Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2HM25

Protein Details
Accession A0A1Y2HM25    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-433DEANRIRKEKELRVRRERREKRRAEVMEMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
409-427RIRKEKELRVRRERREKRR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 9.166, nucl 7, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
CDD cd02869  PseudoU_synth_RluA_like  
Amino Acid Sequences MDATQINTCSTSDPAQPVPPSMASMASVPCNASTTLAPITANSDSLAPSAPLTPSISPALVYPLVKAGPLPIASHSFSFRKPNWPATTPDLDRTIDVLYHDAHFFIISKPHNFLIDGDEWSVQEFLQRTYPQYPLFHLIHQIDYATSGIMVLGLEKKATGRAGNLFQERWVRKEYVAVVRGWIEQDEVRVKSLIGYEEGHEIRMSVTEDPTKGKHAESIIHVRRRGYLHPPASSGLLSSTSETIEPGTFDSIPVTLVHLNLLTGRRHQLRIHLASIGHPIVGDPLYEATPPAGTIPQDAWPWTSSCNPDHPTQPRMLLHSHYILLPLHRGRTRSTGRFFDFDLAVRSPAPFVDWVGCRSCHEAPAAHKGPCSEADGCDVQGVACGNIDQWEREQRELAERDAVEDEANRIRKEKELRVRRERREKRRAEVMEMLAKEGKVVTTAETTGDGKATVNH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.3
7 0.28
8 0.24
9 0.22
10 0.17
11 0.18
12 0.18
13 0.16
14 0.17
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.14
26 0.18
27 0.17
28 0.17
29 0.14
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.18
47 0.18
48 0.18
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.14
59 0.18
60 0.2
61 0.21
62 0.24
63 0.23
64 0.25
65 0.32
66 0.32
67 0.38
68 0.42
69 0.5
70 0.52
71 0.53
72 0.55
73 0.53
74 0.59
75 0.52
76 0.5
77 0.44
78 0.38
79 0.35
80 0.32
81 0.26
82 0.18
83 0.16
84 0.14
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.22
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.16
114 0.17
115 0.2
116 0.22
117 0.26
118 0.27
119 0.27
120 0.28
121 0.29
122 0.29
123 0.26
124 0.29
125 0.26
126 0.24
127 0.23
128 0.2
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.14
149 0.18
150 0.23
151 0.25
152 0.23
153 0.25
154 0.32
155 0.31
156 0.3
157 0.3
158 0.26
159 0.24
160 0.28
161 0.3
162 0.29
163 0.31
164 0.28
165 0.26
166 0.25
167 0.26
168 0.22
169 0.17
170 0.11
171 0.09
172 0.11
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.17
204 0.19
205 0.28
206 0.32
207 0.35
208 0.36
209 0.34
210 0.36
211 0.36
212 0.36
213 0.32
214 0.34
215 0.33
216 0.33
217 0.34
218 0.31
219 0.29
220 0.26
221 0.2
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.08
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.16
252 0.18
253 0.21
254 0.22
255 0.27
256 0.32
257 0.35
258 0.34
259 0.32
260 0.29
261 0.28
262 0.3
263 0.23
264 0.15
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.17
291 0.18
292 0.19
293 0.25
294 0.26
295 0.28
296 0.35
297 0.37
298 0.37
299 0.36
300 0.39
301 0.34
302 0.34
303 0.34
304 0.28
305 0.27
306 0.26
307 0.24
308 0.19
309 0.2
310 0.17
311 0.16
312 0.19
313 0.18
314 0.21
315 0.23
316 0.24
317 0.25
318 0.34
319 0.41
320 0.44
321 0.48
322 0.49
323 0.5
324 0.5
325 0.48
326 0.43
327 0.36
328 0.29
329 0.28
330 0.22
331 0.19
332 0.18
333 0.17
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.09
338 0.09
339 0.14
340 0.15
341 0.17
342 0.2
343 0.21
344 0.21
345 0.26
346 0.26
347 0.23
348 0.23
349 0.25
350 0.26
351 0.35
352 0.38
353 0.34
354 0.34
355 0.33
356 0.33
357 0.31
358 0.32
359 0.23
360 0.2
361 0.23
362 0.23
363 0.23
364 0.2
365 0.18
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.15
377 0.24
378 0.27
379 0.28
380 0.31
381 0.29
382 0.37
383 0.38
384 0.36
385 0.34
386 0.31
387 0.32
388 0.31
389 0.29
390 0.21
391 0.19
392 0.21
393 0.22
394 0.26
395 0.24
396 0.26
397 0.27
398 0.34
399 0.41
400 0.48
401 0.51
402 0.58
403 0.67
404 0.76
405 0.85
406 0.88
407 0.91
408 0.92
409 0.92
410 0.93
411 0.91
412 0.88
413 0.88
414 0.82
415 0.78
416 0.75
417 0.7
418 0.67
419 0.59
420 0.54
421 0.45
422 0.4
423 0.33
424 0.26
425 0.2
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.17
433 0.18
434 0.17
435 0.17
436 0.15