Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HHB4

Protein Details
Accession A0A1Y2HHB4    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-108DPSNDTTQENSKKRKRSQKEKSKERKKQKFAEELDRAHydrophilic
451-492DGGEDKPMSKRKAKREAKRLAKKAKREARRQQKNRPPLMCMFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-100KKRKRSQKEKSKERKKQK
239-257GGSFRGGRGRGGPRGRGRG
456-485KPMSKRKAKREAKRLAKKAKREARRQQKNR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MPKPTATAAKNIEDEDDFALDASQSGSDNDDGDFDFAASDAFMSDADDDDMMADASPSADLEEAEAEKDEDDPSNDTTQENSKKRKRSQKEKSKERKKQKFAEELDRATLKEHTPLAQAENLARQLLDFTLKDCQMTTLEVQDKLLAEPCFLDISNFEKVDDSAFPDLVRRAVPNIDEYMLDPETGKPKATSKANLRKQGPLILFLCTSGIRCMDVIRALRPLTGGDQEYVPGGTGGRGGSFRGGRGRGGPRGRGRGGFGGDSGRPNQQQQAMRLRVGKLFAKHMKVDEQVKYLEGYPVHLAVGTPNRVAKLLELGALKTGNLKCIVLDASFRDGKQRTLFTAAESRSEFFALYMAWLAGLCKGEELKAQKEAESEAQKRKQDAADAKREDVEMGEAGAEGGAATGSAEQQPSVAVRSFRIDDDSDTSSDSDMDTDNEAVTDDADAPKRVDGGEDKPMSKRKAKREAKRLAKKAKREARRQQKNRPPLMCMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.26
3 0.22
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.11
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.06
26 0.05
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.06
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.12
59 0.14
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.19
65 0.26
66 0.34
67 0.4
68 0.47
69 0.54
70 0.63
71 0.72
72 0.81
73 0.83
74 0.85
75 0.88
76 0.89
77 0.92
78 0.94
79 0.95
80 0.96
81 0.95
82 0.95
83 0.95
84 0.94
85 0.92
86 0.9
87 0.89
88 0.84
89 0.84
90 0.8
91 0.71
92 0.66
93 0.57
94 0.48
95 0.39
96 0.35
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.21
105 0.21
106 0.18
107 0.2
108 0.19
109 0.17
110 0.15
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.13
115 0.1
116 0.1
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.14
123 0.16
124 0.15
125 0.17
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.22
133 0.15
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.08
141 0.11
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.16
176 0.22
177 0.25
178 0.31
179 0.37
180 0.48
181 0.55
182 0.62
183 0.61
184 0.59
185 0.57
186 0.56
187 0.46
188 0.4
189 0.33
190 0.26
191 0.24
192 0.19
193 0.19
194 0.12
195 0.12
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.17
234 0.21
235 0.25
236 0.28
237 0.33
238 0.34
239 0.39
240 0.4
241 0.35
242 0.34
243 0.3
244 0.29
245 0.23
246 0.19
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.21
256 0.24
257 0.27
258 0.35
259 0.35
260 0.36
261 0.38
262 0.36
263 0.31
264 0.31
265 0.29
266 0.21
267 0.26
268 0.29
269 0.29
270 0.29
271 0.29
272 0.3
273 0.31
274 0.34
275 0.29
276 0.26
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.2
281 0.18
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.14
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.15
318 0.17
319 0.17
320 0.21
321 0.21
322 0.24
323 0.28
324 0.28
325 0.25
326 0.29
327 0.29
328 0.26
329 0.32
330 0.29
331 0.28
332 0.27
333 0.26
334 0.22
335 0.22
336 0.19
337 0.12
338 0.12
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.13
353 0.17
354 0.18
355 0.23
356 0.24
357 0.24
358 0.25
359 0.27
360 0.29
361 0.33
362 0.37
363 0.4
364 0.46
365 0.48
366 0.49
367 0.51
368 0.46
369 0.46
370 0.5
371 0.5
372 0.53
373 0.53
374 0.53
375 0.5
376 0.48
377 0.4
378 0.31
379 0.24
380 0.13
381 0.1
382 0.09
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.02
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.11
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.19
405 0.21
406 0.21
407 0.24
408 0.22
409 0.22
410 0.26
411 0.27
412 0.23
413 0.23
414 0.23
415 0.19
416 0.18
417 0.15
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.11
431 0.14
432 0.16
433 0.16
434 0.17
435 0.18
436 0.16
437 0.19
438 0.19
439 0.22
440 0.3
441 0.34
442 0.35
443 0.41
444 0.49
445 0.52
446 0.56
447 0.6
448 0.61
449 0.68
450 0.76
451 0.8
452 0.83
453 0.88
454 0.9
455 0.93
456 0.92
457 0.92
458 0.91
459 0.91
460 0.91
461 0.9
462 0.89
463 0.89
464 0.9
465 0.9
466 0.92
467 0.92
468 0.93
469 0.93
470 0.94
471 0.93
472 0.86