FuNGI

A0A1Y2HFT6

Protein Details

Accession

A0A1Y2HFT6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-61	NSTSNRSRRPHHPSSNTTPTT	Hydrophilic
245-266	SSFARFKAKKKASKPREYCRYF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
251-258	KAKKKASK
390-391	KG

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045348 CPSF4/Yth1 IPR000571 Znf_CCCH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0098789 P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
PROSITE	View protein in PROSITE PS50103 ZF_C3H1

Amino Acid Sequences

MAYHPYYHPLPVPVPIPVPHYHPHPHPLPHPHPLPLPLDPNSTSNRSRRPHHPSSNTTPTTTTTTKSRPSNTTWFSTPTPTSTPTPTPTPATPNHASKETSRASSLPPSLPPTLSTPTAGSTSTPHTSSRLSIAISTSRPASVPPNLPSAASSVSSARPSTPRSTSTAGRFTPYSYTANPTRKRPTAPPFLTRALAHYHSPMGYAPAFPPYPATPAHYASTPVPYSPYAAPMYSPIPVPPPPTSSSFARFKAKKKASKPREYCRYFHLWGTSKCRNGNHCPHLHTATRVRLCPSLLFPPASPHSPSSCDLNHTPTDNNTPHCTFFLATGACHRARCAFLHVKLGADTKTCTDFDTWQYCARGRECTRVHALTKVDPESRLGKRLADKANKGKAMDHKGKSAARVGMDDIEVPDMSDDEQTNLDEEFIPIPDSDDEQADRGMSARAVRRGSTSTADMDDDEDEFAVPQTTRTTTESDIEDEDEDELVWIEDVEPEQTTRVMDVDSGSDSDSTSDLQVTNYDVPSPITTNTSTVSVKTNTSTMAARKKKSKLDDAFF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.29
4	0.27
5	0.31
6	0.3
7	0.35
8	0.38
9	0.4
10	0.45
11	0.47
12	0.51
13	0.54
14	0.61
15	0.62
16	0.64
17	0.63
18	0.6
19	0.57
20	0.55
21	0.51
22	0.46
23	0.45
24	0.39
25	0.4
26	0.38
27	0.38
28	0.39
29	0.4
30	0.41
31	0.43
32	0.5
33	0.51
34	0.56
35	0.63
36	0.67
37	0.72
38	0.77
39	0.79
40	0.78
41	0.81
42	0.85
43	0.77
44	0.7
45	0.61
46	0.53
47	0.5
48	0.43
49	0.37
50	0.33
51	0.37
52	0.43
53	0.48
54	0.51
55	0.49
56	0.55
57	0.62
58	0.59
59	0.58
60	0.53
61	0.51
62	0.47
63	0.48
64	0.42
65	0.36
66	0.35
67	0.34
68	0.34
69	0.34
70	0.37
71	0.35
72	0.38
73	0.37
74	0.38
75	0.37
76	0.39
77	0.38
78	0.41
79	0.43
80	0.44
81	0.45
82	0.43
83	0.43
84	0.39
85	0.44
86	0.39
87	0.36
88	0.32
89	0.3
90	0.3
91	0.35
92	0.37
93	0.31
94	0.3
95	0.33
96	0.33
97	0.32
98	0.3
99	0.28
100	0.28
101	0.26
102	0.25
103	0.21
104	0.2
105	0.21
106	0.2
107	0.16
108	0.14
109	0.18
110	0.19
111	0.2
112	0.19
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.23
117	0.2
118	0.18
119	0.17
120	0.18
121	0.2
122	0.2
123	0.2
124	0.17
125	0.16
126	0.15
127	0.16
128	0.18
129	0.2
130	0.25
131	0.25
132	0.29
133	0.29
134	0.29
135	0.28
136	0.26
137	0.21
138	0.16
139	0.15
140	0.12
141	0.14
142	0.16
143	0.16
144	0.16
145	0.18
146	0.21
147	0.25
148	0.27
149	0.27
150	0.31
151	0.34
152	0.37
153	0.39
154	0.42
155	0.38
156	0.37
157	0.35
158	0.31
159	0.3
160	0.28
161	0.25
162	0.2
163	0.24
164	0.29
165	0.38
166	0.41
167	0.44
168	0.49
169	0.5
170	0.53
171	0.57
172	0.58
173	0.59
174	0.6
175	0.58
176	0.56
177	0.54
178	0.52
179	0.43
180	0.37
181	0.31
182	0.28
183	0.24
184	0.2
185	0.18
186	0.16
187	0.17
188	0.15
189	0.13
190	0.11
191	0.11
192	0.1
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.14
197	0.12
198	0.14
199	0.14
200	0.17
201	0.16
202	0.18
203	0.19
204	0.17
205	0.19
206	0.17
207	0.21
208	0.18
209	0.15
210	0.15
211	0.14
212	0.16
213	0.15
214	0.17
215	0.14
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.14
220	0.12
221	0.12
222	0.09
223	0.11
224	0.13
225	0.16
226	0.15
227	0.17
228	0.19
229	0.23
230	0.26
231	0.25
232	0.29
233	0.31
234	0.32
235	0.38
236	0.4
237	0.41
238	0.48
239	0.54
240	0.57
241	0.62
242	0.7
243	0.72
244	0.79
245	0.82
246	0.81
247	0.83
248	0.8
249	0.71
250	0.66
251	0.62
252	0.53
253	0.46
254	0.43
255	0.38
256	0.38
257	0.44
258	0.44
259	0.4
260	0.42
261	0.43
262	0.42
263	0.44
264	0.49
265	0.49
266	0.47
267	0.47
268	0.47
269	0.47
270	0.43
271	0.39
272	0.34
273	0.35
274	0.34
275	0.31
276	0.3
277	0.28
278	0.28
279	0.25
280	0.22
281	0.19
282	0.19
283	0.18
284	0.16
285	0.19
286	0.2
287	0.21
288	0.2
289	0.18
290	0.18
291	0.2
292	0.21
293	0.21
294	0.2
295	0.21
296	0.21
297	0.23
298	0.23
299	0.21
300	0.21
301	0.19
302	0.25
303	0.24
304	0.25
305	0.25
306	0.25
307	0.25
308	0.24
309	0.23
310	0.17
311	0.15
312	0.16
313	0.13
314	0.11
315	0.13
316	0.17
317	0.17
318	0.17
319	0.17
320	0.15
321	0.17
322	0.18
323	0.22
324	0.24
325	0.25
326	0.31
327	0.31
328	0.29
329	0.29
330	0.29
331	0.23
332	0.18
333	0.17
334	0.12
335	0.15
336	0.14
337	0.14
338	0.14
339	0.16
340	0.2
341	0.23
342	0.23
343	0.24
344	0.26
345	0.27
346	0.29
347	0.28
348	0.32
349	0.3
350	0.38
351	0.36
352	0.38
353	0.42
354	0.42
355	0.41
356	0.37
357	0.37
358	0.32
359	0.34
360	0.33
361	0.3
362	0.26
363	0.28
364	0.3
365	0.3
366	0.3
367	0.27
368	0.27
369	0.3
370	0.38
371	0.44
372	0.44
373	0.5
374	0.55
375	0.61
376	0.6
377	0.56
378	0.53
379	0.53
380	0.55
381	0.57
382	0.5
383	0.46
384	0.49
385	0.5
386	0.47
387	0.44
388	0.37
389	0.29
390	0.28
391	0.25
392	0.21
393	0.2
394	0.18
395	0.13
396	0.12
397	0.11
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.09
415	0.08
416	0.1
417	0.1
418	0.12
419	0.12
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.13
430	0.17
431	0.23
432	0.24
433	0.25
434	0.27
435	0.29
436	0.32
437	0.3
438	0.28
439	0.24
440	0.24
441	0.24
442	0.21
443	0.2
444	0.17
445	0.14
446	0.12
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.08
453	0.08
454	0.11
455	0.12
456	0.15
457	0.17
458	0.2
459	0.2
460	0.24
461	0.25
462	0.25
463	0.24
464	0.23
465	0.21
466	0.18
467	0.17
468	0.13
469	0.11
470	0.09
471	0.08
472	0.07
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.07
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.1
482	0.1
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.12
493	0.11
494	0.11
495	0.11
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.11
500	0.1
501	0.11
502	0.12
503	0.15
504	0.18
505	0.17
506	0.17
507	0.16
508	0.18
509	0.2
510	0.21
511	0.18
512	0.18
513	0.19
514	0.2
515	0.21
516	0.23
517	0.22
518	0.21
519	0.25
520	0.24
521	0.25
522	0.25
523	0.25
524	0.22
525	0.24
526	0.27
527	0.29
528	0.38
529	0.44
530	0.49
531	0.57
532	0.64
533	0.7
534	0.74
535	0.77

A0A1Y2HFT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer