FuNGI

A0A1Y1YNK7

Protein Details

Accession

A0A1Y1YNK7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-68	PNSHNFVPLPQKKKKSGKNKANQAPKPLNRRQKIEKSNLELKRQ	Hydrophilic
316-345	TNVEQKSTSRKPKKSSKAKKPKPTMQLSLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-58	QKKKKSGKNKANQAPKPLNRRQKI
324-337	SRKPKKSSKAKKPK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039693 Rtr1/RPAP2 IPR007308 Rtr1/RPAP2_dom IPR038534 Rtr1/RPAP2_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0017018 F:myosin phosphatase activity GO:0043175 F:RNA polymerase core enzyme binding GO:0008420 F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity
Pfam	View protein in Pfam PF04181 RPAP2_Rtr1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51479 ZF_RTR1

Amino Acid Sequences

MDHPDQKTKASSKPETEYAAPKHPPNSHNFVPLPQKKKKSGKNKANQAPKPLNRRQKIEKSNLELKRQMEITIMHWQEKLFAPGVNPELLAEAARFFRPVHFEEIVEERNSEFLCGYPLCSQPCQDIKGKYHISLEERKLYDMTELRSYCSGLCMTAAKFYLSQLSDEAVYLRDLESWGNVKVIPLGHDASSVNLPQRMSEGLGQELLSNYVKSMIGTLQLPQDGLVIKENNPSEQEKNLLAQNLHLNGANFDAVDGFSIQTTGDRQTPSTDILPKAKASVSIDPDVTEHNTSIDSFFEQADLARQLAEMELNDNTNVEQKSTSRKPKKSSKAKKPKPTMQLSLFGKLWTFLDKCVTTDTRQYMKSLRTEVPFSMCNLVADTDEEHRNLLRQNMLSEKMISTLSALRAEYRITTIVENELIGLVGTLVLDESMVVLDPAEDILLCTIFLDAISRYFPSLDREMTEASSSIFGLLEPLGVNRDKLNILTQMITGEEVKLNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.59
3	0.58
4	0.59
5	0.55
6	0.56
7	0.53
8	0.51
9	0.54
10	0.56
11	0.57
12	0.56
13	0.59
14	0.54
15	0.57
16	0.55
17	0.54
18	0.57
19	0.61
20	0.63
21	0.63
22	0.68
23	0.7
24	0.79
25	0.82
26	0.83
27	0.85
28	0.87
29	0.89
30	0.91
31	0.91
32	0.92
33	0.87
34	0.86
35	0.85
36	0.82
37	0.82
38	0.81
39	0.82
40	0.78
41	0.81
42	0.81
43	0.81
44	0.83
45	0.83
46	0.82
47	0.79
48	0.82
49	0.81
50	0.77
51	0.72
52	0.63
53	0.58
54	0.5
55	0.42
56	0.35
57	0.3
58	0.27
59	0.31
60	0.31
61	0.27
62	0.28
63	0.27
64	0.27
65	0.27
66	0.27
67	0.18
68	0.18
69	0.17
70	0.2
71	0.23
72	0.2
73	0.18
74	0.15
75	0.14
76	0.13
77	0.13
78	0.09
79	0.08
80	0.1
81	0.1
82	0.11
83	0.1
84	0.13
85	0.17
86	0.2
87	0.25
88	0.24
89	0.24
90	0.26
91	0.3
92	0.3
93	0.26
94	0.24
95	0.18
96	0.19
97	0.18
98	0.16
99	0.11
100	0.09
101	0.12
102	0.11
103	0.14
104	0.16
105	0.19
106	0.22
107	0.23
108	0.24
109	0.26
110	0.3
111	0.31
112	0.33
113	0.36
114	0.37
115	0.45
116	0.46
117	0.41
118	0.41
119	0.41
120	0.41
121	0.43
122	0.44
123	0.43
124	0.41
125	0.4
126	0.37
127	0.33
128	0.33
129	0.27
130	0.26
131	0.26
132	0.25
133	0.26
134	0.26
135	0.26
136	0.21
137	0.2
138	0.17
139	0.1
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.13
144	0.14
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.16
149	0.14
150	0.15
151	0.13
152	0.13
153	0.12
154	0.12
155	0.12
156	0.08
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.08
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.09
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.12
185	0.11
186	0.11
187	0.13
188	0.13
189	0.11
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.11
195	0.09
196	0.07
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.08
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.09
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.1
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.16
220	0.18
221	0.17
222	0.17
223	0.19
224	0.15
225	0.16
226	0.17
227	0.16
228	0.14
229	0.14
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.13
234	0.12
235	0.1
236	0.11
237	0.09
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.07
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.13
256	0.15
257	0.16
258	0.18
259	0.18
260	0.21
261	0.22
262	0.2
263	0.2
264	0.18
265	0.18
266	0.17
267	0.2
268	0.2
269	0.21
270	0.21
271	0.2
272	0.2
273	0.19
274	0.18
275	0.14
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.06
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.11
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.22
309	0.3
310	0.41
311	0.46
312	0.52
313	0.6
314	0.7
315	0.79
316	0.82
317	0.84
318	0.85
319	0.87
320	0.91
321	0.93
322	0.92
323	0.9
324	0.88
325	0.85
326	0.81
327	0.73
328	0.72
329	0.64
330	0.58
331	0.49
332	0.4
333	0.32
334	0.25
335	0.22
336	0.18
337	0.15
338	0.12
339	0.17
340	0.17
341	0.18
342	0.23
343	0.25
344	0.22
345	0.27
346	0.32
347	0.32
348	0.32
349	0.34
350	0.34
351	0.36
352	0.38
353	0.37
354	0.36
355	0.34
356	0.36
357	0.35
358	0.34
359	0.31
360	0.28
361	0.26
362	0.21
363	0.19
364	0.17
365	0.16
366	0.13
367	0.13
368	0.13
369	0.14
370	0.15
371	0.15
372	0.15
373	0.15
374	0.17
375	0.18
376	0.2
377	0.2
378	0.2
379	0.22
380	0.26
381	0.29
382	0.28
383	0.27
384	0.24
385	0.21
386	0.19
387	0.16
388	0.14
389	0.14
390	0.15
391	0.16
392	0.16
393	0.15
394	0.16
395	0.17
396	0.16
397	0.15
398	0.15
399	0.14
400	0.15
401	0.14
402	0.16
403	0.15
404	0.14
405	0.12
406	0.1
407	0.09
408	0.08
409	0.06
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.07
437	0.06
438	0.08
439	0.1
440	0.1
441	0.11
442	0.12
443	0.14
444	0.18
445	0.22
446	0.22
447	0.22
448	0.25
449	0.26
450	0.26
451	0.26
452	0.21
453	0.17
454	0.16
455	0.15
456	0.12
457	0.1
458	0.08
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.08
464	0.12
465	0.12
466	0.14
467	0.13
468	0.16
469	0.17
470	0.18
471	0.21
472	0.22
473	0.23
474	0.24
475	0.23
476	0.21
477	0.2
478	0.21
479	0.17
480	0.15

A0A1Y1YNK7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer