Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HX63

Protein Details
Accession A0A1Y2HX63    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
452-477PPMGMGPPQRRPPKRPRPSYSTNWDEHydrophilic
548-571DELAEREERERRNKRRKLLQGDSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-289RDRERERERERGRDRDRP
460-468QRRPPKRPR
556-564RERRNKRRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MSDFDRLMALARGKSDAAARAAEDLRRRKEQEEARRQADLDRERVQAEERRRVMRQRAEQAQRLQISAVRDVVAASNGTKPLPQRPAAAAPAPAPTSVKHRARSDPEQMPRRQPAHHPPPPSSSSSNRYANGNGYHDHWDRDQSRDRHHNSDPRLAAASATAPLTKKPVSFHDMLARAAANTPDRLRSIQVANKLPQPDRAANGLPSSRSTVDDLPPIPKLNSAQRDPHRPPPPVSASSQAAASRPPVRRANEHAFGSTHASTRPPPMASARDRERERERERGRDRDRPISNRPSAPSSRPPVSSSTSAARPPVSSSASRPTVSSRLAAPPSSSRPPVSSSHQPRPLAQQRPPVSSSAPPRAPPSSTGRAPVSASSRPPVSRSGSTMSPSSRSAGPPPAPHPGSSGRPPVSARRPAAPSSTSVAPVRPPVSSTSRPPVSARSATSSSSSRAPPMGMGPPQRRPPKRPRPSYSTNWDEYDTADDYASDVADEDLDPDLNVSAVIQQVFGRRHRPVYVNDLDDDDDDMEVGYEDAWREEARSSAIARREDELAEREERERRNKRRKLLQGDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.24
8 0.26
9 0.29
10 0.35
11 0.39
12 0.43
13 0.51
14 0.53
15 0.5
16 0.57
17 0.63
18 0.66
19 0.68
20 0.7
21 0.66
22 0.66
23 0.64
24 0.59
25 0.58
26 0.53
27 0.48
28 0.44
29 0.42
30 0.4
31 0.41
32 0.42
33 0.4
34 0.42
35 0.46
36 0.46
37 0.5
38 0.54
39 0.61
40 0.65
41 0.68
42 0.69
43 0.69
44 0.73
45 0.76
46 0.78
47 0.76
48 0.75
49 0.66
50 0.57
51 0.48
52 0.41
53 0.36
54 0.31
55 0.26
56 0.19
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.15
61 0.13
62 0.11
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.25
69 0.3
70 0.32
71 0.32
72 0.36
73 0.41
74 0.43
75 0.42
76 0.36
77 0.3
78 0.31
79 0.28
80 0.24
81 0.2
82 0.17
83 0.22
84 0.3
85 0.35
86 0.38
87 0.43
88 0.5
89 0.57
90 0.64
91 0.66
92 0.65
93 0.69
94 0.71
95 0.71
96 0.71
97 0.7
98 0.66
99 0.61
100 0.6
101 0.61
102 0.63
103 0.65
104 0.61
105 0.57
106 0.61
107 0.61
108 0.57
109 0.51
110 0.47
111 0.46
112 0.48
113 0.5
114 0.45
115 0.43
116 0.4
117 0.4
118 0.38
119 0.35
120 0.29
121 0.26
122 0.32
123 0.31
124 0.31
125 0.27
126 0.31
127 0.3
128 0.36
129 0.42
130 0.4
131 0.48
132 0.55
133 0.59
134 0.58
135 0.63
136 0.65
137 0.61
138 0.65
139 0.56
140 0.48
141 0.46
142 0.39
143 0.32
144 0.24
145 0.2
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.22
156 0.26
157 0.27
158 0.29
159 0.33
160 0.33
161 0.32
162 0.3
163 0.25
164 0.2
165 0.19
166 0.19
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.17
173 0.18
174 0.19
175 0.23
176 0.24
177 0.3
178 0.33
179 0.34
180 0.37
181 0.4
182 0.37
183 0.37
184 0.38
185 0.33
186 0.31
187 0.32
188 0.29
189 0.26
190 0.28
191 0.24
192 0.19
193 0.18
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.21
201 0.21
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.22
209 0.27
210 0.28
211 0.35
212 0.38
213 0.48
214 0.51
215 0.58
216 0.57
217 0.55
218 0.54
219 0.53
220 0.54
221 0.47
222 0.45
223 0.4
224 0.34
225 0.31
226 0.3
227 0.23
228 0.17
