Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8PIC9

Protein Details
Accession B8PIC9    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSAAQKLTKKQKKALAFRERKGKGKHydrophilic
91-114VEGGEQSKPKKKKRKATNSEGVATHydrophilic
227-262ESRLEKLKRRNKELHEQREKQLKKQKKGPQNGSEEVBasic
291-317TVDEETKRSKKSKKRPPKALGTGVNAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-27TKKQKKALAFRERKGKGKAK
75-105EGGRPAQKRKREEEKPVEGGEQSKPKKKKRK
228-254SRLEKLKRRNKELHEQREKQLKKQKKG
297-308KRSKKSKKRPPK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_103661  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSAAQKLTKKQKKALAFRERKGKGKAKAVDEDNDVPVEENLDLVEAQVEDSHVEDPQGRGKPEATTLGEAKRVVEGGRPAQKRKREEEKPVEGGEQSKPKKKKRKATNSEGVATGDAATEAGEQPADMESKVKQKQRFILFVGNLKYTTTREAIQKHFAVCDPPPSIRLITPKASPSGKTTAKSKGCAFLEFGSRNALQQALKLHQSELEGRMINVELTAGGGGKSESRLEKLKRRNKELHEQREKQLKKQKKGPQNGSEEVHAPRPQRYSATSGVDQTPSKKHTWTVGDTVDEETKRSKKSKKRPPKALGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.82
4 0.82
5 0.85
6 0.82
7 0.79
8 0.78
9 0.76
10 0.73
11 0.73
12 0.73
13 0.69
14 0.72
15 0.69
16 0.64
17 0.61
18 0.56
19 0.47
20 0.4
21 0.33
22 0.26
23 0.21
24 0.19
25 0.12
26 0.09
27 0.07
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.18
44 0.22
45 0.22
46 0.23
47 0.24
48 0.25
49 0.26
50 0.3
51 0.25
52 0.25
53 0.26
54 0.27
55 0.29
56 0.27
57 0.25
58 0.2
59 0.18
60 0.15
61 0.16
62 0.18
63 0.22
64 0.31
65 0.35
66 0.41
67 0.48
68 0.55
69 0.58
70 0.63
71 0.66
72 0.65
73 0.72
74 0.75
75 0.75
76 0.72
77 0.67
78 0.59
79 0.5
80 0.44
81 0.38
82 0.38
83 0.34
84 0.39
85 0.45
86 0.54
87 0.64
88 0.71
89 0.76
90 0.78
91 0.85
92 0.86
93 0.88
94 0.88
95 0.82
96 0.75
97 0.66
98 0.55
99 0.43
100 0.33
101 0.23
102 0.13
103 0.08
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.06
114 0.05
115 0.06
116 0.08
117 0.16
118 0.22
119 0.28
120 0.31
121 0.35
122 0.42
123 0.46
124 0.48
125 0.42
126 0.43
127 0.39
128 0.4
129 0.38
130 0.31
131 0.26
132 0.23
133 0.21
134 0.15
135 0.16
136 0.13
137 0.13
138 0.16
139 0.21
140 0.23
141 0.27
142 0.28
143 0.26
144 0.25
145 0.23
146 0.21
147 0.17
148 0.19
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.19
156 0.18
157 0.19
158 0.2
159 0.21
160 0.23
161 0.23
162 0.23
163 0.22
164 0.26
165 0.27
166 0.27
167 0.29
168 0.35
169 0.36
170 0.38
171 0.36
172 0.35
173 0.33
174 0.33
175 0.31
176 0.24
177 0.28
178 0.25
179 0.25
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.18
184 0.18
185 0.11
186 0.13
187 0.15
188 0.14
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.18
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.13
202 0.1
203 0.08
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.12
216 0.2
217 0.25
218 0.35
219 0.45
220 0.53
221 0.59
222 0.67
223 0.73
224 0.73
225 0.78
226 0.8
227 0.81
228 0.83
229 0.78
230 0.77
231 0.79
232 0.74
233 0.72
234 0.71
235 0.7
236 0.68
237 0.73
238 0.76
239 0.75
240 0.84
241 0.85
242 0.84
243 0.82
244 0.78
245 0.71
246 0.63
247 0.56
248 0.47
249 0.43
250 0.38
251 0.32
252 0.31
253 0.32
254 0.32
255 0.32
256 0.33
257 0.33
258 0.34
259 0.39
260 0.36
261 0.36
262 0.37
263 0.37
264 0.35
265 0.34
266 0.35
267 0.32
268 0.32
269 0.31
270 0.31
271 0.35
272 0.41
273 0.42
274 0.41
275 0.41
276 0.41
277 0.4
278 0.41
279 0.39
280 0.32
281 0.29
282 0.3
283 0.32
284 0.36
285 0.43
286 0.49
287 0.54
288 0.65
289 0.75
290 0.8
291 0.85
292 0.9
293 0.92
294 0.93
295 0.92
296 0.91
297 0.87
298 0.82
299 0.76
300 0.65