Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HHC3

Protein Details
Accession A0A1Y2HHC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-91GDTVEFKKKHRMLRIRLLDDHydrophilic
600-676VTTANPTRKRCLQLRKPSRRRRLPCSRPSTTRHPATRPRGNANCKMPQSRYRSPCRTWSTRQRRWRARWRPRRRKCGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
614-621RKPSRRRR
660-674RQRRWRARWRPRRRK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 6, cyto 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019749  Band_41_domain  
IPR014352  FERM/acyl-CoA-bd_prot_sf  
IPR035963  FERM_2  
IPR019748  FERM_central  
IPR019747  FERM_CS  
IPR000299  FERM_domain  
IPR032425  FERM_f0  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005856  C:cytoskeleton  
Pfam View protein in Pfam  
PF16511  FERM_f0  
PF00373  FERM_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00660  FERM_1  
PS50057  FERM_3  
CDD cd14473  FERM_B-lobe  
cd10569  FERM_C_Talin  
cd17089  FERM_F0_TLN  
cd17090  FERM_F1_TLN  
Amino Acid Sequences MATISLKVHLCSQQTVKTLQFDASSSVHEACLEIRRKLGDAVGGEDHALFWPAKSKWLVPTKTLAFYELAPGDTVEFKKKHRMLRIRLLDDTVKTVLIDDSLPVLLLAQSICGKIGIANQDEYSLALEEHVDVTKGAKKKSLDSTDNVTWLNPEKSLPEQGVEESATLLLKKKFFYSDQNVDRTDPIQLHLIYQQSRDGIISGKHACTVDEAVQFAALQMQIVHGNHDDAKHKLGFLNLREFLPEEYRKAKDIEKRIYGEHRKLVNMPELTVKHRYVQLCRSLKTYGVTFFAVKEKDTKKNKVVARMIGISKDAILRCDAESKEVLQTWPLTSLRRWAASPTMFTMDFGDYQDAFYSVQTTQGEQMSQLIAGYIDIIIKRKKEADRAIATGAEEVITTEEVVRPARAQAIAIKPAQVNTAQEIVLAQQGELASEGANAATVGQAAMRTTHQAAMSSIQPVAVNVVNPPSPDPGVAAVLQRVSQGQSAVQTLVTEMTLALAMPVNSRDASPTDPARLFAQTTALAHLASHLAAAAAVVQATSIVDTPAIAHHVGQLSTNLNSLGAAAKTLHANGAANQLPELTRDIANATNRLLATVQEAVTTANPTRKRCLQLRKPSRRRRLPCSRPSTTRHPATRPRGNANCKMPQSRYRSPCRTWSTRQRRWRARWRPRRRKCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.41
4 0.4
5 0.39
6 0.35
7 0.32
8 0.26
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.21
14 0.19
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.24
19 0.26
20 0.25
21 0.27
22 0.28
23 0.3
24 0.31
25 0.3
26 0.26
27 0.23
28 0.26
29 0.24
30 0.23
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.14
35 0.14
36 0.1
37 0.08
38 0.15
39 0.15
40 0.21
41 0.23
42 0.26
43 0.33
44 0.43
45 0.46
46 0.41
47 0.49
48 0.48
49 0.51
50 0.49
51 0.41
52 0.33
53 0.3
54 0.33
55 0.26
56 0.22
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.19
61 0.21
62 0.23
63 0.24
64 0.27
65 0.37
66 0.43
67 0.5
68 0.56
69 0.65
70 0.66
71 0.74
72 0.81
73 0.76
74 0.72
75 0.68
76 0.61
77 0.52
78 0.47
79 0.36
80 0.26
81 0.21
82 0.19
83 0.15
84 0.13
85 0.12
86 0.08
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.13
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.16
111 0.11
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.09
121 0.15
122 0.19
123 0.2
124 0.24
125 0.26
126 0.32
127 0.42
128 0.48
129 0.46
130 0.46
131 0.53
132 0.5
133 0.51
134 0.45
135 0.35
136 0.28
137 0.28
138 0.26
139 0.19
140 0.17
141 0.16
142 0.19
143 0.23
144 0.21
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.17
150 0.14
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.18
160 0.21
161 0.24
162 0.32
163 0.37
164 0.43
165 0.48
166 0.51
167 0.51
168 0.48
169 0.47
170 0.38
171 0.32
172 0.23
173 0.18
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.19
178 0.22
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.16
189 0.17
190 0.16
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.19
196 0.18
197 0.16
198 0.16
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.16
216 0.14
217 0.18
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.19
222 0.22
223 0.22
224 0.28
225 0.26
226 0.26
227 0.26
228 0.26
229 0.23
230 0.25
231 0.24
232 0.2
233 0.23
234 0.24
235 0.25
236 0.27
237 0.31
238 0.31
239 0.39
240 0.43
241 0.44
242 0.44
243 0.46
244 0.53
245 0.55
246 0.52
247 0.5
248 0.45
249 0.41
250 0.41
251 0.4
252 0.37
253 0.31
254 0.27
255 0.26
256 0.25
257 0.27
258 0.29
259 0.27
260 0.23
261 0.27
262 0.28
263 0.27
264 0.31
265 0.38
266 0.38
267 0.38
268 0.39
269 0.35
270 0.34
271 0.32
272 0.28
273 0.2
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.15
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.21
282 0.23
283 0.31
284 0.38
285 0.43
286 0.44
287 0.51
288 0.54
289 0.55
290 0.55
291 0.48
292 0.45
293 0.42
294 0.38
295 0.31
296 0.28
297 0.19
298 0.16
299 0.16
300 0.12
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.15
306 0.14
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.16
325 0.19
326 0.19
327 0.2
328 0.16
329 0.17
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.08
344 0.06
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.11
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.07
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.17
368 0.19
369 0.26
370 0.31
371 0.37
372 0.38
373 0.4
374 0.4
375 0.35
376 0.32
377 0.25
378 0.19
379 0.11
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.13
396 0.16
397 0.19
398 0.19
399 0.21
400 0.19
401 0.19
402 0.2
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.06
434 0.08
435 0.09
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.13
443 0.12
444 0.11
445 0.1
446 0.09
447 0.11
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.06
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.1
494 0.11
495 0.14
496 0.17
497 0.19
498 0.23
499 0.23
500 0.24
501 0.25
502 0.24
503 0.22
504 0.18
505 0.19
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.14
510 0.13
511 0.11
512 0.12
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.06
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.11
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.15
543 0.15
544 0.16
545 0.13
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.11
559 0.11
560 0.18
561 0.19
562 0.18
563 0.18
564 0.18
565 0.17
566 0.18
567 0.19
568 0.15
569 0.13
570 0.13
571 0.16
572 0.2
573 0.23
574 0.23
575 0.21
576 0.23
577 0.22
578 0.22
579 0.21
580 0.16
581 0.16
582 0.17
583 0.16
584 0.13
585 0.13
586 0.13
587 0.14
588 0.17
589 0.16
590 0.21
591 0.26
592 0.29
593 0.36
594 0.43
595 0.49
596 0.55
597 0.64
598 0.67
599 0.73
600 0.82
601 0.86
602 0.9
603 0.93
604 0.95
605 0.95
606 0.93
607 0.92
608 0.92
609 0.91
610 0.91
611 0.89
612 0.87
613 0.84
614 0.82
615 0.82
616 0.8
617 0.79
618 0.76
619 0.76
620 0.77
621 0.79
622 0.82
623 0.79
624 0.8
625 0.8
626 0.81
627 0.8
628 0.78
629 0.77
630 0.74
631 0.75
632 0.71
633 0.7
634 0.71
635 0.72
636 0.73
637 0.74
638 0.76
639 0.74
640 0.77
641 0.78
642 0.77
643 0.77
644 0.8
645 0.81
646 0.82
647 0.88
648 0.89
649 0.9
650 0.92
651 0.93
652 0.93
653 0.93
654 0.95
655 0.95
656 0.96