Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2H5L3

Protein Details
Accession A0A1Y2H5L3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-254PRPQWMPGFRCRRPRRRACRSSSQQQQPQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFSTGSAANTRQHHASSSPQNFDDAVRHHPVSYKDLKGRGLGFDDDDDDDEFDPVARQASDSHLPDVLRDFQRHALQTSNNPSANANANANANKLSAADRLMAQFGSMSVDEHQAASNSTPTRSIQHHQQQERQPSGFPAEFTGSGALRSGQLPEGAMSLEELEAQLLGTAPGAISGSQQRPLPDLDQSASSSSPLIGTPQAPPQPPMATTAPRPSSLQAWTLPRPQWMPGFRCRRPRRRACRSSSQQQQPQQEQMMMGMPMGMASMMGGIGGAAAGLPAHLLADMSPEDMAMAMVENSEQQLRAIRKARREARMRENARFNGIMSQREKDLTARIQIGQLVTADPMVDDYYFQVLTKTRAAAAKEAADAEAAAAAAGEDADNAGDSSLMSRTSADNNNNNNNNNGNMGVRQDRRRHQQGNNNTQGNRPLLLRKAIREGSLQDQIDRIVDHAKKKTRNTQISLDGALGKISLKTTKNPRQQLNLASPDNPASAPKAKTISPTSAAPATPLLHGRAARRLAHKVTEELFDLVLACEALHLSRPTPDSKRTVIVTEDGDERMLTMEEELGVWEQELMTALDKLWGRLQQFEAGDVHPVVQMLSMSKGKKLWPRLVNMLSTPHVTKVLLDMFGRAQQLDVVRQASIPALFAAPQLFPGLSSSRPSMDALLAFVGDVEDFMHYVLPSLVTFISDAPWPMVASSLEAVLDRNDMVRLGSSKVGLALLTMLVSRAEILSQSNQAPGWPELYLRVFNELQGHYLAFFPVSAMANLPDALSLDKLPSVLVPPVLPPPSQGGPTAADLLDFYLTDDAHVWQFLASLAVAATVEQQTMLVTEVRERILANVVAGQVVGGEGEVTAADKAERAVYNVNLFLHALGLDASQIQTAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.38
4 0.42
5 0.46
6 0.48
7 0.45
8 0.46
9 0.44
10 0.43
11 0.4
12 0.32
13 0.31
14 0.32
15 0.33
16 0.32
17 0.36
18 0.38
19 0.4
20 0.44
21 0.46
22 0.46
23 0.5
24 0.52
25 0.51
26 0.5
27 0.46
28 0.42
29 0.36
30 0.31
31 0.28
32 0.28
33 0.24
34 0.23
35 0.2
36 0.18
37 0.16
38 0.15
39 0.13
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.17
48 0.24
49 0.25
50 0.27
51 0.28
52 0.27
53 0.28
54 0.31
55 0.33
56 0.31
57 0.3
58 0.32
59 0.35
60 0.41
61 0.43
62 0.4
63 0.38
64 0.38
65 0.44
66 0.49
67 0.5
68 0.45
69 0.43
70 0.42
71 0.4
72 0.41
73 0.35
74 0.29
75 0.24
76 0.27
77 0.28
78 0.28
79 0.26
80 0.2
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.13
92 0.12
93 0.1
94 0.12
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.23
111 0.27
112 0.3
113 0.35
114 0.43
115 0.53
116 0.57
117 0.65
118 0.69
119 0.73
120 0.74
121 0.65
122 0.57
123 0.5
124 0.5
125 0.42
126 0.34
127 0.28
128 0.25
129 0.23
130 0.23
131 0.23
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.13
165 0.15
166 0.18
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.25
171 0.24
172 0.21
173 0.22
174 0.2
175 0.21
176 0.21
177 0.21
178 0.18
179 0.17
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.19
189 0.23
190 0.24
191 0.25
192 0.26
193 0.27
194 0.26
195 0.29
196 0.26
197 0.25
198 0.27
199 0.34
200 0.33
201 0.32
202 0.33
203 0.3
204 0.29
205 0.28
206 0.28
207 0.24
208 0.28
209 0.3
210 0.35
211 0.35
212 0.35
213 0.34
214 0.34
215 0.36
216 0.37
217 0.38
218 0.42
219 0.5
220 0.53
221 0.62
222 0.7
223 0.73
224 0.78
225 0.84
226 0.85
227 0.87
228 0.91
229 0.89
230 0.9
231 0.88
232 0.87
233 0.86
234 0.84
235 0.81
236 0.78
237 0.78
238 0.71
239 0.66
240 0.58
241 0.49
242 0.39
243 0.32
244 0.26
245 0.18
246 0.14
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.01
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.11
291 0.13
292 0.19
293 0.27
294 0.31
295 0.37
296 0.47
297 0.55
298 0.58
299 0.64
300 0.65
301 0.68
302 0.74
303 0.72
304 0.69
305 0.69
306 0.61
307 0.56
308 0.49
309 0.39
310 0.36
311 0.33
312 0.32
313 0.27
314 0.27
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.19
319 0.21
320 0.18
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.14
328 0.12
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.16
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.1
357 0.09
358 0.07
359 0.05
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.07
381 0.11
382 0.16
383 0.2
384 0.26
385 0.3
386 0.37
387 0.4
388 0.4
389 0.37
390 0.33
391 0.29
392 0.23
393 0.19
394 0.13
395 0.1
396 0.11
397 0.15
398 0.19
399 0.24
400 0.3
401 0.35
402 0.43
403 0.5
404 0.55
405 0.56
406 0.61
407 0.66
408 0.7
409 0.71
410 0.67
411 0.59
412 0.54
413 0.5
414 0.42
415 0.32
416 0.23
417 0.18
418 0.16
419 0.21
420 0.22
421 0.2
422 0.24
423 0.24
424 0.24
425 0.23
426 0.23
427 0.22
428 0.26
429 0.25
430 0.19
431 0.19
432 0.17
433 0.17
434 0.14
435 0.11
436 0.11
437 0.14
438 0.18
439 0.24
440 0.3
441 0.35
442 0.39
443 0.48
444 0.52
445 0.57
446 0.57
447 0.56
448 0.55
449 0.5
450 0.47
451 0.38
452 0.28
453 0.21
454 0.17
455 0.12
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.09
460 0.1
461 0.15
462 0.25
463 0.35
464 0.43
465 0.5
466 0.53
467 0.55
468 0.57
469 0.57
470 0.54
471 0.51
472 0.43
473 0.37
474 0.34
475 0.29
476 0.26
477 0.21
478 0.14
479 0.11
480 0.15
481 0.15
482 0.17
483 0.18
484 0.18
485 0.22
486 0.25
487 0.25
488 0.22
489 0.22
490 0.22
491 0.21
492 0.2
493 0.17
494 0.15
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.12
499 0.13
500 0.15
501 0.15
502 0.2
503 0.22
504 0.25
505 0.27
506 0.31
507 0.3
508 0.32
509 0.32
510 0.29
511 0.27
512 0.25
513 0.22
514 0.18
515 0.16
516 0.12
517 0.11
518 0.08
519 0.07
520 0.05
521 0.04
522 0.03
523 0.03
524 0.04
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.09
529 0.11
530 0.16
531 0.2
532 0.24
533 0.26
534 0.28
535 0.31
536 0.29
537 0.29
538 0.26
539 0.24
540 0.21
541 0.19
542 0.18
543 0.15
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.09
548 0.08
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.06
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.13
570 0.16
571 0.16
572 0.18
573 0.2
574 0.2
575 0.2
576 0.21
577 0.2
578 0.17
579 0.18
580 0.15
581 0.14
582 0.1
583 0.1
584 0.08
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.09
589 0.13
590 0.13
591 0.15
592 0.17
593 0.21
594 0.28
595 0.34
596 0.4
597 0.41
598 0.46
599 0.52
600 0.53
601 0.5
602 0.44
603 0.41
604 0.33
605 0.3
606 0.26
607 0.19
608 0.17
609 0.16
610 0.14
611 0.14
612 0.15
613 0.14
614 0.14
615 0.14
616 0.14
617 0.17
618 0.17
619 0.13
620 0.12
621 0.12
622 0.13
623 0.14
624 0.15
625 0.13
626 0.13
627 0.13
628 0.13
629 0.12
630 0.11
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.08
636 0.09
637 0.07
638 0.08
639 0.08
640 0.07
641 0.07
642 0.09
643 0.11
644 0.11
645 0.13
646 0.14
647 0.15
648 0.16
649 0.17
650 0.16
651 0.15
652 0.14
653 0.12
654 0.11
655 0.1
656 0.08
657 0.07
658 0.06
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.07
670 0.06
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.08
683 0.1
684 0.08
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.08
689 0.08
690 0.09
691 0.08
692 0.08
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.1
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.11
707 0.09
708 0.07
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.08
720 0.1
721 0.14
722 0.15
723 0.16
724 0.16
725 0.16
726 0.19
727 0.17
728 0.17
729 0.14
730 0.13
731 0.16
732 0.19
733 0.21
734 0.18
735 0.23
736 0.21
737 0.22
738 0.27
739 0.24
740 0.23
741 0.21
742 0.21
743 0.16
744 0.16
745 0.15
746 0.09
747 0.09
748 0.07
749 0.09
750 0.1
751 0.09
752 0.1
753 0.1
754 0.11
755 0.11
756 0.11
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.09
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.11
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.13
772 0.19
773 0.21
774 0.2
775 0.19
776 0.23
777 0.25
778 0.26
779 0.25
780 0.21
781 0.22
782 0.24
783 0.25
784 0.19
785 0.16
786 0.15
787 0.15
788 0.13
789 0.1
790 0.09
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.1
795 0.11
796 0.11
797 0.11
798 0.1
799 0.09
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.07
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.06
809 0.08
810 0.08
811 0.08
812 0.07
813 0.08
814 0.07
815 0.08
816 0.09
817 0.09
818 0.09
819 0.13
820 0.15
821 0.16
822 0.17
823 0.17
824 0.17
825 0.21
826 0.21
827 0.18
828 0.17
829 0.17
830 0.16
831 0.15
832 0.13
833 0.08
834 0.07
835 0.06
836 0.03
837 0.03
838 0.03
839 0.03
840 0.04
841 0.04
842 0.05
843 0.05
844 0.06
845 0.06
846 0.07
847 0.12
848 0.13
849 0.15
850 0.2
851 0.22
852 0.26
853 0.28
854 0.28
855 0.24
856 0.23
857 0.21
858 0.17
859 0.13
860 0.1
861 0.08
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.08