Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8P8B0

Protein Details
Accession B8P8B0    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24YLIRKSSQRARKTPLKAGIKEHydrophilic
79-110DYEPSAPPRRSRKLSPRKKASARNRQDSHKNPHydrophilic
127-146SNVCKRTKVKGPATKNNQTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-118PPRRSRKLSPRKKASARNRQDSHKNPASGRVRRP
189-204GKSHKARSGKRGPRPT
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ppl:POSPLDRAFT_104619  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MAPYLIRKSSQRARKTPLKAGIKEFDHGDLQDLHPSSPFTSGTQSLSSSSDTLPSSPPSSAGSPDYCPPSPSLSSCSSDYEPSAPPRRSRKLSPRKKASARNRQDSHKNPASGRVRRPPNAFIIFRSNVCKRTKVKGPATKNNQTTTSCAAAILWNSLSDAEKAPWATRAAEAKAQHKLQHPDYKYTPGKSHKARSGKRGPRPTKLEISRSETMAKLLGQGFEGAELNRRLELIYGEANSPLPSSPRTRGPHVSQSTSKRATKSRTTKVSDFEGDFQPEVAFENMHISDMATPELVASSPDSDDGQLLQEVSTPSSSVSHEVQGQSGKEVGGSLVDAAEESMLVDGQSLIFYDGFAQGSPLLTSLPISIAPIDFENMNSQSDLFSMESEFYDDSHLEELVRPLIDEHAANAVMDIDFSEWINDPAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.79
3 0.8
4 0.8
5 0.81
6 0.76
7 0.75
8 0.74
9 0.67
10 0.61
11 0.54
12 0.46
13 0.39
14 0.33
15 0.29
16 0.24
17 0.22
18 0.26
19 0.25
20 0.23
21 0.21
22 0.23
23 0.21
24 0.21
25 0.21
26 0.16
27 0.19
28 0.21
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.19
36 0.17
37 0.19
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.21
42 0.21
43 0.2
44 0.21
45 0.2
46 0.21
47 0.22
48 0.23
49 0.23
50 0.23
51 0.27
52 0.32
53 0.29
54 0.29
55 0.28
56 0.29
57 0.29
58 0.29
59 0.3
60 0.28
61 0.31
62 0.31
63 0.34
64 0.31
65 0.29
66 0.29
67 0.27
68 0.27
69 0.31
70 0.39
71 0.38
72 0.43
73 0.52
74 0.59
75 0.62
76 0.68
77 0.71
78 0.74
79 0.81
80 0.84
81 0.85
82 0.87
83 0.9
84 0.9
85 0.9
86 0.9
87 0.89
88 0.88
89 0.83
90 0.81
91 0.82
92 0.78
93 0.77
94 0.73
95 0.67
96 0.57
97 0.62
98 0.63
99 0.61
100 0.62
101 0.62
102 0.62
103 0.64
104 0.68
105 0.62
106 0.6
107 0.59
108 0.53
109 0.46
110 0.46
111 0.41
112 0.39
113 0.41
114 0.37
115 0.37
116 0.38
117 0.42
118 0.39
119 0.45
120 0.52
121 0.56
122 0.62
123 0.65
124 0.72
125 0.75
126 0.8
127 0.81
128 0.76
129 0.69
130 0.63
131 0.55
132 0.48
133 0.42
134 0.35
135 0.26
136 0.22
137 0.19
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.17
157 0.18
158 0.22
159 0.24
160 0.25
161 0.29
162 0.3
163 0.31
164 0.34
165 0.37
166 0.39
167 0.46
168 0.44
169 0.44
170 0.45
171 0.49
172 0.47
173 0.44
174 0.44
175 0.41
176 0.47
177 0.47
178 0.52
179 0.51
180 0.57
181 0.59
182 0.62
183 0.67
184 0.68
185 0.71
186 0.75
187 0.73
188 0.71
189 0.73
190 0.68
191 0.66
192 0.62
193 0.59
194 0.52
195 0.54
196 0.47
197 0.42
198 0.38
199 0.29
200 0.25
201 0.2
202 0.16
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.09
231 0.12
232 0.15
233 0.23
234 0.27
235 0.31
236 0.37
237 0.41
238 0.48
239 0.48
240 0.5
241 0.48
242 0.5
243 0.53
244 0.53
245 0.51
246 0.45
247 0.47
248 0.48
249 0.52
250 0.56
251 0.57
252 0.6
253 0.64
254 0.63
255 0.61
256 0.6
257 0.53
258 0.45
259 0.39
260 0.33
261 0.29
262 0.25
263 0.22
264 0.17
265 0.14
266 0.14
267 0.1
268 0.08
269 0.06
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.17
308 0.17
309 0.19
310 0.21
311 0.2
312 0.18
313 0.18
314 0.16
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.13
377 0.11
378 0.13
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.12
384 0.13
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.14
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.15
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.09