FuNGI

A0A1Y2HTD0

Protein Details

Accession

A0A1Y2HTD0

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-93	PADAKPKATSSSKKKKQPKTKYEAKPISSE	Hydrophilic
127-146	PTSANQKRRHALKKLKLAAA	Hydrophilic
716-737	GGKKERMQKKAERQLREQQARE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-84	KPKATSSSKKKKQPKTK
468-475	KSRVAKGA

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9, mito 6, cyto 5.5, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68

Amino Acid Sequences

MDLIMTKAQSLALLATTAEARQTYGLRHDDFQRYRSFCSRRVQRLRVASGLKQQVPVNDPQPAPADAKPKATSSSKKKKQPKTKYEAKPISSETATDLRHVRTLVFTTERYWAYANDLLEQAKVADPTSANQKRRHALKKLKLAAATARSLESIVTDLARQSSSLSSSSSAKSLSFHPTDILEVRAYAATMQGRYLIELRQWQPALDAYLAAKAAYLAVMQVCADADPTHAALCQAAIDSLDPHVRFAMYSLTKLGVHVNADTPDLDSQQDALAHLIELSSRRAAGGSGGSGAGDEDDVLQSQLDALLSAAGPATSTAASGPSLTFLGTKYGLRASTPLGQLVAQLHDLAHTAAKLPAGSKQQLAAYQSLVSMALQAEKLAEKDVASNQAAALKVATSTTGAQATRVQAIAAACAYARRVYSVQRNMILIKEKLAGSNATAAAHVGDSLTPSVGTASVKGMAGSTGKKSRVAKGAKNAKSSAPTTKASATASAATDEKKRFADAIRLLDLTLANLAELADMPVLASHPLATQLVARARAQFDAHRMLVIAHVYTANKQWALARAAALRGVEYLGQAESLAEHLHANDQQEEAWMRPEMPCPLNMHAIRAELIARAGALTTAEQVLAKHVARDHGLVPMNVAPFATSYATAPGVVPVARCVPIPVPAKPVFFDLAFAEIEFPELHDSPVEEAKEAHREVKAETPQQPAAAGAKAVVGGKKERMQKKAERQLREQQAREMQEEEEKQQQASSGLSGWLGGLWGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.09
4	0.09
5	0.1
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.14
10	0.16
11	0.22
12	0.28
13	0.29
14	0.33
15	0.39
16	0.47
17	0.49
18	0.51
19	0.53
20	0.5
21	0.53
22	0.59
23	0.58
24	0.55
25	0.62
26	0.67
27	0.69
28	0.77
29	0.77
30	0.76
31	0.8
32	0.78
33	0.75
34	0.7
35	0.64
36	0.62
37	0.64
38	0.57
39	0.52
40	0.48
41	0.46
42	0.45
43	0.45
44	0.4
45	0.38
46	0.36
47	0.35
48	0.36
49	0.34
50	0.33
51	0.32
52	0.36
53	0.31
54	0.38
55	0.37
56	0.36
57	0.39
58	0.43
59	0.48
60	0.52
61	0.61
62	0.64
63	0.73
64	0.81
65	0.87
66	0.9
67	0.92
68	0.92
69	0.9
70	0.91
71	0.91
72	0.92
73	0.91
74	0.83
75	0.77
76	0.7
77	0.66
78	0.55
79	0.46
80	0.39
81	0.36
82	0.33
83	0.3
84	0.3
85	0.26
86	0.28
87	0.28
88	0.24
89	0.21
90	0.23
91	0.24
92	0.25
93	0.24
94	0.23
95	0.29
96	0.28
97	0.27
98	0.26
99	0.21
100	0.23
101	0.26
102	0.24
103	0.21
104	0.22
105	0.21
106	0.2
107	0.19
108	0.15
109	0.13
110	0.13
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.13
115	0.24
116	0.32
117	0.36
118	0.41
119	0.48
120	0.53
121	0.63
122	0.7
123	0.69
124	0.72
125	0.75
126	0.8
127	0.81
128	0.78
129	0.69
130	0.63
131	0.59
132	0.52
133	0.45
134	0.35
135	0.28
136	0.23
137	0.22
138	0.19
139	0.13
140	0.1
141	0.09
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.12
151	0.12
152	0.13
153	0.14
154	0.16
155	0.17
156	0.17
157	0.16
158	0.15
159	0.15
160	0.17
161	0.23
162	0.21
163	0.21
164	0.21
165	0.2
166	0.23
167	0.22
168	0.21
169	0.14
170	0.12
171	0.13
172	0.12
173	0.11
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.12
180	0.12
181	0.13
182	0.15
183	0.13
184	0.14
185	0.21
186	0.22
187	0.26
188	0.26
189	0.25
190	0.25
191	0.25
192	0.24
193	0.17
194	0.16
195	0.1
196	0.12
197	0.12
198	0.1
199	0.09
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.07
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.17
236	0.14
237	0.14
238	0.15
239	0.16
240	0.16
241	0.17
242	0.17
243	0.11
244	0.12
245	0.12
246	0.13
247	0.12
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.05
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.04
297	0.04
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.04
