Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GM93

Protein Details
Accession A0A1Y2GM93    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-274GISPPLRRVRRDRFRRRKTNPDAEFCDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-100RRGGGRRRGGRGAGAGTRGGRGGRGRGGRGGRGGAGGAATGARGGGITGRKKK
254-265RRVRRDRFRRRK
Subcellular Location(s) cysk 18, nucl 6, cyto 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSTLTVAASDAMHDDGEFSLGDNSDDDDDDDDDPDHDPMDISSDDDGRRGGGRRRGGRGAGAGTRGGRGGRGRGGRGGRGGAGGAATGARGGGITGRKKKVVNASQAAPMDGAAGYDYQLMSDVKERDDADDEDGPIEEQLLLRLPADNPDLVAKFRKRVEMREEVSDIKLMFTDERTGTFTFDSTTLRTKLVDLPTILETHKSYDNKQFYKMGEIAQMLLVENLPPPASASEPTVFDPILYTQWPDGISPPLRRVRRDRFRRRKTNPDAEFCDDMVERLLFADLNSEETLVEVCNVDDQGEPVWTGNQGTPEAALAAMGHAVETQMSKKAAAALAAAGVVPGGGADKGPRTAKPSVRMVEGEVERVAVDGVRVVTDTKWLVKSPLAANPGASSGLMSPPLLGGMVPPPLVPGGGGGSSSSSASLASAGIPPPIIPPPLVPGGVIPPPALPGSVPYLPPSTLSLDPLDLDQLSVNTDDLGSADDADVDDLISGLADDDEATGMGEFGDEDEDDDEDEEEDDDDDDDEAATNLGNDRQTAVGGAAAESELGSMMSADDAASRLTGTALGEESSMLGAGVSQVGTAAGEDEEQEEEETDEDEDSDEEDDEDEEEEEEEDEQVAMLQQEVHTLRQRVKETQAKLAGTANAVLKKRLEDTLRKHQTELEFKESQMRELVGGSTTAIGAALAAKSADSSVHSTPAPSAQTSPAALVFDIPGAPPPPSAGAGGRRPSVAGKGLMPSTAPVTSGTPFASALGELESAAGEMSASEMGQSYEYDDDDDDDDMSTQGAESQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.08
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.1
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.15
35 0.19
36 0.23
37 0.29
38 0.33
39 0.43
40 0.49
41 0.56
42 0.6
43 0.59
44 0.57
45 0.54
46 0.51
47 0.45
48 0.39
49 0.35
50 0.29
51 0.28
52 0.26
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.22
57 0.27
58 0.31
59 0.33
60 0.39
61 0.42
62 0.42
63 0.42
64 0.39
65 0.33
66 0.28
67 0.26
68 0.19
69 0.15
70 0.11
71 0.08
72 0.06
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.08
80 0.14
81 0.23
82 0.32
83 0.36
84 0.41
85 0.42
86 0.48
87 0.55
88 0.57
89 0.58
90 0.55
91 0.54
92 0.57
93 0.56
94 0.51
95 0.4
96 0.31
97 0.22
98 0.16
99 0.13
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.2
113 0.21
114 0.22
115 0.26
116 0.26
117 0.25
118 0.26
119 0.25
120 0.22
121 0.21
122 0.19
123 0.14
124 0.14
125 0.09
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.13
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.26
141 0.25
142 0.29
143 0.32
144 0.4
145 0.39
146 0.45
147 0.51
148 0.53
149 0.54
150 0.53
151 0.54
152 0.46
153 0.44
154 0.4
155 0.32
156 0.22
157 0.19
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.15
162 0.13
163 0.15
164 0.18
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.18
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.25
179 0.26
180 0.27
181 0.23
182 0.24
183 0.24
184 0.25
185 0.24
186 0.19
187 0.17
188 0.16
189 0.23
190 0.22
191 0.25
192 0.33
193 0.41
194 0.41
195 0.44
196 0.46
197 0.4
198 0.44
199 0.41
200 0.33
201 0.28
202 0.26
203 0.23
204 0.19
205 0.19
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.12
219 0.13
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.15
236 0.19
237 0.21
238 0.27
239 0.34
240 0.37
241 0.41
242 0.49
243 0.54
244 0.61
245 0.7
246 0.75
247 0.78
248 0.86
249 0.92
250 0.91
251 0.91
252 0.91
253 0.9
254 0.86
255 0.82
256 0.77
257 0.71
258 0.64
259 0.53
260 0.45
261 0.34
262 0.27
263 0.21
264 0.14
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.05
269 0.05
270 0.08
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.06
279 0.07
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.05
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.03
334 0.04
335 0.07
336 0.08
337 0.1
338 0.14
339 0.2
340 0.24
341 0.29
342 0.34
343 0.33
344 0.34
345 0.34
346 0.3
347 0.3
348 0.26
349 0.22
350 0.16
351 0.14
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.15
371 0.14
372 0.19
373 0.19
374 0.18
375 0.18
376 0.17
377 0.17
378 0.13
379 0.11
380 0.07
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.05
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.11
430 0.12
431 0.12
432 0.09
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.06
438 0.06
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.13
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.13
449 0.14
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.03
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.06
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.06
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.04
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.07
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.05
612 0.1
613 0.12
614 0.15
615 0.2
616 0.23
617 0.28
618 0.34
619 0.38
620 0.38
621 0.46
622 0.5
623 0.48
624 0.54
625 0.55
626 0.48
627 0.46
628 0.44
629 0.37
630 0.29
631 0.29
632 0.24
633 0.24
634 0.24
635 0.25
636 0.23
637 0.23
638 0.25
639 0.28
640 0.3
641 0.33
642 0.41
643 0.51
644 0.59
645 0.59
646 0.57
647 0.57
648 0.58
649 0.59
650 0.57
651 0.53
652 0.45
653 0.43
654 0.52
655 0.47
656 0.41
657 0.34
658 0.28
659 0.21
660 0.21
661 0.21
662 0.12
663 0.12
664 0.11
665 0.09
666 0.08
667 0.07
668 0.06
669 0.05
670 0.04
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.12
681 0.13
682 0.16
683 0.16
684 0.17
685 0.18
686 0.22
687 0.22
688 0.19
689 0.2
690 0.2
691 0.22
692 0.22
693 0.22
694 0.19
695 0.17
696 0.16
697 0.15
698 0.12
699 0.11
700 0.1
701 0.09
702 0.11
703 0.11
704 0.12
705 0.11
706 0.12
707 0.13
708 0.14
709 0.16
710 0.17
711 0.23
712 0.3
713 0.34
714 0.34
715 0.32
716 0.32
717 0.32
718 0.32
719 0.29
720 0.24
721 0.22
722 0.25
723 0.25
724 0.25
725 0.23
726 0.2
727 0.19
728 0.17
729 0.15
730 0.13
731 0.14
732 0.15
733 0.17
734 0.16
735 0.14
736 0.14
737 0.14
738 0.13
739 0.11
740 0.1
741 0.1
742 0.09
743 0.08
744 0.08
745 0.08
746 0.07
747 0.06
748 0.06
749 0.04
750 0.03
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.06
756 0.07
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.11
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.14
765 0.14
766 0.15
767 0.13
768 0.12
769 0.12
770 0.11
771 0.1
772 0.08
773 0.07