELPVKSAPSSQRAPAVSTEKPDEATSLKVQLESVKNSATDDGDVTAEVVRKPRVVSEGPVINWDENVDSKRSKLDIVIEKEAAREPKALTELQGNSQFDRQVLSWDDTSDIQSARDDVLSEFKSKHKRPSSYDAEYDRGKVKKVKAKKVQVFSEKNAFQSEQNFRNLTKKMPPSKRSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.45
4 0.51
5 0.52
6 0.59
7 0.64
8 0.66
9 0.65
10 0.63
11 0.6
12 0.6
13 0.57
14 0.54
15 0.57
16 0.52
17 0.52
18 0.48
19 0.41
20 0.33
21 0.27
22 0.23
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.18
28 0.18
29 0.19
30 0.18
31 0.19
32 0.18
33 0.17
34 0.15
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.11
48 0.14
49 0.17
50 0.19
51 0.26
52 0.3
53 0.31
54 0.35
55 0.36
56 0.39
57 0.39
58 0.39
59 0.35
60 0.34
61 0.35
62 0.31
63 0.28
64 0.31
65 0.28
66 0.26
67 0.28
68 0.25
69 0.22
70 0.23
71 0.24
72 0.19
73 0.22
74 0.24
75 0.2
76 0.22
77 0.22
78 0.24
79 0.23
80 0.22
81 0.28
82 0.29
83 0.29
84 0.32
85 0.35
86 0.39
87 0.42
88 0.43
89 0.37
90 0.41
91 0.4
92 0.37
93 0.35
94 0.3
95 0.28
96 0.31
97 0.32
98 0.3
99 0.35
100 0.39
101 0.43
102 0.46
103 0.48
104 0.48
105 0.44
106 0.45
107 0.4
108 0.4
109 0.41
110 0.41
111 0.45
112 0.44
113 0.46
114 0.43
115 0.45
116 0.43
117 0.37
118 0.33
119 0.27
120 0.23
121 0.2
122 0.17
123 0.15
124 0.18
125 0.25
126 0.26
127 0.3
128 0.3
129 0.3
130 0.3
131 0.28
132 0.24
133 0.18
134 0.2
135 0.15
136 0.18
137 0.19
138 0.24
139 0.25
140 0.24
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.24
146 0.24
147 0.31
148 0.31
149 0.28
150 0.26
151 0.25
152 0.22
153 0.23
154 0.19
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.19
161 0.21
162 0.2
163 0.22
164 0.24
165 0.23
166 0.23
167 0.24
168 0.22
169 0.21
170 0.21
171 0.19
172 0.16
173 0.15
174 0.14
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.15
189 0.17
190 0.22
191 0.23
192 0.26
193 0.29
194 0.29
195 0.28
196 0.24
197 0.25
198 0.19
199 0.18
200 0.16
201 0.13
202 0.14
203 0.17
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.18
211 0.15
212 0.17
213 0.23
214 0.24
215 0.28
216 0.36
217 0.39
218 0.39
219 0.42
220 0.4
221 0.35
222 0.34
223 0.33
224 0.27
225 0.25
226 0.21
227 0.18
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.11
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.14
242 0.17
243 0.14
244 0.16
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.13
251 0.12
252 0.15
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.19
259 0.2
260 0.17
261 0.14
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.12
303 0.09
304 0.11
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.15
310 0.17
311 0.18
312 0.15
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.19
317 0.23
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.16
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.12
329 0.12
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.16
334 0.21
335 0.23
336 0.22
337 0.29
338 0.36
339 0.41
340 0.5
341 0.52
342 0.56
343 0.54
344 0.57
345 0.62
346 0.59
347 0.6
348 0.51
349 0.5
350 0.45
351 0.5
352 0.51
353 0.46
354 0.47
355 0.46
356 0.46
357 0.43
358 0.39
359 0.33
360 0.29
361 0.26
362 0.2
363 0.16
364 0.15
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.14
380 0.21
381 0.28
382 0.38
383 0.47
384 0.57
385 0.67
386 0.77
387 0.82
388 0.86
389 0.91
390 0.92
391 0.92
392 0.92
393 0.89
394 0.84
395 0.78
396 0.71
397 0.62
398 0.58
399 0.51
400 0.51
401 0.47
402 0.46
403 0.43
404 0.44
405 0.48
406 0.42
407 0.46
408 0.42
409 0.45
410 0.47
411 0.5
412 0.45
413 0.41
414 0.4
415 0.34
416 0.28
417 0.21
418 0.14
419 0.13
420 0.14
421 0.11
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.15
427 0.16
428 0.19
429 0.22
430 0.22
431 0.27
432 0.28
433 0.29
434 0.3
435 0.33
436 0.29
437 0.3
438 0.32
439 0.27
440 0.27
441 0.25
442 0.22
443 0.18
444 0.2
445 0.18
446 0.19
447 0.19
448 0.18
449 0.18
450 0.23
451 0.25
452 0.25
453 0.25
454 0.22
455 0.22
456 0.22
457 0.23
458 0.18
459 0.15
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.22
474 0.22
475 0.24
476 0.28
477 0.32
478 0.3
479 0.33
480 0.32
481 0.27
482 0.25
483 0.22
484 0.17
485 0.15
486 0.17
487 0.18
488 0.17
489 0.17
490 0.21
491 0.22
492 0.21
493 0.21
494 0.27
495 0.32
496 0.38
497 0.42
498 0.4
499 0.39
500 0.4
501 0.42
502 0.36
503 0.29
504 0.25
505 0.21
506 0.23
507 0.26
508 0.25
509 0.22
510 0.27
511 0.27
512 0.3
513 0.36
514 0.33
515 0.31
516 0.34
517 0.33
518 0.26
519 0.27
520 0.21
521 0.2
522 0.22
523 0.24
524 0.22
525 0.22
526 0.24
527 0.22
528 0.23
529 0.21
530 0.18
531 0.15
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.19
539 0.2
540 0.22
541 0.23
542 0.29
543 0.39
544 0.43
545 0.53
546 0.55
547 0.61
548 0.66
549 0.74
550 0.76
551 0.73
552 0.76
553 0.7
554 0.66
555 0.6
556 0.56
557 0.53
558 0.46
559 0.43
560 0.43
561 0.47
562 0.52
563 0.6
564 0.67
565 0.71
566 0.8
567 0.84
568 0.86
569 0.87
570 0.88
571 0.85
572 0.8
573 0.79
574 0.7
575 0.63
576 0.58
577 0.49
578 0.42
579 0.43
580 0.46
581 0.41
582 0.46
583 0.46
584 0.43
585 0.5
586 0.49
587 0.46
588 0.47
589 0.52
590 0.56
591 0.65
592 0.72