FuNGI

A0A1Y2HH89

Protein Details

Accession

A0A1Y2HH89

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-88	EEDEEDRGGRKRRKRKKASGPNMFLDM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-79	RGGRKRRKRKKA
351-359	AKRKRGGKA

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR041976 KOW_Spt5_3 IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF00467 KOW PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1 cd06083 KOW_Spt5_3 cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MSANNDDYDNGDDARFDDEGAIGSGSGNGAYDDDDEDDIGRYQTEDLEGEGEDDDDDDEEDEEDEEDRGGRKRRKRKKASGPNMFLDMEAEVEDADEDEEDYAEEEEGFIDREEEEVPDTEVYMRDRRAHRELEQELQRTSNHDLHDLAAQYDVKYQARERRNRRFMGGSASSAPQSALLPSSVSDPKMWMIRCREGKERDIVHLLMRKSLDAARRAASGTGDKPMMLHSALYRDDLKGFFYVEADGVPGVYMSKMTLVPVKEMPDVLYVKPEDKSEDLLAKEWVRIKRGKYAGDLAKVVETNFDGTEATVQLLPRLNLDDFDDRRKMARGSGVADDEGGDGAAGSGGTAAKRKRGGKAVGGASAAATRPPQRLFNPREFPSHISRKITRGANGTLKLGGETFRDGYLEKAVRVTALDLNGAPPTLEEIEKFAGGSHGVIDAKTLKSLKHAAETREAEGTVFTAGDRVVVTQGELANVPAIIKSIENKIALIVPVERNMFGQTSVPITQLRKHFVPGNAVRVISGKYQGKLGTVVAVDNSAVTIVDVVEHVELQVFARDLADAKDQAVSAKNDITAGATGMATLPGESSRMGPPKLPPVPRGGPAGGPQRKRGDPLLNATVRVLSGQYKGYVGTVTVSNRDGTAKVRLQANTRVIAIPKKDLAMKDAAGHFVPVEGGFGIASNPSSSSMSGGYGMTPRAWNDGSATPGRPGGDRDKFDRPSRTPNPFAAAQTPNPYASGAMTPYHAGSGGSDFDGGKTPAWDAGSKTPYRAADDSSWGSSSSRHDPWSASSTAPSSNRDTYGGAGGYTPKDAWEGRQDPSRSSASAWNPSSSGPDAWSSSSTSGPAPGTGYTPGQAYTNSSSSTAYPTDPRRSGAAAYTGSTAGFTGPSGGATPSTWGTTPAYSSSTSSMARSAFGGAAPGGYGSTPQLAQGSTPMYNRFSAPTPRHESSTAGGMGAGGFTPMHMGGSTSVYSQSTSVAPARPAPAAPAASAPIVPTQDSLQGAKWPRTNVLVRIVRATDALAAGTTAKVLKADWDTDTVDLDVPSGGDQVPVAIIEVVPPAKGDRAVALQGEHAGKVGMVIGVHDSAAVVRTGVTFETFPIGLLGKLQE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.16
3	0.12
4	0.11
5	0.1
6	0.11
7	0.12
8	0.11
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.08
13	0.07
14	0.06
15	0.06
16	0.06
17	0.07
18	0.08
19	0.09
20	0.1
21	0.11
22	0.11
23	0.11
24	0.12
25	0.13
26	0.12
27	0.11
28	0.1
29	0.1
30	0.11
31	0.12
32	0.11
33	0.11
34	0.12
35	0.12
36	0.12
37	0.12
38	0.11
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.08
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.12
55	0.18
56	0.27
57	0.35
58	0.45
59	0.56
60	0.67
61	0.77
62	0.85
63	0.89
64	0.92
65	0.94
66	0.95
67	0.96
68	0.92
69	0.84
70	0.78
71	0.67
72	0.55
73	0.45
74	0.33
75	0.23
76	0.16
77	0.12
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.06
87	0.06
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.07
95	0.08
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.08
100	0.09
101	0.09
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.13
108	0.14
109	0.18
110	0.21
111	0.23
112	0.29
113	0.34
114	0.41
115	0.46
116	0.49
117	0.5
118	0.54
119	0.55
120	0.56
121	0.59
122	0.55
123	0.5
124	0.46
125	0.42
126	0.37
127	0.39
128	0.34
129	0.28
130	0.26
131	0.26
132	0.25
133	0.29
134	0.25
135	0.2
136	0.19
137	0.18
138	0.16
139	0.19
140	0.22
141	0.19
142	0.21
143	0.26
144	0.32
145	0.41
146	0.51
147	0.58
148	0.65
149	0.73
150	0.74
151	0.74
152	0.71
153	0.63
154	0.62
155	0.55
156	0.47
157	0.41
158	0.38
159	0.33
160	0.28
161	0.25
162	0.17
163	0.14
164	0.12
165	0.1
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.14
170	0.15
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.18
175	0.24
176	0.25
177	0.27
178	0.31
179	0.4
180	0.47
181	0.5
182	0.57
183	0.56
184	0.59
185	0.61
186	0.56
187	0.52
188	0.48
189	0.44
190	0.4
191	0.41
192	0.37
193	0.32
194	0.3
195	0.26
196	0.24
197	0.27
198	0.28
199	0.26
200	0.28
201	0.26
202	0.26
203	0.27
204	0.26
205	0.24
206	0.23
207	0.2
208	0.21
209	0.2
210	0.18
211	0.18
212	0.18
213	0.18
214	0.13
215	0.13
216	0.1
217	0.15
218	0.15
219	0.18
220	0.18
221	0.17
222	0.19
223	0.18
224	0.19
225	0.15
226	0.15
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.1
231	0.1
232	0.08
233	0.07
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.12
245	0.12
246	0.15
247	0.17
248	0.2
249	0.19
250	0.19
251	0.2
252	0.2
253	0.22
254	0.19
255	0.21
256	0.19
257	0.2
258	0.21
259	0.21
260	0.19
261	0.19
262	0.22
263	0.2
264	0.23
265	0.22
266	0.22
267	0.25
268	0.23
269	0.24
270	0.27
271	0.27
272	0.28
273	0.32
274	0.33
275	0.39
276	0.43
277	0.43
278	0.4
279	0.46
280	0.46
281	0.45
282	0.43
283	0.35
284	0.32
285	0.29
286	0.25
287	0.18
288	0.13
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.1
300	0.13
301	0.13
302	0.12
303	0.15
304	0.14
305	0.13
306	0.17
307	0.22
308	0.22
309	0.28
310	0.29
311	0.26
312	0.28
313	0.3
314	0.27
315	0.22
316	0.25
317	0.22
318	0.23
319	0.26
320	0.25
321	0.22
322	0.22
323	0.19
324	0.14
325	0.12
326	0.08
327	0.05
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.02
333	0.03
334	0.03
335	0.04
336	0.09
337	0.1
338	0.14
339	0.2
340	0.24
341	0.28
342	0.35
343	0.39
344	0.4
345	0.47
346	0.45
347	0.4
348	0.38
349	0.32
350	0.25
351	0.22
352	0.17
353	0.1
354	0.09
355	0.1
356	0.13
357	0.15
358	0.19
359	0.23
360	0.33
361	0.38
362	0.46
363	0.51
364	0.5
365	0.53
366	0.52
367	0.52
368	0.5
369	0.53
370	0.48
371	0.46
372	0.47
373	0.45
374	0.49
375	0.48
376	0.42
377	0.38
378	0.39
379	0.39
380	0.38
381	0.35
382	0.29
383	0.26
384	0.22
385	0.18
386	0.14
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.15
395	0.15
396	0.14
397	0.14
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.14
402	0.1
403	0.09
404	0.1
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.09
409	0.07
410	0.05
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.09
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.05
424	0.06
425	0.07
426	0.06
427	0.07
428	0.09
429	0.09
430	0.11
431	0.12
432	0.1
433	0.13
434	0.18
435	0.18
436	0.23
437	0.27
438	0.27
439	0.34
440	0.36
441	0.34
442	0.31
443	0.29
444	0.22
445	0.18
446	0.16
447	0.09
448	0.07
449	0.05
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.06
471	0.08
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.12
477	0.12
478	0.11
479	0.11
480	0.08
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.1
485	0.11
486	0.11
487	0.09
488	0.09
489	0.07
490	0.1
491	0.1
492	0.11
493	0.12
494	0.13
495	0.17
496	0.19
497	0.23
498	0.21
499	0.22
500	0.25
501	0.25
502	0.32
503	0.3
504	0.32
505	0.29
506	0.29
507	0.27
508	0.23
509	0.23
510	0.15
511	0.18
512	0.15
513	0.14
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.15
518	0.14
519	0.11
520	0.09
521	0.09
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.03
528	0.03
529	0.02
530	0.03
531	0.02
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.11
555	0.11
556	0.1
557	0.11
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.04
574	0.04
575	0.06
576	0.09
577	0.12
578	0.13
579	0.14
580	0.16
581	0.24
582	0.3
583	0.3
584	0.28
585	0.32
586	0.34
587	0.35
588	0.36
589	0.28
590	0.24
591	0.26
592	0.35
593	0.33
594	0.33
595	0.35
596	0.37
597	0.37
598	0.38
599	0.38
600	0.34
601	0.31
602	0.35
603	0.38
604	0.34
605	0.33
606	0.31
607	0.27
608	0.21
609	0.18
610	0.13
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.07
620	0.07
621	0.08
622	0.08
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.11
630	0.16
631	0.17
632	0.19
633	0.23
634	0.24
635	0.27
636	0.33
637	0.34
638	0.29
639	0.28
640	0.26
641	0.23
642	0.25
643	0.23
644	0.19
645	0.17
646	0.17
647	0.18
648	0.17
649	0.18
650	0.17
651	0.16
652	0.17
653	0.17
654	0.17
655	0.15
656	0.15
657	0.12
658	0.09
659	0.09
660	0.06
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.08
676	0.08
677	0.09
678	0.09
679	0.08
680	0.08
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.11
686	0.12
687	0.11
688	0.13
689	0.14
690	0.17
691	0.18
692	0.19
693	0.16
694	0.17
695	0.18
696	0.15
697	0.17
698	0.22
699	0.27
700	0.28
701	0.32
702	0.39
703	0.43
704	0.48
705	0.52
706	0.47
707	0.51
708	0.56
709	0.59
710	0.54
711	0.51
712	0.5
713	0.45
714	0.43
715	0.38
716	0.34
717	0.28
718	0.29
719	0.29
720	0.25
721	0.23
722	0.22
723	0.16
724	0.14
725	0.13
726	0.1
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.07
734	0.06
735	0.07
736	0.07
737	0.07
738	0.08
739	0.07
740	0.08
741	0.1
742	0.11
743	0.09
744	0.09
745	0.09
746	0.11
747	0.12
748	0.12
749	0.13
750	0.19
751	0.25
752	0.24
753	0.25
754	0.27
755	0.27
756	0.31
757	0.29
758	0.26
759	0.22
760	0.26
761	0.28
762	0.25
763	0.24
764	0.2
765	0.2
766	0.18
767	0.2
768	0.22
769	0.22
770	0.22
771	0.23
772	0.24
773	0.27
774	0.3
775	0.27
776	0.21
777	0.2
778	0.2
779	0.23
780	0.25
781	0.24
782	0.24
783	0.25
784	0.25
785	0.26
786	0.25
787	0.21
788	0.22
789	0.19
790	0.14
791	0.12
792	0.13
793	0.12
794	0.13
795	0.11
796	0.09
797	0.11
798	0.11
799	0.13
800	0.21
