Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HJU6

Protein Details
Accession A0A1Y2HJU6    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-99ESEPYCPMCRRRLRKEDLHPNLALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 7, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018121  7-in-absentia-prot_TRAF-dom  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
IPR013010  Znf_SIAH  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF03145  Sina  
PF00400  WD40  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS51081  ZF_SIAH  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSNLPAVNGTSLSTTSGTAAASAAAYVPLERHEIAFVADISPSLQCPICYEVCTDPVITHVCHHSFCSACISRSLESEPYCPMCRRRLRKEDLHPNLALAGLISELAVYCPYKSQGCPSTVALDSLDHHARQCKYAPSACEMAKFGCGFHGTYQQVAAHTKADCPFARMAAYLEATERRIRVLEETMVAQQEEIGRLTVALARGGGLKPGEASGTTSPAGPLEGDGDEVMEEVESFPFGDIQCRRTIREHTCGVTSVTYHDGNIYSGAHDGSIKIFNAETGTHLRTLTDHRETVWSLSVDRARNRLYSASKDATIKVWDISRQRSNSTTMASPPTSPHQQPAAALPGPLATLTAHQGKIYGLALDAASNRLYSGSGDRTVRCWSLDTPTGVPECHLVLVGHDQGVNAVTLGGRAPVGDQGDLVGPATAVYTASNDKTVKVWDTATGQCVRTLPLAAEVLDVVEDPVSGLVFASTYDATISAFDPRVPASVTEPVAVLQGHNWEVWQLQVADGIVFSGSFDHSIKRWDPRTMSCTATLKGHRGFVHAMAIGHGCLISGCADRSIKIWS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.16
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.13
34 0.18
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.23
39 0.24
40 0.25
41 0.23
42 0.17
43 0.19
44 0.21
45 0.18
46 0.18
47 0.22
48 0.23
49 0.24
50 0.25
51 0.27
52 0.25
53 0.25
54 0.32
55 0.29
56 0.28
57 0.31
58 0.33
59 0.29
60 0.31
61 0.33
62 0.3
63 0.29
64 0.29
65 0.3
66 0.31
67 0.34
68 0.36
69 0.37
70 0.42
71 0.5
72 0.58
73 0.65
74 0.7
75 0.75
76 0.81
77 0.87
78 0.88
79 0.86
80 0.82
81 0.72
82 0.62
83 0.53
84 0.43
85 0.31
86 0.2
87 0.11
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.04
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.11
99 0.13
100 0.14
101 0.21
102 0.26
103 0.28
104 0.31
105 0.3
106 0.33
107 0.31
108 0.31
109 0.24
110 0.19
111 0.18
112 0.2
113 0.21
114 0.17
115 0.18
116 0.24
117 0.24
118 0.26
119 0.29
120 0.29
121 0.32
122 0.36
123 0.37
124 0.34
125 0.39
126 0.36
127 0.35
128 0.31
129 0.26
130 0.25
131 0.23
132 0.19
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.22
138 0.19
139 0.19
140 0.21
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.2
145 0.15
146 0.15
147 0.18
148 0.18
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.2
154 0.2
155 0.18
156 0.17
157 0.14
158 0.14
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.16
170 0.15
171 0.14
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.06
199 0.09
200 0.08
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.11
227 0.12
228 0.14
229 0.2
230 0.21
231 0.23
232 0.26
233 0.33
234 0.33
235 0.38
236 0.39
237 0.34
238 0.34
239 0.33
240 0.3
241 0.23
242 0.18
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.15
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.14
283 0.11
284 0.14
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.23
289 0.22
290 0.22
291 0.23
292 0.25
293 0.23
294 0.24
295 0.28
296 0.26
297 0.27
298 0.27
299 0.26
300 0.23
301 0.22
302 0.18
303 0.14
304 0.13
305 0.16
306 0.18
307 0.23
308 0.28
309 0.28
310 0.3
311 0.3
312 0.33
313 0.3
314 0.29
315 0.25
316 0.21
317 0.23
318 0.22
319 0.2
320 0.18
321 0.21
322 0.24
323 0.23
324 0.24
325 0.22
326 0.22
327 0.22
328 0.23
329 0.23
330 0.18
331 0.18
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.09
337 0.05
338 0.05
339 0.08
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.09
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.1
361 0.12
362 0.15
363 0.17
364 0.18
365 0.2
366 0.23
367 0.23
368 0.2
369 0.19
370 0.17
371 0.2
372 0.24
373 0.24
374 0.22
375 0.24
376 0.24
377 0.22
378 0.21
379 0.17
380 0.13
381 0.11
382 0.1
383 0.07
384 0.08
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.1
392 0.09
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.07
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.06
418 0.09
419 0.1
420 0.14
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.19
428 0.17
429 0.21
430 0.22
431 0.26
432 0.27
433 0.25
434 0.25
435 0.24
436 0.23
437 0.2
438 0.19
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.14
443 0.13
444 0.11
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.06
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.13
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.21
477 0.22
478 0.21
479 0.2
480 0.19
481 0.19
482 0.18
483 0.14
484 0.1
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.14
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.19
510 0.23
511 0.31
512 0.36
513 0.41
514 0.46
515 0.52
516 0.55
517 0.53
518 0.52
519 0.49
520 0.49
521 0.43
522 0.46
523 0.42
524 0.45
525 0.44
526 0.47
527 0.41
528 0.41
529 0.41
530 0.35
531 0.36
532 0.31
533 0.28
534 0.24
535 0.24
536 0.19
537 0.17
538 0.15
539 0.09
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.1
544 0.1
545 0.15
546 0.16
547 0.17