Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HLM1

Protein Details
Accession A0A1Y2HLM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-56RQPSSPSTSSPKPKGKNKNKHKDVVQTSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-46KPKGKNKNK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027921  NOPCHAP1  
Gene Ontology GO:0000492  P:box C/D snoRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF15370  NOPCHAP1  
Amino Acid Sequences MDSTSLSPSLSARAVTGSSDAAAVPPRQPSSPSTSSPKPKGKNKNKHKDVVQTSKALLASEFTPDSSSPAILTSATTAPRAKPAIMPFAPNSSLLSRLDAFLPQLQQANTSLFAAMAKEDGEEERKRKFDIESVTPGQDRVIEMKLGLGLFEARNPSSHEDVLPLPSGGPVSAPPAISFRGPRIYSAGDMDVDTSSSDQDDDEDDSQDDSDDDRMSGEEEAIMAESLQDMVMRFYNEPLGEGGSGEDEDDEDQDADDSDEEHEGSGTRTPLVQEMMEGVERRHRVPNGEYLFVPLGSMVDLSKSSRPSDLGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.19
13 0.21
14 0.22
15 0.24
16 0.27
17 0.32
18 0.36
19 0.39
20 0.42
21 0.48
22 0.57
23 0.64
24 0.69
25 0.7
26 0.74
27 0.81
28 0.84
29 0.86
30 0.88
31 0.9
32 0.9
33 0.89
34 0.86
35 0.85
36 0.83
37 0.83
38 0.76
39 0.67
40 0.59
41 0.54
42 0.48
43 0.38
44 0.28
45 0.19
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.12
50 0.13
51 0.12
52 0.15
53 0.14
54 0.13
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.11
62 0.12
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.2
67 0.21
68 0.2
69 0.22
70 0.24
71 0.3
72 0.29
73 0.32
74 0.28
75 0.3
76 0.3
77 0.26
78 0.25
79 0.17
80 0.19
81 0.16
82 0.17
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.12
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.11
109 0.14
110 0.16
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.23
116 0.23
117 0.26
118 0.28
119 0.31
120 0.32
121 0.33
122 0.31
123 0.3
124 0.25
125 0.2
126 0.16
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.13
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.04
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.19
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.18
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.06
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.16
259 0.14
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.15
266 0.2
267 0.22
268 0.24
269 0.3
270 0.3
271 0.33
272 0.36
273 0.45
274 0.43
275 0.44
276 0.42
277 0.39
278 0.38
279 0.32
280 0.29
281 0.18
282 0.14
283 0.11
284 0.11
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.12
289 0.16
290 0.19
291 0.2
292 0.23
293 0.25