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.16
324	0.16
325	0.15
326	0.14
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.12
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.1
345	0.14
346	0.15
347	0.14
348	0.15
349	0.16
350	0.18
351	0.19
352	0.15
353	0.12
354	0.11
355	0.11
356	0.1
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.07
371	0.08
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.1
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.04
385	0.05
386	0.06
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.07
399	0.06
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.08
407	0.12
408	0.21
409	0.27
410	0.29
411	0.29
412	0.3
413	0.29
414	0.3
415	0.3
416	0.22
417	0.17
418	0.17
419	0.16
420	0.15
421	0.16
422	0.14
423	0.1
424	0.13
425	0.12
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.09
451	0.12
452	0.16
453	0.17
454	0.22
455	0.24
456	0.28
457	0.36
458	0.4
459	0.41
460	0.47
461	0.56
462	0.56
463	0.58
464	0.55
465	0.48
466	0.46
467	0.44
468	0.4
469	0.34
470	0.3
471	0.29
472	0.28
473	0.28
474	0.25
475	0.24
476	0.19
477	0.16
478	0.15
479	0.14
480	0.14
481	0.13
482	0.18
483	0.18
484	0.19
485	0.18
486	0.18
487	0.18
488	0.19
489	0.26
490	0.25
491	0.28
492	0.28
493	0.27
494	0.27
495	0.26
496	0.24
497	0.16
498	0.12
499	0.08
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.03
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.11
520	0.13
521	0.15
522	0.16
523	0.17
524	0.18
525	0.2
526	0.21
527	0.19
528	0.2
529	0.23
530	0.23
531	0.2
532	0.19
533	0.18
534	0.18
535	0.16
536	0.12
537	0.07
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.13
545	0.15
546	0.18
547	0.21
548	0.2
549	0.2
550	0.19
551	0.2
552	0.2
553	0.18
554	0.13
555	0.11
556	0.1
557	0.09
558	0.07
559	0.08
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.09
571	0.11
572	0.12
573	0.13
574	0.13
575	0.12
576	0.15
577	0.16
578	0.14
579	0.14
580	0.13
581	0.13
582	0.14
583	0.17
584	0.2
585	0.2
586	0.22
587	0.23
588	0.26
589	0.34
590	0.32
591	0.32
592	0.28
593	0.28
594	0.26
595	0.22
596	0.2
597	0.12
598	0.12
599	0.09
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.06
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.1
612	0.14
613	0.13
614	0.15
615	0.16
616	0.19
617	0.2
618	0.22
619	0.2
620	0.22
621	0.24
622	0.22
623	0.22
624	0.23
625	0.22
626	0.2
627	0.19
628	0.13
629	0.11
630	0.13
631	0.12
632	0.09
633	0.09
634	0.11
635	0.12
636	0.12
637	0.11
638	0.1
639	0.11
640	0.11
641	0.11
642	0.11
643	0.13
644	0.14
645	0.13
646	0.15
647	0.15
648	0.22
649	0.26
650	0.26
651	0.31
652	0.34
653	0.35
654	0.34
655	0.36
656	0.3
657	0.26
658	0.25
659	0.19
660	0.17
661	0.16
662	0.15
663	0.13
664	0.11
665	0.12
666	0.1
667	0.1
668	0.13
669	0.13
670	0.13
671	0.13
672	0.14
673	0.15
674	0.2
675	0.2
676	0.16
677	0.17
678	0.2
679	0.26
680	0.27
681	0.28
682	0.25
683	0.26
684	0.28
685	0.35
686	0.39
687	0.4
688	0.43
689	0.46
690	0.45
691	0.45
692	0.42
693	0.35
694	0.3
695	0.24
696	0.19
697	0.13
698	0.12
699	0.13
700	0.14
701	0.14
702	0.15
703	0.17
704	0.23
705	0.29
706	0.38
707	0.44
708	0.49
709	0.55
710	0.63
711	0.7
712	0.76
713	0.78
714	0.76
715	0.76
716	0.8
717	0.83
718	0.82
719	0.74
720	0.72
721	0.71
722	0.68
723	0.63
724	0.54
725	0.45
726	0.43
727	0.44
728	0.39
729	0.39
730	0.36
731	0.34
732	0.32
733	0.32
734	0.25
735	0.23
736	0.21
737	0.14
738	0.14
739	0.13
740	0.13
741	0.11
742	0.1
743	0.08

A0A1Y2HTD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer