Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1XHK3

Protein Details
Accession A0A1Y1XHK3    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-124WEEAKAKEENPKPKKKRSASVDGYHydrophilic
547-573SELTQEYKRKHKSATRKKLKMKRKYVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-117KAKEENPKPKKKR
144-144K
554-573KRKHKSATRKKLKMKRKYVK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MSEENAPERKRIYLGGLAPDVTAADVEKRFHTFGTLSSVELVLNEFTGKCRGFAYLNLDITPANWKKCYSMYNGTKWKGQQLKLEEAKTDYMTKWVLKKEWEEAKAKEENPKPKKKRSASVDGYEAADMTLVNEKNVDGRKGWKRGRYGRAVAVMKLKKTDGTPFTYDPSHYKNNLEKLFGSVRPLPISKLTWSYDQTSNHNLVEDEVAVPEPRKPATESLIKANEQRLEALKRRQEEQERSRKMIKESLSNIDGKKSEGHIVFEDSDDEAQQKGKSLFDSDSDSEEAPGDFDIEINEAFEGEAGRKRLALQKRFGGDERFKLDEDFMGDEEIAQREEAKRAEETKEEAADDDDDINVKQENSVAMSILNSLFQDAPAPVVEKPAEVNARYWKPVTRFDPDAEDADEMLVDETLAEEADDHPAQAYEPSTAPDVSDEKKVVINTNLKSVFSGNDEGFTLFGGSESESDDEPVTPFAFPTSQVEASPTPLTRLKSVTAAPAVQRSGALFFFHLYDPEMHKRSNFKEDRVFARTGTIEEVTAAWQEQRSELTQEYKRKHKSATRKKLKMKRKYVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.36
4 0.34
5 0.32
6 0.29
7 0.24
8 0.17
9 0.13
10 0.08
11 0.11
12 0.13
13 0.15
14 0.18
15 0.21
16 0.22
17 0.22
18 0.24
19 0.2
20 0.2
21 0.26
22 0.24
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.18
27 0.18
28 0.17
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.1
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.19
39 0.19
40 0.23
41 0.29
42 0.3
43 0.31
44 0.31
45 0.31
46 0.28
47 0.27
48 0.32
49 0.29
50 0.25
51 0.26
52 0.27
53 0.29
54 0.34
55 0.38
56 0.36
57 0.42
58 0.46
59 0.54
60 0.62
61 0.62
62 0.63
63 0.6
64 0.62
65 0.59
66 0.56
67 0.54
68 0.51
69 0.59
70 0.6
71 0.6
72 0.52
73 0.47
74 0.45
75 0.39
76 0.35
77 0.26
78 0.23
79 0.24
80 0.26
81 0.29
82 0.32
83 0.33
84 0.35
85 0.38
86 0.43
87 0.49
88 0.5
89 0.5
90 0.47
91 0.5
92 0.52
93 0.5
94 0.51
95 0.5
96 0.55
97 0.6
98 0.69
99 0.71
100 0.75
101 0.84
102 0.82
103 0.84
104 0.82
105 0.83
106 0.79
107 0.76
108 0.7
109 0.61
110 0.54
111 0.44
112 0.35
113 0.24
114 0.16
115 0.1
116 0.08
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.17
123 0.2
124 0.21
125 0.16
126 0.25
127 0.34
128 0.43
129 0.5
130 0.51
131 0.57
132 0.65
133 0.72
134 0.71
135 0.68
136 0.63
137 0.65
138 0.61
139 0.54
140 0.53
141 0.48
142 0.41
143 0.38
144 0.33
145 0.27
146 0.27
147 0.32
148 0.26
149 0.29
150 0.32
151 0.32
152 0.34
153 0.34
154 0.33
155 0.3
156 0.32
157 0.32
158 0.29
159 0.33
160 0.36
161 0.43
162 0.44
163 0.42
164 0.36
165 0.35
166 0.38
167 0.33
168 0.32
169 0.26
170 0.26
171 0.26
172 0.27
173 0.23
174 0.22
175 0.23
176 0.21
177 0.23
178 0.23
179 0.24
180 0.26
181 0.29
182 0.31
183 0.32
184 0.33
185 0.33
186 0.33
187 0.29
188 0.28
189 0.23
190 0.19
191 0.17
192 0.14
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.15
204 0.19
205 0.25
206 0.25
207 0.3
208 0.33
209 0.33
210 0.33
211 0.34
212 0.32
213 0.26
214 0.25
215 0.23
216 0.25
217 0.29
218 0.34
219 0.35
220 0.34
221 0.36
222 0.42
223 0.46
224 0.5
225 0.54
226 0.58
227 0.58
228 0.61
229 0.64
230 0.6
231 0.54
232 0.5
233 0.42
234 0.39
235 0.38
236 0.38
237 0.34
238 0.34
239 0.31
240 0.28
241 0.27
242 0.21
243 0.19
244 0.16
245 0.19
246 0.17
247 0.18
248 0.16
249 0.18
250 0.17
251 0.16
252 0.15
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.17
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.14
273 0.14
274 0.12
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.17
296 0.25
297 0.3
298 0.31
299 0.35
300 0.37
301 0.39
302 0.4
303 0.39
304 0.33
305 0.32
306 0.32
307 0.29
308 0.27
309 0.26
310 0.24
311 0.19
312 0.17
313 0.14
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.07
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.16
329 0.18
330 0.18
331 0.21
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.17
336 0.16
337 0.14
338 0.13
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.08
367 0.1
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.14
372 0.16
373 0.15
374 0.18
375 0.24
376 0.26
377 0.28
378 0.28
379 0.29
380 0.3
381 0.37
382 0.39
383 0.37
384 0.37
385 0.37
386 0.41
387 0.39
388 0.37
389 0.3
390 0.26
391 0.2
392 0.17
393 0.15
394 0.09
395 0.08
396 0.06
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.13
420 0.15
421 0.15
422 0.19
423 0.18
424 0.18
425 0.2
426 0.21
427 0.22
428 0.25
429 0.31
430 0.28
431 0.35
432 0.35
433 0.33
434 0.33
435 0.31
436 0.25
437 0.22
438 0.25
439 0.16
440 0.16
441 0.17
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.11
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.11
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.15
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.23
470 0.22
471 0.25
472 0.27
473 0.23
474 0.22
475 0.25
476 0.27
477 0.26
478 0.28
479 0.26
480 0.27
481 0.28
482 0.29
483 0.28
484 0.29
485 0.28
486 0.3
487 0.28
488 0.25
489 0.24
490 0.19
491 0.19
492 0.17
493 0.16
494 0.12
495 0.12
496 0.14
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.16
501 0.22
502 0.3
503 0.32
504 0.31
505 0.35
506 0.41
507 0.45
508 0.53
509 0.52
510 0.5
511 0.56
512 0.61
513 0.65
514 0.62
515 0.58
516 0.48
517 0.47
518 0.42
519 0.33
520 0.31
521 0.24
522 0.19
523 0.18
524 0.18
525 0.14
526 0.14
527 0.13
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.17
533 0.18
534 0.21
535 0.24
536 0.31
537 0.37
538 0.45
539 0.51
540 0.58
541 0.64
542 0.65
543 0.7
544 0.72
545 0.76
546 0.78
547 0.82
548 0.84
549 0.86
550 0.92
551 0.93
552 0.94
553 0.93