229 0.15
230 0.16
231 0.19
232 0.19
233 0.25
234 0.29
235 0.31
236 0.35
237 0.42
238 0.46
239 0.45
240 0.44
241 0.39
242 0.34
243 0.32
244 0.32
245 0.25
246 0.19
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.16
251 0.18
252 0.14
253 0.14
254 0.17
255 0.22
256 0.24
257 0.3
258 0.32
259 0.37
260 0.38
261 0.42
262 0.46
263 0.49
264 0.5
265 0.54
266 0.53
267 0.56
268 0.6
269 0.65
270 0.64
271 0.63
272 0.63
273 0.62
274 0.64
275 0.6
276 0.62
277 0.6
278 0.57
279 0.52
280 0.49
281 0.45
282 0.43
283 0.41
284 0.4
285 0.37
286 0.36
287 0.35
288 0.34
289 0.32
290 0.33
291 0.3
292 0.26
293 0.24
294 0.23
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.16
299 0.16
300 0.17
301 0.16
302 0.15
303 0.17
304 0.22
305 0.24
306 0.24
307 0.23
308 0.23
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.18
313 0.2
314 0.21
315 0.21
316 0.19
317 0.19
318 0.24
319 0.26
320 0.26
321 0.22
322 0.22
323 0.25
324 0.27
325 0.29
326 0.34
327 0.39
328 0.46
329 0.52
330 0.52
331 0.49
332 0.56
333 0.59
334 0.55
335 0.52
336 0.53
337 0.5
338 0.53
339 0.53
340 0.44
341 0.38
342 0.36
343 0.38
344 0.36
345 0.35
346 0.32
347 0.34
348 0.35
349 0.34
350 0.32
351 0.34
352 0.33
353 0.32
354 0.34
355 0.32
356 0.31
357 0.31
358 0.3
359 0.27
360 0.23
361 0.23
362 0.22
363 0.24
364 0.23
365 0.24
366 0.25
367 0.25
368 0.24
369 0.26
370 0.27
371 0.27
372 0.28
373 0.29
374 0.26
375 0.24
376 0.23
377 0.22
378 0.21
379 0.2
380 0.22
381 0.26
382 0.28
383 0.29
384 0.32
385 0.37
386 0.36
387 0.35
388 0.35
389 0.33
390 0.34
391 0.35
392 0.39
393 0.32
394 0.34
395 0.36
396 0.4
397 0.44
398 0.47
399 0.44
400 0.43
401 0.45
402 0.44
403 0.47
404 0.4
405 0.34
406 0.3
407 0.3
408 0.27
409 0.24
410 0.23
411 0.2
412 0.24
413 0.23
414 0.18
415 0.18
416 0.2
417 0.27
418 0.3
419 0.34
420 0.38
421 0.39
422 0.4
423 0.41
424 0.41
425 0.4
426 0.4
427 0.37
428 0.35
429 0.34
430 0.34
431 0.36
432 0.32
433 0.28
434 0.28
435 0.27
436 0.23
437 0.22
438 0.21
439 0.19
440 0.2
441 0.24
442 0.24
443 0.32
444 0.36
445 0.42
446 0.51
447 0.6
448 0.63
449 0.66
450 0.72
451 0.75
452 0.8
453 0.84
454 0.83
455 0.82
456 0.83
457 0.84
458 0.82
459 0.78
460 0.71
461 0.63
462 0.56
463 0.48
464 0.41
465 0.36
466 0.28
467 0.21
468 0.17
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.07
474 0.06
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.05
487 0.06
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.1
492 0.16
493 0.21
494 0.25
495 0.3
496 0.32
497 0.36
498 0.41
499 0.44
500 0.43
501 0.48
502 0.51
503 0.48
504 0.45
505 0.43
506 0.38
507 0.34
508 0.31
509 0.22
510 0.15
511 0.12
512 0.1
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.11
524 0.12
525 0.14
526 0.17
527 0.19
528 0.23
529 0.3
530 0.33
531 0.34
532 0.35
533 0.34
534 0.33
535 0.34
536 0.32
537 0.3
538 0.3
539 0.3
540 0.32
541 0.37
542 0.43
543 0.5
544 0.57
545 0.63
546 0.71
547 0.78
548 0.83
549 0.87
550 0.9
551 0.9