FuNGI

A0A1Y2HN39

Protein Details

Accession

A0A1Y2HN39

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-90	LSKSRAFQKTPRYLRRRAASHNPRKVPRRLRERAMRELENDPVTPKKRKPKALRRKPRSDYLSRQVRN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
31-80	KTPRYLRRRAASHNPRKVPRRLRERAMRELENDPVTPKKRKPKALRRKPR

Subcellular Location(s)

mito 17.5, cyto_mito 11, nucl 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N IPR012590 POPLD_dom
Gene Ontology	GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1 PF08170 POPLD

Amino Acid Sequences

RFAQSRAFELVALQATLKRTLDLSKSRAFQKTPRYLRRRAASHNPRKVPRRLRERAMRELENDPVTPKKRKPKALRRKPRSDYLSRQVRNGTWLETHLWMAKRFHMRAMWGFKVALRPTQKGARSMYRAAKYASVVHDASYQSVYEFSGPQEHVAQLVQAVIDPAGPRVGAARYMAGKRSVSVEVFDVACAATDTFGGSSTRAQLLGPATALWQPLANTASSSSAMDTDNHQPTRTLWLWTHPLIDERLLASLAHIMDTRGITTVNVTQLTDLCKLTLVGPKSFGLVHSTLKLAPTTSADQQAQWRSLAGLTDPSTLPKGGVLAVDIWDPRLSYPPARPTYTRTSDQQQGAHATLLHMASATATAPESTLWNATSRLHARQGKVRDHELHARKHAQLVPGTRLQPNPDRDSTIPLLLIASATGDGALDLVLPRGWSLPVWRTLVWAGARPAGLACMRSLAHEAGRAYFPWDYPTTSGYIGVVSHEADEQKQKWMSRPSGKRVNYEKLMVDAPFMPQW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.18
3	0.21
4	0.21
5	0.17
6	0.17
7	0.22
8	0.29
9	0.34
10	0.38
11	0.41
12	0.46
13	0.52
14	0.57
15	0.56
16	0.56
17	0.59
18	0.64
19	0.68
20	0.73
21	0.75
22	0.77
23	0.82
24	0.84
25	0.81
26	0.79
27	0.79
28	0.8
29	0.83
30	0.85
31	0.85
32	0.84
33	0.85
34	0.87
35	0.86
36	0.85
37	0.85
38	0.83
39	0.84
40	0.86
41	0.85
42	0.85
43	0.82
44	0.75
45	0.68
46	0.63
47	0.58
48	0.5
49	0.43
50	0.36
51	0.36
52	0.38
53	0.42
54	0.47
55	0.53
56	0.59
57	0.69
58	0.78
59	0.81
60	0.86
61	0.9
62	0.93
63	0.93
64	0.95
65	0.91
66	0.9
67	0.87
68	0.85
69	0.83
70	0.81
71	0.82
72	0.72
73	0.69
74	0.63
75	0.55
76	0.51
77	0.43
78	0.36
79	0.26
80	0.27
81	0.26
82	0.23
83	0.24
84	0.24
85	0.25
86	0.26
87	0.26
88	0.31
89	0.37
90	0.36
91	0.38
92	0.36
93	0.37
94	0.41
95	0.46
96	0.42
97	0.35
98	0.35
99	0.32
100	0.37
101	0.34
102	0.33
103	0.31
104	0.31
105	0.34
106	0.41
107	0.42
108	0.4
109	0.44
110	0.45
111	0.45
112	0.5
113	0.53
114	0.49
115	0.48
116	0.44
117	0.42
118	0.35
119	0.34
120	0.3
121	0.26
122	0.23
123	0.22
124	0.24
125	0.22
126	0.22
127	0.18
128	0.16
129	0.11
130	0.12
131	0.11
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.13
136	0.13
137	0.14
138	0.15
139	0.15
140	0.14
141	0.14
142	0.13
143	0.08
144	0.08
145	0.07
146	0.05
147	0.05
148	0.04
149	0.05
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.1
160	0.13
161	0.15
162	0.17
163	0.18
164	0.17
165	0.17
166	0.19
167	0.19
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.13
174	0.1
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.1
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.07
211	0.08
212	0.09
213	0.09
214	0.11
215	0.17
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.21
220	0.21
221	0.28
222	0.26
223	0.22
224	0.17
225	0.2
226	0.24
227	0.24
228	0.24
229	0.17
230	0.17
231	0.16
232	0.16
233	0.12
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.12
258	0.13
259	0.11
260	0.1
261	0.09
262	0.1
263	0.12
264	0.15
265	0.14
266	0.13
267	0.15
268	0.15
269	0.15
270	0.15
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.13
275	0.12
276	0.13
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.12
284	0.13
285	0.17
286	0.16
287	0.17
288	0.22
289	0.24
290	0.23
291	0.2
292	0.18
293	0.15
294	0.15
295	0.14
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.09
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.08
313	0.07
314	0.08
315	0.07
316	0.08
317	0.07
318	0.11
319	0.12
320	0.15
321	0.2
322	0.28
323	0.32
324	0.35
325	0.36
326	0.38
327	0.45
328	0.48
329	0.46
330	0.4
331	0.42
332	0.46
333	0.48
334	0.44
335	0.37
336	0.34
337	0.32
338	0.29
339	0.23
340	0.16
341	0.15
342	0.14
343	0.11
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.1
359	0.11
360	0.12
361	0.18
362	0.2
363	0.23
364	0.3
365	0.34
366	0.36
367	0.43
368	0.49
369	0.51
370	0.52
371	0.55
372	0.51
373	0.52
374	0.59
375	0.58
376	0.57
377	0.55
378	0.55
379	0.5
380	0.52
381	0.5
382	0.44
383	0.43
384	0.41
385	0.39
386	0.4
387	0.41
388	0.38
389	0.37
390	0.37
391	0.4
392	0.42
393	0.44
394	0.4
395	0.43
396	0.41
397	0.45
398	0.43
399	0.36
400	0.3
401	0.23
402	0.21
403	0.16
404	0.15
405	0.08
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.03
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.12
424	0.17
425	0.22
426	0.25
427	0.25
428	0.26
429	0.27
430	0.31
431	0.28
432	0.27
433	0.24
434	0.23
435	0.23
436	0.21
437	0.21
438	0.19
439	0.18
440	0.15
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.15
445	0.18
446	0.17
447	0.17
448	0.21
449	0.21
450	0.21
451	0.23
452	0.21
453	0.22
454	0.21
455	0.2
456	0.21
457	0.22
458	0.22
459	0.22
460	0.23
461	0.22
462	0.21
463	0.21
464	0.16
465	0.15
466	0.13
467	0.13
468	0.12
469	0.1
470	0.1
471	0.12
472	0.13
473	0.15
474	0.22
475	0.22
476	0.29
477	0.33
478	0.35
479	0.41
480	0.49
481	0.56
482	0.59
483	0.67
484	0.7
485	0.75
486	0.77
487	0.79
488	0.78
489	0.78
490	0.72
491	0.67
492	0.59
493	0.52
494	0.51
495	0.41
496	0.36
497	0.27

A0A1Y2HN39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer