Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HER0

Protein Details
Accession A0A1Y2HER0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-255RLRWLETRRVWSRRRQRHQRRRRIADGASPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-248PRHRLRWLETRRVWSRRRQRHQRRRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, pero 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003607  HD/PDEase_dom  
IPR023088  PDEase  
IPR002073  PDEase_catalytic_dom  
IPR036971  PDEase_catalytic_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004114  F:3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0007165  P:signal transduction  
Pfam View protein in Pfam  
PF00233  PDEase_I  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51845  PDEASE_I_2  
CDD cd00077  HDc  
Amino Acid Sequences MSDLERAALYFAAIIHDHQHPGVSNVFLIAKGDPKAILYNDRSVLEQHHLASAFAVLAQPECNFLADWEPAQRRSFRDLVIDLVLATDLKMQAELLGQWKTRIDCFDVRLPTDRAMLLKMIIKASDVANPTKDLSIYREWIERIMAEFFRQGDEERRLGLPISPYCDSTQPNLPGSQVGFMTWVVSPLYESLHLVLPIHVQVGQLRANFEYWKTAQAQTQHRPRHRLRWLETRRVWSRRRQRHQRRRRIADGASPTMRASAETGSPKDCCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.15
4 0.16
5 0.16
6 0.17
7 0.15
8 0.17
9 0.19
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.13
15 0.14
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.13
21 0.14
22 0.18
23 0.19
24 0.25
25 0.24
26 0.28
27 0.3
28 0.31
29 0.3
30 0.28
31 0.28
32 0.26
33 0.25
34 0.2
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.11
41 0.09
42 0.09
43 0.06
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.18
56 0.2
57 0.22
58 0.25
59 0.28
60 0.28
61 0.33
62 0.34
63 0.28
64 0.3
65 0.28
66 0.27
67 0.25
68 0.22
69 0.16
70 0.13
71 0.12
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.18
91 0.18
92 0.21
93 0.26
94 0.26
95 0.27
96 0.3
97 0.3
98 0.26
99 0.25
100 0.21
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.13
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.14
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.23
161 0.21
162 0.2
163 0.19
164 0.12
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.11
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.19
198 0.17
199 0.19
200 0.21
201 0.22
202 0.24
203 0.31
204 0.4
205 0.43
206 0.52
207 0.59
208 0.62
209 0.69
210 0.71
211 0.74
212 0.74
213 0.75
214 0.72
215 0.74
216 0.76
217 0.78
218 0.78
219 0.77
220 0.77
221 0.76
222 0.75
223 0.74
224 0.77
225 0.77
226 0.83
227 0.84
228 0.87
229 0.9
230 0.95
231 0.96
232 0.96
233 0.95
234 0.92
235 0.89
236 0.82
237 0.8
238 0.76
239 0.73
240 0.63
241 0.55
242 0.47
243 0.4
244 0.35
245 0.26
246 0.2
247 0.15
248 0.19
249 0.24
250 0.26
251 0.28