Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HLN6

Protein Details
Accession A0A1Y2HLN6    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSSTSLRKVAPRRTHKERAQPAARRKLGLHydrophilic
43-66FHSKEDRVKRMREKARLRNPDEFYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-35KVAPRRTHKERAQPAARRKLGLLEKHKD
39-41RAR
43-58FHSKEDRVKRMREKAR
248-273GKGRRKKVGEDARGLAMYKWRAERKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSTSLRKVAPRRTHKERAQPAARRKLGLLEKHKDYVLRARDFHSKEDRVKRMREKARLRNPDEFYFAMEKATTKKGVHVVEGRQEKYSADFLKLLKTQDKGYIANQRSVNAKKLEKLKAQLHLVGAEHLADSAASSGAYSDDEDTPSIPKSTHTVFVDSETEADSFDPEEHFDTPAEFLARKFNRPTRSMLSTAALPDVKRQVDPMEVTRAERERAAKYTELAGRLERDEQLRAAELELDVQKALMGKGRRKKVGEDARGLAMYKWRAERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.86
4 0.85
5 0.85
6 0.84
7 0.85
8 0.85
9 0.86
10 0.81
11 0.72
12 0.63
13 0.61
14 0.59
15 0.59
16 0.58
17 0.55
18 0.56
19 0.57
20 0.57
21 0.49
22 0.45
23 0.44
24 0.44
25 0.42
26 0.39
27 0.41
28 0.49
29 0.5
30 0.53
31 0.53
32 0.51
33 0.54
34 0.62
35 0.68
36 0.65
37 0.71
38 0.74
39 0.75
40 0.78
41 0.79
42 0.79
43 0.81
44 0.85
45 0.87
46 0.83
47 0.82
48 0.78
49 0.71
50 0.65
51 0.54
52 0.47
53 0.4
54 0.34
55 0.26
56 0.21
57 0.18
58 0.18
59 0.21
60 0.2
61 0.17
62 0.21
63 0.27
64 0.27
65 0.31
66 0.32
67 0.32
68 0.36
69 0.42
70 0.4
71 0.34
72 0.33
73 0.29
74 0.27
75 0.29
76 0.22
77 0.18
78 0.2
79 0.19
80 0.24
81 0.26
82 0.26
83 0.24
84 0.24
85 0.24
86 0.26
87 0.28
88 0.24
89 0.26
90 0.33
91 0.31
92 0.36
93 0.35
94 0.32
95 0.35
96 0.35
97 0.36
98 0.32
99 0.32
100 0.3
101 0.37
102 0.41
103 0.39
104 0.44
105 0.42
106 0.43
107 0.43
108 0.4
109 0.33
110 0.29
111 0.25
112 0.19
113 0.15
114 0.1
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.12
140 0.17
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.2
145 0.21
146 0.18
147 0.16
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.18
168 0.2
169 0.23
170 0.28
171 0.34
172 0.39
173 0.41
174 0.46
175 0.42
176 0.46
177 0.44
178 0.4
179 0.35
180 0.31
181 0.29
182 0.26
183 0.21
184 0.16
185 0.17
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.2
192 0.23
193 0.23
194 0.25
195 0.25
196 0.26
197 0.3
198 0.3
199 0.28
200 0.29
201 0.29
202 0.26
203 0.29
204 0.31
205 0.27
206 0.27
207 0.32
208 0.32
209 0.3
210 0.28
211 0.26
212 0.25
213 0.25
214 0.26
215 0.23
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.2
221 0.19
222 0.17
223 0.15
224 0.13
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.2
235 0.28
236 0.37
237 0.46
238 0.53
239 0.55
240 0.6
241 0.65
242 0.69
243 0.69
244 0.67
245 0.61
246 0.58
247 0.56
248 0.51
249 0.42
250 0.38
251 0.33
252 0.31
253 0.36