FuNGI

A0A1Y2HZB8

Protein Details

Accession

A0A1Y2HZB8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
227-251	VGGGGRGQRKRKRKLRNTLLGTQTR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-242	KRVGGGGRGQRKRKRKLR

Subcellular Location(s)

cyto 11, mito 10, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022712 Beta_Casp IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF10996 Beta-Casp PF13299 CPSF100_C

Amino Acid Sequences

MARHAVVDAFKARDMNVDIESVFSTKLTLLRYSQPYILSGKAQGTVITAFAAGHTDTEDIDAHLSPTSLFMASTDSILPALLRPSLLIASTRLPSGISTKTRDAALFSSITATLHQGGNVLIPTDASSRVLELAHILEDHWHANGLAYPVVIVSHVAPKWYADQLTKNFASRRVHAFDFTYYPDPKVVLATDPEMDFGFARKVFVDNCNGSARNLVVVGERLVSKRVGGGGRGQRKRKRKLRNTLLGTQTRARSRQTCRAGCRGCNRGWSRSRHESSDQHTGHGNRPVCAAPHEVPVRARGRGQAARGIAAELDGGGGGDSSSDEDGRDGVGDDEENEMDPAKKPYVPTKIVEQVTTLDLHVRVKIVDARAIALVGGSAADTDIQREVGGGGAGDDDANAAGPELFAPETGTVVEPQSASYAAAQVKLTDALFTRIKMVKYGEHEIGVITAAVKNGEPHAPEVAAANESNGATEDAMDVDVNEPADQVAAAAAMPPTRSVPVLDVIDALHSQRHPSVVIGTVRLTDFKSVLDEQGFATEFVRGCWSSNGHITVEGQVCPEYYSVRKLLYQQHVTF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.25
3	0.22
4	0.21
5	0.19
6	0.2
7	0.21
8	0.17
9	0.14
10	0.11
11	0.1
12	0.1
13	0.14
14	0.15
15	0.17
16	0.2
17	0.28
18	0.34
19	0.37
20	0.38
21	0.36
22	0.36
23	0.36
24	0.34
25	0.28
26	0.26
27	0.24
28	0.23
29	0.22
30	0.2
31	0.19
32	0.17
33	0.15
34	0.12
35	0.11
36	0.08
37	0.08
38	0.1
39	0.08
40	0.07
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.11
48	0.11
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.09
56	0.08
57	0.08
58	0.11
59	0.11
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.11
74	0.11
75	0.11
76	0.14
77	0.15
78	0.15
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.16
83	0.21
84	0.23
85	0.27
86	0.3
87	0.32
88	0.33
89	0.32
90	0.31
91	0.25
92	0.23
93	0.19
94	0.16
95	0.16
96	0.15
97	0.15
98	0.13
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.1
104	0.1
105	0.11
106	0.11
107	0.1
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.09
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.1
116	0.11
117	0.11
118	0.1
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.1
126	0.1
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.09
131	0.11
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.08
138	0.07
139	0.06
140	0.05
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.12
145	0.13
146	0.15
147	0.17
148	0.18
149	0.16
150	0.23
151	0.25
152	0.32
153	0.32
154	0.33
155	0.33
156	0.37
157	0.38
158	0.35
159	0.39
160	0.37
161	0.37
162	0.35
163	0.35
164	0.31
165	0.29
166	0.29
167	0.27
168	0.23
169	0.23
170	0.22
171	0.2
172	0.18
173	0.17
174	0.14
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.11
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.12
191	0.14
192	0.19
193	0.18
194	0.2
195	0.23
196	0.23
197	0.22
198	0.22
199	0.19
200	0.14
201	0.13
202	0.1
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.09
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.18
217	0.25
218	0.35
219	0.42
220	0.5
221	0.54
222	0.63
223	0.73
224	0.75
225	0.78
226	0.79
227	0.84
228	0.86
229	0.88
230	0.85
231	0.82
232	0.8
233	0.72
234	0.64
235	0.57
236	0.5
237	0.43
238	0.38
239	0.34
240	0.34
241	0.36
242	0.43
243	0.49
244	0.5
245	0.52
246	0.59
247	0.59
248	0.57
249	0.58
250	0.54
251	0.46
252	0.49
253	0.48
254	0.46
255	0.5
256	0.51
257	0.52
258	0.56
259	0.57
260	0.52
261	0.54
262	0.51
263	0.49
264	0.53
265	0.46
266	0.37
267	0.38
268	0.36
269	0.34
270	0.35
271	0.31
272	0.21
273	0.22
274	0.22
275	0.19
276	0.19
277	0.19
278	0.14
279	0.19
280	0.2
281	0.19
282	0.19
283	0.25
284	0.25
285	0.22
286	0.22
287	0.18
288	0.23
289	0.25
290	0.25
291	0.24
292	0.22
293	0.22
294	0.21
295	0.19
296	0.13
297	0.1
298	0.09
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.02
304	0.02
305	0.02
306	0.02
307	0.02
308	0.03
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.08
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.13
332	0.2
333	0.27
334	0.29
335	0.29
336	0.33
337	0.39
338	0.39
339	0.38
340	0.32
341	0.25
342	0.23
343	0.22
344	0.17
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.1
352	0.13
353	0.12
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.13
358	0.13
359	0.11
360	0.08
361	0.07
362	0.04
363	0.04
364	0.02
365	0.02
366	0.02
367	0.03
368	0.03
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.09
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.11
409	0.11
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.14
420	0.15
421	0.19
422	0.22
423	0.22
424	0.24
425	0.25
426	0.25
427	0.3
428	0.35
429	0.3
430	0.27
431	0.27
432	0.24
433	0.22
434	0.17
435	0.12
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.1
443	0.12
444	0.13
445	0.13
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.15
450	0.14
451	0.13
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.08
468	0.08
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.07
473	0.06
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.07
482	0.07
483	0.09
484	0.1
485	0.11
486	0.11
487	0.13
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.17
492	0.15
493	0.17
494	0.16
495	0.15
496	0.13
497	0.12
498	0.14
499	0.15
500	0.17
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.21
505	0.23
506	0.22
507	0.22
508	0.22
509	0.22
510	0.23
511	0.21
512	0.17
513	0.16
514	0.15
515	0.19
516	0.18
517	0.21
518	0.2
519	0.2
520	0.18
521	0.21
522	0.22
523	0.17
524	0.16
525	0.16
526	0.15
527	0.15
528	0.2
529	0.17
530	0.18
531	0.22
532	0.24
533	0.24
534	0.3
535	0.32
536	0.28
537	0.29
538	0.28
539	0.31
540	0.3
541	0.27
542	0.22
543	0.2
544	0.19
545	0.19
546	0.19
547	0.16
548	0.16
549	0.21
550	0.23
551	0.25
552	0.27
553	0.32
554	0.42
555	0.48

A0A1Y2HZB8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer