Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HXU5

Protein Details
Accession A0A1Y2HXU5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-359GDHDDAPKKKRSKKDYVDSVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-352KKKRSK
Subcellular Location(s) extr 14, cyto 9, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028884  Trm82  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0036265  P:RNA (guanine-N7)-methylation  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSRPISLLVTSPTAVHLVAVSGPTFAVYDAQARTVLASADVFAAHAHKLPIRSACFSPNGQYLVTTGEDKLVKVWSTSNWGELVNERVVDKRLVEVCVTADCETLVCADKHGDVWTFPFLPSTPPSTVPSADGTIIVGHVSMVTAAKLLANDTCIASADRDEKIRISQFPKGYNIEAFLLGHKQFVAHVLPVGESHLVSAGGDDFVPLWNWKEGKMVAKADLVEKSAGDAEEESSIAVRSVAVFGESKAALVVEGTKEVVLLDIDTSADSISVAQRVSVPEDIGSALSVAYDTEGNLWVGGMTGLACLVADAVEVVDLASYGEQVPSLRKNLDVYADEGGDHDDAPKKKRSKKDYVDSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.1
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.15
36 0.19
37 0.25
38 0.28
39 0.31
40 0.31
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.36
45 0.34
46 0.31
47 0.27
48 0.25
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.17
53 0.13
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.17
62 0.14
63 0.21
64 0.21
65 0.21
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.21
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.19
82 0.17
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.14
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.1
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.14
108 0.16
109 0.19
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.21
116 0.21
117 0.18
118 0.16
119 0.14
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.19
153 0.2
154 0.25
155 0.27
156 0.29
157 0.32
158 0.31
159 0.29
160 0.25
161 0.23
162 0.18
163 0.15
164 0.13
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.14
201 0.17
202 0.21
203 0.21
204 0.2
205 0.21
206 0.22
207 0.21
208 0.2
209 0.17
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.06
239 0.08
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.11
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.1
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.12
313 0.16
314 0.2
315 0.2
316 0.22
317 0.24
318 0.26
319 0.31
320 0.28
321 0.27
322 0.26
323 0.25
324 0.23
325 0.21
326 0.21
327 0.15
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.23
332 0.28
333 0.37
334 0.44
335 0.52
336 0.63
337 0.69
338 0.73
339 0.79