801	0.23
802	0.25
803	0.33
804	0.34
805	0.33
806	0.37
807	0.36
808	0.27
809	0.27
810	0.31
811	0.29
812	0.36
813	0.36
814	0.33
815	0.31
816	0.31
817	0.32
818	0.27
819	0.22
820	0.15
821	0.16
822	0.16
823	0.17
824	0.18
825	0.16
826	0.15
827	0.15
828	0.15
829	0.13
830	0.14
831	0.13
832	0.13
833	0.12
834	0.11
835	0.12
836	0.13
837	0.14
838	0.12
839	0.12
840	0.12
841	0.11
842	0.11
843	0.13
844	0.15
845	0.17
846	0.17
847	0.17
848	0.17
849	0.17
850	0.2
851	0.18
852	0.16
853	0.21
854	0.26
855	0.34
856	0.34
857	0.35
858	0.34
859	0.34
860	0.34
861	0.3
862	0.29
863	0.22
864	0.21
865	0.21
866	0.19
867	0.17
868	0.16
869	0.13
870	0.08
871	0.07
872	0.06
873	0.06
874	0.06
875	0.07
876	0.08
877	0.08
878	0.08
879	0.08
880	0.11
881	0.1
882	0.11
883	0.11
884	0.12
885	0.14
886	0.14
887	0.15
888	0.15
889	0.16
890	0.15
891	0.17
892	0.17
893	0.18
894	0.19
895	0.18
896	0.19
897	0.17
898	0.17
899	0.16
900	0.15
901	0.12
902	0.11
903	0.12
904	0.09
905	0.08
906	0.08
907	0.07
908	0.06
909	0.05
910	0.06
911	0.05
912	0.07
913	0.07
914	0.08
915	0.09
916	0.09
917	0.09
918	0.11
919	0.14
920	0.15
921	0.17
922	0.19
923	0.2
924	0.22
925	0.22
926	0.23
927	0.24
928	0.31
929	0.34
930	0.4
931	0.46
932	0.47
933	0.5
934	0.48
935	0.46
936	0.38
937	0.4
938	0.31
939	0.22
940	0.2
941	0.16
942	0.15
943	0.13
944	0.1
945	0.05
946	0.04
947	0.04
948	0.05
949	0.05
950	0.06
951	0.05
952	0.06
953	0.07
954	0.1
955	0.11
956	0.11
957	0.12
958	0.12
959	0.13
960	0.12
961	0.13
962	0.11
963	0.13
964	0.16
965	0.18
966	0.19
967	0.21
968	0.24
969	0.23
970	0.23
971	0.22
972	0.24
973	0.22
974	0.21
975	0.19
976	0.18
977	0.17
978	0.17
979	0.16
980	0.14
981	0.14
982	0.14
983	0.13
984	0.13
985	0.17
986	0.18
987	0.19
988	0.17
989	0.23
990	0.28
991	0.33
992	0.35
993	0.34
994	0.35
995	0.4
996	0.43
997	0.4
998	0.46
999	0.46
1000	0.43
1001	0.45
1002	0.44
1003	0.38
1004	0.34
1005	0.3
1006	0.21
1007	0.15
1008	0.14
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.08
1014	0.07
1015	0.07
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.12
1019	0.15
1020	0.18
1021	0.19
1022	0.22
1023	0.23
1024	0.23
1025	0.24
1026	0.2
1027	0.18
1028	0.16
1029	0.14
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.09
1047	0.1
1048	0.11
1049	0.13
1050	0.14
1051	0.14
1052	0.14
1053	0.17
1054	0.2
1055	0.2
1056	0.2
1057	0.19
1058	0.23
1059	0.23
1060	0.2
1061	0.16
1062	0.14
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.12
1066	0.08
1067	0.06
1068	0.07
1069	0.09
1070	0.09
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.08
1074	0.07
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.06
1078	0.06
1079	0.07
1080	0.08
1081	0.09
1082	0.11
1083	0.1
1084	0.11
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.13
1088	0.14
1089	0.14
1090	0.12

A0A1Y2HH89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer