Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HAL9

Protein Details
Accession A0A1Y2HAL9    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
467-489NGRPGARARRHPHSTRPRLARGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
466-484PNGRPGARARRHPHSTRPR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005607  BSD_dom  
IPR035925  BSD_dom_sf  
IPR027079  Tfb1/GTF2H1  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03909  BSD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50858  BSD  
Amino Acid Sequences MDPMDVDAPTATATATAAVLLDAPAKYAKQPAALCLLRPLAASASSSLQVTITPSSTSTSTLDPVVIPFDDIANLQQVPGKPTLKFILISRPAFSPIVHLTHPSEALTHTQTITEAVTSFLALRISKAGGKPASSFASASASASGSAPASRSSSRSATPAPAGTSRAASPSSSATVTPASAASLVQQLTNLSLRDELELRAELLKKHRTLAKLHQDLVRSRHVTENEFWAARKPLLERAALEKAQKPGHKSTRPPDVGRQTGDNKVTFTVTPQLVHSIFLQYPSVHRLFMQKVPVEMSEKDFWQRYVQSSLFKQSPATVAELATSGEQIAGSRAGPSLGSGAESGKATEGDAMFDACFSEEVQRLREEMAADIVRPTLNLTATEEDRVDINGNMPDKMMRFTEEASILKKFNQHSSRILHSVMYVHVISPQIWPHCSSILPNVSPLQQTQARQPAQHLISRNIRSPNGRPGARARRHPHSTRPRLARGLATCRSPQHLGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.11
12 0.12
13 0.14
14 0.19
15 0.21
16 0.25
17 0.26
18 0.28
19 0.35
20 0.35
21 0.34
22 0.34
23 0.34
24 0.27
25 0.26
26 0.25
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.17
49 0.17
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.14
64 0.15
65 0.18
66 0.23
67 0.25
68 0.22
69 0.26
70 0.29
71 0.27
72 0.27
73 0.26
74 0.3
75 0.35
76 0.36
77 0.34
78 0.33
79 0.34
80 0.33
81 0.31
82 0.26
83 0.22
84 0.24
85 0.22
86 0.23
87 0.22
88 0.24
89 0.25
90 0.2
91 0.17
92 0.15
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.11
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.2
116 0.2
117 0.21
118 0.22
119 0.24
120 0.25
121 0.23
122 0.22
123 0.17
124 0.19
125 0.17
126 0.16
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.17
140 0.19
141 0.2
142 0.22
143 0.23
144 0.23
145 0.24
146 0.24
147 0.22
148 0.21
149 0.22
150 0.2
151 0.19
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.19
191 0.24
192 0.23
193 0.26
194 0.29
195 0.29
196 0.34
197 0.41
198 0.46
199 0.44
200 0.47
201 0.46
202 0.46
203 0.46
204 0.45
205 0.42
206 0.32
207 0.29
208 0.31
209 0.3
210 0.29
211 0.27
212 0.29
213 0.24
214 0.23
215 0.22
216 0.2
217 0.2
218 0.17
219 0.18
220 0.14
221 0.17
222 0.19
223 0.2
224 0.18
225 0.22
226 0.26
227 0.26
228 0.26
229 0.24
230 0.25
231 0.29
232 0.3
233 0.29
234 0.33
235 0.4
236 0.44
237 0.46
238 0.47
239 0.53
240 0.55
241 0.53
242 0.52
243 0.5
244 0.48
245 0.44
246 0.43
247 0.36
248 0.36
249 0.37
250 0.3
251 0.23
252 0.21
253 0.21
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.16
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.1
269 0.11
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.12
274 0.16
275 0.18
276 0.22
277 0.26
278 0.22
279 0.22
280 0.24
281 0.24
282 0.23
283 0.2
284 0.21
285 0.18
286 0.18
287 0.2
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.2
292 0.19
293 0.23
294 0.24
295 0.25
296 0.26
297 0.3
298 0.27
299 0.26
300 0.24
301 0.19
302 0.2
303 0.18
304 0.18
305 0.14
306 0.12
307 0.13
308 0.12
309 0.12
310 0.09
311 0.08
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.09
347 0.12
348 0.14
349 0.16
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.16
355 0.13
356 0.16
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.13
368 0.16
369 0.17
370 0.18
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.11
377 0.12
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.17
385 0.15
386 0.14
387 0.15
388 0.16
389 0.2
390 0.22
391 0.22
392 0.23
393 0.25
394 0.23
395 0.23
396 0.27
397 0.26
398 0.32
399 0.36
400 0.38
401 0.41
402 0.46
403 0.5
404 0.48
405 0.46
406 0.36
407 0.32
408 0.29
409 0.24
410 0.22
411 0.16
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.15
416 0.15
417 0.2
418 0.2
419 0.21
420 0.23
421 0.23
422 0.23
423 0.24
424 0.23
425 0.27
426 0.3
427 0.29
428 0.29
429 0.3
430 0.31
431 0.31
432 0.3
433 0.28
434 0.27
435 0.28
436 0.34
437 0.41
438 0.41
439 0.41
440 0.44
441 0.46
442 0.44
443 0.47
444 0.43
445 0.41
446 0.48
447 0.51
448 0.54
449 0.51
450 0.52
451 0.53
452 0.54
453 0.57
454 0.57
455 0.55
456 0.53
457 0.58
458 0.64
459 0.66
460 0.71
461 0.67
462 0.68
463 0.76
464 0.79
465 0.79
466 0.8
467 0.82
468 0.82
469 0.84
470 0.82
471 0.78
472 0.75
473 0.72
474 0.68
475 0.67
476 0.61
477 0.57
478 0.54
479 0.51
480 0.53