Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2I2L5

Protein Details
Accession A0A1Y2I2L5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-340LEPSQNKNKGKGKRAGGRRKAVVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-336KNKGKGKRAGGRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
Amino Acid Sequences MDLQRVYIQSQMYKPFMREEEALAIYEQACLALGMPYRPDDFPGFLTNINQALDQLNLSIRQEKHHSRDISYCLLINEEADELSKLATTLTPPQIGVFRTLVNKILDSPQGQLTSMDVLNTVPSTLMTKAVFEKTVLHKLVAEGWLEETTRGNYTVGIRTLVELKKFIEEGHPDLDRCLHCENVAIIKIECQTPDCNATYHRRCLEERKNRAGARLPCGKCQQPIMIPADVYSSTTGSSSRSSQTSGTKRARLEKPAGADEEEEEEDELMEEDDDKDEEPVAKQEPLTQRRTSTRAAAAAGTASRQRMSMGMDEDDLEPSQNKNKGKGKRAGGRRKAVVDDDDDDMDLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.4
4 0.39
5 0.35
6 0.33
7 0.34
8 0.32
9 0.31
10 0.25
11 0.24
12 0.19
13 0.18
14 0.14
15 0.08
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.08
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.15
24 0.17
25 0.17
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.22
30 0.24
31 0.24
32 0.22
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.11
45 0.12
46 0.19
47 0.18
48 0.22
49 0.3
50 0.37
51 0.41
52 0.49
53 0.5
54 0.46
55 0.51
56 0.52
57 0.48
58 0.42
59 0.37
60 0.28
61 0.28
62 0.24
63 0.18
64 0.14
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.13
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.21
82 0.21
83 0.22
84 0.17
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.17
92 0.19
93 0.2
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.14
103 0.11
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.17
121 0.19
122 0.26
123 0.25
124 0.23
125 0.22
126 0.22
127 0.24
128 0.21
129 0.17
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.11
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.15
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.2
163 0.16
164 0.17
165 0.16
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.16
185 0.25
186 0.28
187 0.33
188 0.34
189 0.34
190 0.35
191 0.44
192 0.52
193 0.53
194 0.57
195 0.59
196 0.64
197 0.61
198 0.62
199 0.61
200 0.55
201 0.51
202 0.53
203 0.47
204 0.44
205 0.48
206 0.47
207 0.4
208 0.39
209 0.35
210 0.28
211 0.31
212 0.3
213 0.26
214 0.24
215 0.22
216 0.21
217 0.18
218 0.16
219 0.12
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.16
230 0.18
231 0.27
232 0.32
233 0.39
234 0.43
235 0.46
236 0.48
237 0.56
238 0.58
239 0.55
240 0.55
241 0.49
242 0.48
243 0.47
244 0.45
245 0.37
246 0.32
247 0.27
248 0.25
249 0.21
250 0.17
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.12
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.22
272 0.31
273 0.36
274 0.41
275 0.41
276 0.44
277 0.48
278 0.53
279 0.49
280 0.45
281 0.43
282 0.4
283 0.39
284 0.34
285 0.28
286 0.25
287 0.22
288 0.18
289 0.16
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.16
296 0.19
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.21
301 0.21
302 0.22
303 0.19
304 0.16
305 0.14
306 0.15
307 0.21
308 0.26
309 0.28
310 0.36
311 0.44
312 0.52
313 0.61
314 0.67
315 0.7
316 0.73
317 0.82
318 0.84
319 0.85
320 0.85
321 0.82
322 0.78
323 0.73
324 0.68
325 0.6
326 0.54
327 0.47
328 0.41
329 0.35