Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1X090

Protein Details
Accession A0A1Y1X090    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-71YDPSQEKSEKRWLRKQYRDLIVNTHydrophilic
323-345TYNIRKSVIPTRRKKTNNVTGKWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027786  Nse4/EID  
IPR014854  Nse4_C  
IPR029225  Nse4_Nse3-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF15412  Nse4-Nse3_bdg  
PF08743  Nse4_C  
Amino Acid Sequences MSQPDISQNDLSQSQASQMLSASQNGISEELQALLGEKLATVSNKEAYDPSQEKSEKRWLRKQYRDLIVNTEENKKDLLNSDCDGLIDNIAKANELFKKVKNPYEATLDARLLVLSADIGTQKARRMKIDSHAFDTSEYIAKLVTIMGGRQGLEDDEGRSVLNWDAVGEIATNYTARAPSMDYILGPLATEQKTRQISKQRARLEKDKAFLTKPQELKEGDIEKQENETTKNVQAIASLLEHHGPINYFDFIINPESFSQTVENIFYLSFLIRDGKAYIDDESGQPILEACMPPTQEDYAQGLVKKQLIIELDLPTWQVIIDTYNIRKSVIPTRRKKTNNVTGKWYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.19
4 0.15
5 0.15
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.18
10 0.15
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.09
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.18
31 0.18
32 0.2
33 0.2
34 0.2
35 0.28
36 0.28
37 0.27
38 0.32
39 0.35
40 0.35
41 0.4
42 0.49
43 0.48
44 0.55
45 0.62
46 0.64
47 0.72
48 0.81
49 0.84
50 0.83
51 0.83
52 0.8
53 0.73
54 0.68
55 0.62
56 0.57
57 0.51
58 0.48
59 0.4
60 0.35
61 0.34
62 0.28
63 0.25
64 0.25
65 0.25
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.16
73 0.14
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.13
81 0.15
82 0.19
83 0.22
84 0.23
85 0.32
86 0.37
87 0.43
88 0.45
89 0.44
90 0.42
91 0.46
92 0.45
93 0.39
94 0.38
95 0.32
96 0.26
97 0.23
98 0.2
99 0.13
100 0.11
101 0.07
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.08
109 0.12
110 0.18
111 0.2
112 0.22
113 0.26
114 0.29
115 0.37
116 0.46
117 0.44
118 0.44
119 0.43
120 0.4
121 0.36
122 0.33
123 0.26
124 0.17
125 0.15
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.16
180 0.21
181 0.23
182 0.28
183 0.34
184 0.43
185 0.5
186 0.59
187 0.6
188 0.64
189 0.68
190 0.69
191 0.69
192 0.64
193 0.59
194 0.54
195 0.48
196 0.42
197 0.41
198 0.4
199 0.38
200 0.36
201 0.35
202 0.36
203 0.34
204 0.34
205 0.36
206 0.33
207 0.27
208 0.29
209 0.27
210 0.23
211 0.25
212 0.24
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.2
219 0.19
220 0.17
221 0.16
222 0.14
223 0.13
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.15
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.07
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.14
269 0.16
270 0.15
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.18
282 0.18
283 0.16
284 0.19
285 0.21
286 0.21
287 0.23
288 0.23
289 0.23
290 0.24
291 0.25
292 0.23
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.21
297 0.22
298 0.21
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.17
303 0.15
304 0.11
305 0.09
306 0.06
307 0.07
308 0.1
309 0.15
310 0.19
311 0.24
312 0.25
313 0.26
314 0.27
315 0.3
316 0.38
317 0.42
318 0.49
319 0.55
320 0.63
321 0.72
322 0.76
323 0.81
324 0.81
325 0.82
326 0.82
327 0.77